-
Pangurutan mRNA panjangna-Nanopore
Sequencing RNA mangrupikeun alat anu teu ternilai pikeun analisis transkriptom komprehensif.Mamang, sekuen bacaan pondok tradisional ngahontal seueur pangembangan penting di dieu.Sanajan kitu, mindeng sapatemon watesan dina full-panjangna isoform idéntifikasi, kuantifikasi, bias PCR.
Sequencing nanopore ngabedakeun diri ti platform sequencing séjén, nu nukléotida dibaca langsung tanpa sintésis DNA jeung ngahasilkeun dibaca panjang dina puluhan kilobase.Ieu empowers langsung maca-kaluar nyebrang transkrip full-panjangna jeung tackling tantangan dina studi isoform-tingkat.
Platform:Nanopore PromethION
Perpustakaan:cDNA-PCR
-
De novo Full-panjangna Transcriptome sequencing -PacBio
De novosequencing transcriptome full-panjangna, ogé katelahDe novoIso-Seq nyandak kauntungan tina PacBio sequencer dina panjang dibaca, anu ngamungkinkeun sequencing molekul cDNA full-length tanpa jeda.Ieu lengkep ngahindarkeun sagala kasalahan anu dibangkitkeun dina léngkah-léngkah rakitan transkrip sareng ngawangun set unigene kalayan resolusi tingkat isoform.Set unigene ieu nyayogikeun inpormasi genetik anu kuat salaku "genom rujukan" dina tingkat transkriptom.Sajaba ti éta, ngagabungkeun jeung data urutan generasi saterusna, layanan ieu empowers hiji kuantitas akurat ekspresi isoform-tingkat.
Platform: PacBio Sequel IIPerpustakaan: perpustakaan bel SMRT -
Sekuensing mRNA eukariot-Illumina
Urutan mRNA ngamungkinkeun profil sadaya mRNA anu ditranskripsi tina sél dina kaayaan anu khusus.Téknologi anu kuat pikeun nembongkeun profil ekspresi gen, struktur gén sareng mékanisme molekular tina prosés biologis anu tangtu.Nepi ka ayeuna, sequencing mRNA parantos seueur dianggo dina panalungtikan dasar, diagnostik klinis, pamekaran ubar, jsb.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Non-Referensi dumasar mRNA sequencing-Illumina
Pangurutan mRNA ngadopsi téknik pangurutan generasi saterusna (NGS) pikeun nangkep RNA (mRNA) utusan tina bentuk Eukariota dina période husus anu diaktipkeun ku sababaraha pungsi husus.Transkrip pangpanjangna disambung disebut 'Unigene' sarta dipaké salaku runtuyan rujukan pikeun analisis saterusna, nu mangrupakeun sarana éféktif pikeun nalungtik mékanisme molekular jeung jaringan pangaturan spésiés tanpa rujukan.
Saatos assembly data transcriptome sarta annotation fungsi unigene
(1) Analisis SNP, analisis SSR, prediksi CDS jeung struktur gén bakal preformed.
(2) Kuantitas éksprési unigén dina unggal sampel bakal dilaksanakeun.
(3) Unigenes anu dibédakeun antara sampel (atawa grup) bakal kapanggih dumasar kana ekspresi unigén.
(4) Klastering, anotasi fungsional sareng analisis pengayaan unigenes anu dikedalkeun sacara béda bakal dilakukeun
-
Long non-coding sequencing-Illumina
RNA non-coding panjang (lncRNAs) mangrupikeun jinis molekul RNA anu panjangna langkung ti 200 nt, anu dicirikeun ku poténsi pengkodean anu rendah pisan.LncRNA, salaku anggota konci dina non-coding RNAs, utamana kapanggih dina inti jeung plasma.Kamekaran dina téknologi pangurutan sareng bioinformtik ngamungkinkeun idéntifikasi sababaraha lncRNAs novel sareng ngahubungkeun anu ngagaduhan fungsi biologis.Bukti akumulatif nunjukkeun yén lncRNA loba kalibet dina régulasi épigénétik, régulasi transkripsi sareng régulasi pasca-transkripsi.
-
Sequencing RNA leutik-Illumina
RNA leutik ngarujuk kana kelas molekul RNA non-coding anu panjangna biasana kirang ti 200nt, kalebet RNA mikro (miRNA), RNA interferensi leutik (siRNA), sareng RNA anu berinteraksi piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) nyaéta kelas RNA leutik endogenous kalayan panjang kira-kira 20-24nt, anu maénkeun rupa-rupa peran pangaturan penting dina sél.miRNA aub dina loba prosés kahirupan nu nembongkeun jaringan - spésifik jeung panggung - éksprési husus sarta pohara dilestarikan dina spésiés béda.
-
circRNA sequencing-Illumina
Sequencing transcriptome sakabeh dirancang pikeun profil sagala jinis molekul RNA, kaasup coding (mRNA) jeung RNA non-coding (kaasup lncRNA, circRNA jeung miRNA) nu ditranskripsi ku sél husus dina waktu nu tangtu.Sequencing transcriptome sakabeh, ogé katelah "sequencing RNA total" boga tujuan pikeun nembongkeun jaringan pangaturan komprehensif di tingkat transcriptome.Ngamangpaatkeun téhnologi NGS, runtuyan sakabéh produk transcriptome sadia pikeun analisis ceRNA jeung analisis RNA gabungan, nu nyadiakeun hambalan kahiji nuju characterization fungsional.Nembongkeun jaringan pangaturan circRNA-miRNA-mRNA dumasar ceRNA.
-
Sequencing transcriptome sakabeh - Illumina
Sequencing transcriptome sakabeh dirancang pikeun profil sagala jinis molekul RNA, kaasup coding (mRNA) jeung RNA non-coding (kaasup lncRNA, circRNA jeung miRNA) nu ditranskripsi ku sél husus dina waktu nu tangtu.Sequencing transcriptome sakabeh, ogé katelah "sequencing RNA total" boga tujuan pikeun nembongkeun jaringan pangaturan komprehensif di tingkat transcriptome.Ngamangpaatkeun téhnologi NGS, runtuyan sakabéh produk transcriptome sadia pikeun analisis ceRNA jeung analisis RNA gabungan, nu nyadiakeun hambalan kahiji nuju characterization fungsional.Nembongkeun jaringan pangaturan circRNA-miRNA-mRNA dumasar ceRNA.
-
Urutan RNA prokariot
Sequencing RNA prokariot ngagunakeun next generation sequencing (NGS) pikeun nembongkeun ayana jeung kuantitas RNA dina momen nu tangtu, ku cara nganalisis parobahan transkriptom sélular.Sequencing RNA prokariot perusahaan kami, khususna tujuanana pikeun prokariot sareng génom rujukan, nyayogikeun profil transkriptom, analisis struktur gen, jsb. Éta parantos dianggo sacara lega pikeun panalungtikan sains dasar, panalungtikan sareng pamekaran obat, sareng seueur deui.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranscriptome Sequencing
Urutan metatranscriptome ngenalkeun ekspresi gen mikroba (duanana eukariot sareng prokariot) dina lingkungan alam (nyaéta taneuh, cai, laut, tai, sareng usus.). spésiés, analisis pengayaan fungsional gén anu dikedalkeun béda, sareng seueur deui.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
