Panjang Non-coding Sequencing-Illumina
Keunggulan Service
●Analisis gabungan mRNA sareng lncRNA: ku ngagabungkeun kuantitas transkrip mRNA sareng ulikan lncRNA sareng udaganana, mungkin waé pikeun meunangkeun gambaran anu jero ngeunaan mékanisme pangaturan anu aya dina réspon sélular.
●Kaahlian éksténsif: Kami parantos ngolah langkung ti 230,000 conto, ngalangkungan rupa-rupa conto sareng tujuan proyék. Kami mawa kabeungharan kaahlian pikeun unggal proyék.
●Analisis gabungan mRNA sareng lncRNA: Urang ngagabungkeun kuantifikasi transkrip mRNA jeung ulikan ngeunaan lncRNA jeung udagan maranéhanana, sahingga mungkin pikeun meunangkeun gambaran di-jero mékanisme pangaturan kaayaan respon sélular.
●Kontrol Kualitas anu ketat: Urang nerapkeun titik kontrol inti dina sagala tahapan, ti persiapan sampel pikeun persiapan perpustakaan, sequencing na bioinformatics. Pemantauan taliti kami mastikeun pangiriman hasil kualitas luhur anu konsisten.
●Anotasi Komprehensif: Urang ngagunakeun sababaraha basis data pikeun fungsionalitas annotate gén Differentially Expressed (DEGs) jeung ngalakukeun analisa pengayaan pakait. Pendekatan komprehensif ieu masihan wawasan kana prosés sélular sareng molekular anu aya dina réspon transkriptom, mastikeun anjeun nampi sadaya inpormasi anu mungkin ngeunaan data ékspérimén anjeun.
●Rojongan Post-Penjualan: Urang ngarti kumaha pentingna hadir, éta naha komitmen urang manjangan saluareun parantosan proyék kalawan 3-bulan periode layanan sanggeus-diobral. Salila ieu, kami nawiskeun nurutan proyék, bantuan ngungkulan, sareng sesi Q&A pikeun ngajawab patarosan naon waé anu aya hubunganana sareng hasil.
Syarat Sampel sareng Pangiriman
| Perpustakaan | Platform | data dianjurkeun | Data QC |
| rRNA depleted perpustakaan arah | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nukléotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kasucian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260 / 230 = 0,5-2,5 Kawates atanapi henteu aya kontaminasi protéin atanapi DNA anu dipidangkeun dina gél. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; kawates atawa euweuh élévasi dasar |
● Tutuwuhan:
Akar, Batang atanapi Petal: 450 mg
Daun atawa Siki: 300 mg
Buah: 1,2 g
● Sasatoan:
Jantung atanapi peujit: 450 mg
Viscera atanapi Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atawa Kulit: 1.5g
● Artropoda:
Serangga: 9 g
Crustacea: 450 mg
● Sakabeh getih:2 pipah
● Sél: 106 sél
● Sérum jeung Plasma: 6 ml
Disarankeun Pangiriman Sampel
Wadahna: 2 ml centrifuge tube (Timah foil teu dianjurkeun)
Sampel panyiri: Grup + ulangan misalna A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pangiriman:
1. Garing-és: Sampel kudu dipak dina kantong jeung dikubur di garing-és.
2. tabung RNAstable: sampel RNA bisa garing dina tube stabilisasi RNA (misalna RNAstable®) jeung shipped dina suhu kamar.
Aliran Gawé Palayanan
Desain ékspérimén
pangiriman sampel
ékstraksi RNA
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
Bioinformatika
- Data atah
- Data QC
- alignment génom
- Struktur gen (Splicing Alternatif, optimasi struktur gén jeung prediksi gén novél)
- Kuantifikasi éksprési gén
- Analisis éksprési diferensial
- Anotasi DEG sareng pengayaan + Diferensial dikedalkeun gén target lncRNA
- Idéntifikasi Transkrip
- Idéntifikasi lncRNA (konservasi lncRNA sareng lncRNA dikenal)
- lncRNA target gén prediksi
- lncRNA éksprési kuantifikasi
- Analisis gabungan sareng data mRNA
Analisis éksprési gén diferensial (DEGs).
Kuantitas éksprési lncRNA - clustering
Pengayaan gen target lncRNA
Analisis posisi mRNA sareng lncRNA gabungan - Plot Circos (lingkaran tengah nyaéta mRNA sareng bunderan jero nyaéta lncRNA)
Jelajahi kamajuan anu difasilitasi ku jasa equencing lncRNA BMKGene ngalangkungan koleksi publikasi anu dikurasi.
Ji, H. et al. (2020) 'Idéntifikasi, prediksi fungsional, sareng verifikasi lncRNA konci tina lncRNA anu aya hubunganana sareng setrés tiis dina ati beurit',Laporan ilmiah2020 10:1, 10(1), kaca 1–14. Doi: 10.1038 / s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analisis Transkripsi Integratif Ngungkabkeun Mékanisme Imun pikeun Galur Ikan Mas Umum anu Tahan CyHV-3',Frontiers dina Imunologi, 12, kc. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prioritas Berbasis Integrasi Multi-Omics tina Jaringan Regulasi RNA endogen anu bersaing dina Kanker Paru-paru Sél Leutik: Karakteristik Molekul sareng Calon Narkoba',Frontiers dina Onkologi, 12, kc. 904865. doi: 10.3389 / FONC.2022.904865 / BIBTEX.
Xiao, L. dkk. (2020) 'Dissection génétik jaringan coexpression gén dina dasar fotosintésis di Populus',Jurnal Biotéhnologi Tutuwuhan, 18(4), kaca 1015–1026. doi: 10.1111 / PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Jaringan Regulasi Global pikeun Ekspresi Gén Disrégulasi sareng Sinyal Métabolik Abnormal dina Sél Imun dina Lingkungan Mikro Kasakit Graves sareng Tiroiditis Hashimoto',Frontiers dina Imunologi, 13, kc. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
