Sequencing transcriptome sakabeh - Illumina
Fitur
● Perpustakaan ganda pikeun ngaruntuykeun transkriptom lengkep: deplesi rRNA dituturkeun ku persiapan perpustakaan PE150 sareng pilihan ukuran dituturkeun ku persiapan perpustakaan SE50
● Analisis bioinformatika lengkep mRNA, lncRNA, circRNA sareng miRNA dina laporan bioinformatika anu misah
● Analisis gabungan sadaya ekspresi RNA dina laporan gabungan, kalebet analisis jaringan ceRNA.
Keunggulan Service
●Analisis jero jaringan pangaturan: Analisis jaringan ceRNA diaktipkeun ku urutan gabungan mRNA, lncRNA, circRNA sareng miRNA sareng ku alur kerja bioinformatik anu lengkep.
●Anotasi Komprehensif: kami nganggo sababaraha basis data pikeun sacara fungsional annotate Gén Differentially Expressed (DEGs) jeung ngalakukeun analisis pengayaan pakait, nyadiakeun wawasan dina prosés sélular jeung molekular kaayaan respon transcriptome.
●Kaahlian éksténsif: kalawan catetan lagu suksés nutup leuwih 2000 proyék transcriptome dina sagala rupa domain panalungtikan, tim kami brings kabeungharan pangalaman ka unggal proyék.
●Kontrol Kualitas anu ketat: urang nerapkeun titik kontrol inti dina sagala tahapan, ti sampel jeung persiapan perpustakaan nepi ka sequencing na bioinformatics.Ngawaskeun taliti ieu mastikeun pangiriman hasil kualitas luhur sacara konsisten.
● Anotasi Komprehensif: kami nganggo sababaraha basis data pikeun sacara fungsional annotate Gén Differentially Expressed (DEGs) jeung ngalakukeun analisis pengayaan pakait, nyadiakeun wawasan dina prosés sélular jeung molekular kaayaan respon transcriptome.
●Rojongan Post-Penjualan: Komitmen kami ngalegaan saluareun parantosan proyék kalayan periode jasa saatos-jualan 3-bulan.Salila ieu, kami nawiskeun turutan proyék, bantosan ngungkulan, sareng sesi Q&A pikeun ngajawab patarosan naon waé anu aya hubunganana sareng hasil.
Syarat Sampel sareng Pangiriman
| Perpustakaan | Strategi sequencing | Data disarankeun | Kontrol kualitas |
| rRNA habis | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Ukuran dipilih | Illumina SE50 | 10-20M dibaca |
Syarat Sampel:
Nukléotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kasucian | Integritas |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260 / 230 = 0,5-2,5 Kawates atanapi henteu aya kontaminasi protéin atanapi DNA anu dipidangkeun dina gél. | Tutuwuhan: RIN≥6.5 Sato: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; kawates atawa euweuh élévasi dasar |
Disarankeun Pangiriman Sampel
Wadahna:
2 ml centrifuge tube (Timah foil teu dianjurkeun)
Sampel panyiri: Grup + ulangan misalna A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Pangiriman:
1.Dry-és: Sampel kudu dipak dina kantong jeung dikubur di garing-és.
2.RNA tabung stabil: sampel RNA bisa garing dina tube stabilisasi RNA (misalna RNAstable®) jeung shipped dina suhu kamar.
Aliran Gawé Palayanan
Desain ékspérimén
pangiriman sampel
ékstraksi RNA
Pangwangunan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
jasa saatos-diobral
Bioinformatika
Tinjauan éksprési RNA
Gén anu diébréhkeun sacara béda
analisis ceRNA
MiRNAs dikedalkeun béda jeung RNAs patali
Ngajalajah kamajuan panalungtikan anu difasilitasi ku jasa urutan transkriptom sadayana BMKGene ngaliwatan kumpulan publikasi anu dikurasi.
Dai, Y. et al.(2022) 'Propil éksprési komprehensif mRNAs, lncRNAs na miRNAs dina kasakit Kashin-Beck dicirikeun ku RNA-sequencing', Molecular Omics, 18 (2), pp. 154-166.Doi: 10.1039 / D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Analisis transkriptom panjang lengkep ngeunaan résistansi tiis Apis cerana di Gunung Changbai salami usum tiris.', Gene, 830, kaca 146503-146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Multi-Omics Integrasi-Dumasar Prioritization of Competing Endogenous RNA Regulasi Jaringan dina Kanker Paru-paru Sél Leutik: Karakteristik Molekul jeung Calon Narkoba', Frontiers on Onkologi, 12, p.904865. doi: 10.3389 / FONC.2022.904865 / BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'Analisis terpadu tina profil éksprési lncRNA / circRNA-miRNA-mRNA ngungkabkeun wawasan novel kana mékanisme poténsial pikeun ngaréspon nematoda akar-simpul dina kacang', BMC Genomics, 23 (1), pp. 1-12.doi: 10.1186 / S12864-022-08470-3 / GAMBAR / 7.
Yan, Z. et al.(2022) 'Sequencing RNA sakabeh-transcriptome highlights mékanisme molekular pakait sareng pangropéa kualitas postharvest dina brokoli ku irradiation LED beureum', Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
