-
Analisis Asosiasi Génom-lega
Studi asosiasi genom-lebar (GWAS) tujuanana pikeun ngaidentipikasi varian genetik (genotip) anu aya hubunganana sareng sipat khusus (fenotip).Ulikan GWAS nalungtik spidol genetik meuntas genom sajumlah ageung individu sareng ngaramal asosiasi genotip-fenotip ku analisa statistik dina tingkat populasi.Geus loba dilarapkeun dina panalungtikan ngeunaan kasakit manusa jeung pertambangan gén fungsional dina sipat kompléks sato atawa tutuwuhan.
-
Tutuwuhan / Sasatoan sakabeh Génom Sequencing
Urutan ulang génom sakabeh, ogé katelah WGS, ngamungkinkeun pikeun nembongkeun mutasi umum jeung langka dina sakabéh génom kaasup Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), jeung Copy Number Variation (CNV). ).SV ngabentuk bagian gedé tina basa variasi ti SNPs sarta boga dampak gede dina génom, nu boga pangaruh signifikan dina organisme hirup.Resequencing lila-dibaca ngamungkinkeun pikeun idéntifikasi leuwih tepat fragmen badag sarta variasi pajeulit sabab maca panjang ngajadikeun leuwih gampang kromosom nyebrang ngaliwatan wewengkon pajeulit kayaning ulang tandem, GC / AT-euyeub wewengkon, sarta wewengkon hyper-variabel.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Genetika évolusionér
Genetika évolusionér nyaéta layanan sequencing dipak dirancang pikeun nyadiakeun interpretasi komprehensif on évolusionér informasi bahan dibikeun dumasar kana variasi genetik, kaasup SNPs, InDels, SVs na CNVs.Eta nyadiakeun sagala analisis fundamental diperlukeun pikeun ngajéntrékeun parobahan évolusionér jeung fitur genetik populasi, kayaning struktur populasi, diversity genetik, hubungan filogén, jsb Ieu ogé ngandung studi on aliran gén, nu empowers estimasi ukuran populasi éféktif, divergence waktos.
-
Génomics komparatif
Génom komparatif sacara harfiah hartina ngabandingkeun runtuyan génom lengkep jeung struktur spésiés béda.Disiplin ieu boga tujuan pikeun nembongkeun évolusi spésiés, fungsi gén, mékanisme pangaturan gén dina tingkat génom ku cara ngaidentipikasi struktur runtuyan jeung elemen anu dilestarikan atawa dibédakeun sakuliah spésiés béda.Ulikan génomics komparatif has ngawengku analisa dina kulawarga gén, ngembangkeun évolusionér, duplikasi génom sakabeh, tekanan selektif, jsb.
-
Hi-C dumasar Génom Majelis
Hi-C nyaéta métode anu dirancang pikeun nangkep konfigurasi kromosom ku cara ngagabungkeun probing interaksi dumasar-deukeut jeung sequencing throughput tinggi.Inténsitas interaksi ieu dipercaya aya hubunganana négatip sareng jarak fisik dina kromosom.Ku alatan éta, data Hi-C bisa pituduh clustering, susunan jeung orienting runtuyan dirakit dina draf génom sarta anchoring maranéhanana kana sababaraha kromosom.Téknologi ieu nguatkeun rakitan génom tingkat kromosom dina henteuna peta genetik dumasar populasi.Unggal génom tunggal peryogi Hi-C.
Platform: Platform Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Tutuwuhan / Sato De Novo Génom Sequencing
De Novosequencing nujul kana pangwangunan sakabéh génom spésiés ngagunakeun téknologi sequencing, misalna PacBio, Nanopore, NGS, jsb, dina henteuna génom rujukan.Perbaikan anu luar biasa dina panjang baca téknologi sequencing generasi katilu geus mawa kasempetan anyar dina assembling génom kompléks, kayaning jalma kalawan heterozygosity tinggi, rasio luhur wewengkon repetitive, polyploids, jsb Kalawan panjang dibaca dina tingkat puluhan kilobases, sequencing ieu maca ngaktifkeun. ngarengsekeun elemen repetitive, wewengkon kalawan eusi GC abnormal jeung wewengkon kacida kompleks lianna.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Platform Illumina NovaSeq
-
Manusa Sakabeh Exome Sequencing
Sequencing exome sakabeh (WES) dianggap salaku strategi sekuen biaya-éféktif pikeun ngaidentipikasi mutasi anu nyababkeun panyakit.Sanajan ékson ngan nyokot kira-kira 1,7% tina sakabéh génom, éta ngagambarkeun profil fungsi protéin total langsung.Dina génom manusa, geus dilaporkeun yén leuwih ti 85% mutasi patali kasakit lumangsung di wewengkon coding protéin.
BMKGENE nawiskeun jasa sequencing exome manusa anu komprehensif sareng fleksibel kalayan strategi nangkep exon anu béda-béda anu sayogi pikeun nyumponan sababaraha tujuan panalungtikan.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Spésifik-Locus Amplified Fragmén Sequencing (SLAF-Seq)
Genotyping-throughput tinggi, utamana dina populasi skala badag, mangrupakeun hambalan fundamental dina studi pakaitna genetik, nu nyadiakeun dasar genetik pikeun kapanggihna gén fungsional, analisis évolusionér, jsb Gantina jero sakabeh genom ulang sequencing, ngurangan répréséntasi génom sequencing (RRGS). ) diwanohkeun pikeun ngaleutikan biaya urutan per sampel, bari ngajaga efisiensi lumrah dina kapanggihna spidol genetik.Ieu ilaharna dihontal ku extracting fragmen pangwatesan dina rentang ukuran dibikeun, nu ngaranna ngurangan répréséntasi perpustakaan (RRL).Spésifik-locus amplified fragmén sequencing (SLAF-Seq) mangrupakeun strategi timer dimekarkeun pikeun genotyping SNP nganggo atanapi tanpa génom rujukan.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
