BMKCloud Logga in

Produkter

[Kopiera] Eukaryot mRNA-sekvensering-NGS

mRNA-sekvensering, en mångsidig teknik, möjliggör omfattande profilering av alla mRNA-transkript i celler under specifika förhållanden. Med sina breda tillämpningar avslöjar detta banbrytande verktyg invecklade genuttrycksprofiler, genstrukturer och molekylära mekanismer associerade med olika biologiska processer. MRNA-sekvensering, som används i stor utsträckning inom grundforskning, klinisk diagnostik och läkemedelsutveckling, erbjuder insikter i komplexiteten hos celldynamik och genetisk reglering, vilket väcker nyfikenhet kring dess potential inom olika områden.

Plattform: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

Kontakta oss

Servicedetaljer

Bioinformatik

Demoresultat

Utvalda publikationer

Drag

● Infångning av poly-mRNA före biblioteksberedning

● Valfri riktad mRNA-biblioteksberedning för att möjliggöra erhållande av strängspecifika sekvenseringsdata

● Bioinformatisk analys av genuttryck och transkriptstruktur

Fördelar

●Omfattande expertisVårt team har bearbetat över 600 000 prover på BMKgene, som spänner över olika provtyper som cellkulturer, vävnader och kroppsvätskor. Vi bidrar med en mängd erfarenhet till varje projekt och har framgångsrikt slutfört över 100 000 mRNA-Seq-projekt inom olika forskningsområden.

●Rigorös kvalitetskontrollVi implementerar centrala kontrollpunkter i alla steg, från prov- och biblioteksberedning till sekvensering och bioinformatik. Denna noggranna övervakning säkerställer leverans av resultat av genomgående hög kvalitet, vilket försäkrar dig om att ditt projekt är i pålitliga händer.

●Omfattande annoteringVi använder flera databaser för att funktionellt annotera de differentiellt uttryckta generna (DEG) och utföra motsvarande anrikningsanalyser. Denna omfattande metod ger insikter i de cellulära och molekylära processer som ligger bakom transkriptomresponsen, vilket säkerställer att du är fullt informerad om ditt projekts resultat.

●Support efter försäljningVårt engagemang sträcker sig bortom projektets slutförande med en 3-månaders eftermarknadsservice. Under denna tid erbjuder vi projektuppföljning, felsökningshjälp och frågestunder för att besvara eventuella frågor relaterade till resultaten.

Provkrav och leverans

Bibliotek

Sekvenseringsstrategi

Rekommenderade data

Kvalitetskontroll

Poly A-berikad

Illumina PE150

DNBSEQ-T7

6–10 GB

Q30≥85%

Exempelkrav:

Nukleotider:

Minimikrav för prov:

Konc. (ng/μl)

Mängd (μg)

Renhet

Integritet

Standardbibliotek

≥ 10

≥ 0,2

OD260/280=1,7–2,5

OD260/230=0,5–2,5

Begränsad eller ingen protein- eller DNA-kontaminering påvisad på gelen.

För växter: RIN≥4,0;

För djur: RIN ≥4,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begränsad eller ingen baslinjehöjd

Riktningsbibliotek

≥ 10

≥ 0,2

OD260/280=1,7–2,5

OD260/230=0,5–2,5

Begränsad eller ingen protein- eller DNA-kontaminering påvisad på gelen.

För växter: RIN≥4,0;

För djur: RIN ≥4,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begränsad eller ingen baslinjehöjd

Växter

Djur

Leddjur

Helblod

Celler

Rot, stjälk eller kronblad: 450 mg

Blad eller frö: 300 mg

Frukt: 1,2 g

Hjärta eller tarm: 300 mg

Inälvor eller hjärna: 240 mg

Muskel: 450 mg

Ben, hår eller hud: 1 g

Insekter: 6 g

Kräftdjur: 300 mg

1 rör

106 celler

Rekommenderad provleverans

Behållare: 2 ml centrifugrör (Folie rekommenderas inte)

Exempelmärkning: Gruppera+replikera t.ex. A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...

Transport:

1. Torris: Proverna måste packas i påsar och begravas i torris.

2. RNA-tabellrör: RNA-prover kan torkas i RNA-stabiliseringsrör (t.ex. RNAstable®) och transporteras i rumstemperatur.

Provkrav och leverans

Visa mer

För frågor om våra produkter eller prislista, vänligen lämna din e-postadress till oss.
Vi kommer att kontakta dig inom 24 timmar.

Förfrågan nu

Tidigare: Exosomalt mRNA/LncRNA/CircRNA-sekvensering – Illumina

Nästa: Metabolomik

Bioinformatik

Eukaryota mRNA-sekvenseringsanalys arbetsflöde

Bioinformatik

ØKvalitetskontroll av rådata

ØReferensgenomjustering

ØAnalys av transkriptstruktur

ØUttryckskvantifiering

ØDifferentiell uttrycksanalys

ØFunktionsannotering och berikning

Referensgenomjustering

Datamättnad

Provkorrelation och bedömning av biologiska replikat

Differentiellt uttryckta gener (DEG)

Funktionell annotering av DEG:er

Funktionell anrikning av DEG

Utforska de framsteg som möjliggjorts av BMKGenes eukaryota NGS mRNA-sekvenseringstjänster genom en kuraterad samling publikationer.

Huang, L. et al. (2023) 'Triklosan och triklokarban försvagar guldfiskars luktförmåga genom att begränsa igenkänning av luktämnen, störa transduktionen av luktsignaler och störa bearbetningen av luktinformation', Water Research, 233, s. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.

Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus kapar mänsklig p11 för att omdirigera svampinnehållande fagosomer till icke-nedbrytande vägar', Cell Host & Microbe, 31(3), s. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.

Jin, K. et al. (2022) 'TCP-transkriptionsfaktorer involverade i skottutveckling hos Ma-bambu (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, s. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.

Wen, X. et al. (2022) 'Chrysanthemum lavandulifoliums genom och den molekylära mekanismen bakom olika kapitulumtyper', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.

Zhang, Yujie et al. (2023) 'En kaskad-nanoreaktor för att förbättra sonodynamisk terapi vid kolorektal cancer via synergistisk ROS-ökning och autofagiblockering', Nano Today, 49, s. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.