mRNA-seq (NGS) - De novo
Sekuensing mRNA ngamungkinkeun profiling sadaya transkrip mRNA dina sél dina kaayaan anu khusus sareng mangrupikeun téknologi anu seueur dianggo dina sababaraha widang panalungtikan. Pipa sekuensing BMKCloud De novo mRNA-seq dirancang pikeun nganalisis perpustakaan sekuensing anu diperkaya poli-A nalika teu aya génom rujukan anu sayogi. Pipa dimimitian ku kontrol kualitas, dituturkeun kuanyarperakitan transkrip sareng pamilihan set unigen. Analisis struktur unigen ngaduga runtuyan kode (CDS) sareng pangulangan runtuyan basajan (SSR). Salajengna, analisis éksprési diferensial mendakan gén anu diekspresikeun sacara diferensial (DEG) di antara kaayaan anu diuji, dituturkeun ku anotasi fungsional sareng pangayaan DEG pikeun ngekstrak wawasan biologis.
Bioinformatika