BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome

Rumslig organisation av celler spelar en avgörande roll i olika biologiska processer, såsom immuninfiltration, embryonutveckling, etc. Spatial transkriptomsekvensering, som indikerar genuttrycksprofilering samtidigt som information om rumslig position bibehålls, har gett stora insikter i vävnadsarkitektur på transkriptomnivå.Med utvecklingen av teknik måste den ultraklara vävnadsmorfologin och den verkliga strukturella skillnaden mellan rumsligt molekylärt uttryck studeras med högre upplösning.BMKGENE tillhandahåller omfattande, one-stop rumslig transkriptomsekvenseringstjänst från prover till biologiska insikter.

Spatial transcriptomics-teknologier gav nya perspektiv i olika forskningsarenor genom att lösa genuttrycksprofil med rumsligt innehåll i heterogena prover.

Spatiellt transkriptomchip: BMKMANU S1000

Plattform: Illumina NovaSeq Plattform


Servicedetaljer

Bioinformatik

Demoresultat

BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome Technical Scheme

S1000.

Fördelar med BMKMANU S1000

1) Subcellulär upplösning: Varje fångstområde innehöll >2 miljoner rumsliga streckkodade fläckar med en diameter på 2,5 µm och ett avstånd på 5 µm mellan fläckcentra, vilket möjliggör rumslig transkriptomanalys med subcellulär upplösning (5 µm).

s1000 (1)

2) Flernivåupplösningsanalys: Flexibel multinivåanalys från 100 μm till 5 μm för att lösa olika vävnadsfunktioner med optimal upplösning.

s1000 (2)

3) Omfattande transkriptomprofilering: Transkript som fångats från hela vävnadsglaset kan analyseras utan begränsning av antalet målgener och målområde.

s1000 (3)

Servicespecifikationer

Bibliotek

Sekvenseringsstrategi

Datautgång rekommenderas

S1000 cDNA-bibliotek

BMKMANU S1000-Illumina PE150

60 Gb/prov

Exempel på krav

Prov

siffra

Storlek

RNA-kvalitet

OCT inbäddat vävnadsblock

2-3 block/prov

Cirka.6,8x6,8x6,8 mm3

RIN≥7

För mer information om vägledning för provförberedelser och servicearbetsflöde är du välkommen att prata med a

Service Arbetsflöde

Prov QC

Experimentdesign

provleverans

Provleverans

Pilotexperiment

Förexperiment

Rumslig streckkodning

Rumslig streckkodning

Biblioteksförberedelser

Byggande av bibliotek

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalys

Dataanalys

Service efter försäljning

Service efter försäljning


  • Tidigare:
  • Nästa:

  • 10x (9)

    Data som genereras av BMKMANU S1000 analyseras med programvaran "BSTMatrix", som är oberoende designad av BMKGENE, inklusive:

    1) Generering av genuttrycksmatris
    2) HE bildbehandling
    3) Kompatibel med nedströms tredjepartsprogramvara för analys
    4) Online "BSTViewer" hjälper till att få visualiseringsresultat vid olika upplösningar.

    1. Fläckklustring

    s1000 (4)

    2. Rumslig fördelning

    s1000 (5)s1000 (6)

    Nanmärkning: Upplösningnivå=13 (100 µm, vänster); 7 (50 µm, höger)

    3.Markör uttryck överflöd klustring värmekarta

    s1000 (7)

    4. Inter-sample dataanalys

    s1000 (8)

     

    få ett citat

    Skriv ditt meddelande här och skicka det till oss

    Skicka ditt meddelande till oss: