Sekuensing bisulfit génom lengkep (WGBS)
Téhnik ieu, dumasar kana perlakuan bisulfit DNA pikeun ngainduksi konvérsi sitosin anu teu termetilasi jadi urasil (C ka U), bari ngantepkeun sitosin anu termetilasi teu robah, nangtung salaku metodologi standar emas pikeun éksplorasi metilasi DNA anu jero, khususna posisi kalima dina sitosin (5-mC), régulator penting éksprési gén sareng aktivitas sélular.
Téhnik ieu nawiskeun résolusi basa tunggal, anu ngamungkinkeun para panalungtik pikeun nalungtik sacara komprehensif métilom sareng ngungkabkeun pola métilasi anu teu normal dina sampel. Ku ngagunakeun WGBS, para ilmuwan tiasa kéngingkeun wawasan anu teu aya tandinganna kana bentang métilasi sakumna génom, nyayogikeun pamahaman anu lengkep ngeunaan mékanisme épigenetik anu mendasari rupa-rupa prosés biologis sareng panyakit.
Fitur Layanan
● Sekuensing dina Illumina NovaSeq.
● Meryogikeun génom rujukan.
● DNA Lambda ditambahkeun pikeun ngawas efisiensi konvérsi bisulfit.
Kauntungan Layanan
●Standar Emas pikeun Panalungtikan Metilasi DNATéhnologi anu asak ieu ngagaduhan akurasi anu luhur sareng réproduktifitas anu saé.
●Cakupan Lega sareng Résolusi Basa Tunggal:Deteksi situs metilasi aya dina tingkat sakumna génom.
●Platform Lengkep:Kami nyayogikeun layanan hiji eureun ti mimiti pamrosésan sampel, pangwangunan perpustakaan, sekuensing dugi ka analisis bioinformatika.
●Kaahlian anu legaKami gaduh rupa-rupa proyék anu réngsé dina rupa-rupa spésiés. BMKGENE ngagaduhan pangalaman langkung ti dasawarsa, tim analisis anu terampil, eusi anu komprehensif, sareng dukungan pasca-penjualan anu saé.
●Kamungkinan pikeun Gabung sareng Analisis TranskriptomikNgamungkinkeun analisis WGBS anu terintegrasi sareng data omics anu sanés sapertos RNA-seq.
Spésifikasi Sampel
| Perpustakaan | Strategi Urutan | Kaluaran data anu disarankeun | Kontrol kualitas |
| Diubaran ku bisulfit | Illumina PE150 | 30x jerona | Q30 ≥ 85% Konvérsi bisulfit > 99% |
Sarat Conto
| Konsentrasi (ng/µL) | Jumlah total (µg) | Sarat tambahan | |
| DNA génomik | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Degradasi atanapi kontaminasi terbatas |
Aliran Padamelan Layanan
Pangiriman conto
Ékstraksi DNA
Pangwangunan perpustakaan
Urutan
Analisis data
Pangiriman data
Layanan ieu ngawengku analisis ieu:
● Kontrol kualitas sekuensing atah;
● Pemetaan kana génom rujukan;
● Deteksi basa anu dimetilasi 5mC;
● Analisis distribusi metilasi sareng anotasi;
● Analisis Daérah Metilasi Diferensial (DMR);
● Anotasi fungsional gén anu aya hubunganana sareng DMR.
Deteksi metilasi 5mC: jinis situs anu dimetilasi
Peta metilasi. Distribusi génom metilasi 5mC
Anotasi daérah anu loba métilasina
Daérah anu Dimétilasi sacara Diferensial: gén anu aya patalina
Daérah anu Dimétilasi sacara Diferensial: anotasi gén anu aya hubunganana (Ontologi Gén)
Jelajah kamajuan panalungtikan anu difasilitasi ku layanan sekuensing bisulfit sakumna génom BMKGene ngalangkungan koleksi publikasi anu dikuratori.
Fan, Y. et al. (2020) 'Analisis profil metilasi DNA salami kamekaran otot rangka domba nganggo sekuensing bisulfit sakumna génom',BMC Génomics, 21(1), kaca 1–15. doi: 10.1186 / S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Gangguan métilasi asam deoksiribonukleat anyar dina pagawé anu kakeunaan vinil klorida',Toksikologi sareng Kaséhatan Industri, 38(7), kaca 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Hubungan antara metilasi génom, tingkat RNA non-koding, mRNA sareng metabolit dina buah tomat anu asak',Jurnal Tutuwuhan, 103(3), kaca 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
