Illumina färdiga bibliotek
Drag
●Plattformar:Illumina NovaSeq 6000 och NovaSeq X Plus
●Sekvenseringslägen:PE150 och PE250
●Kvalitetskontroll av bibliotek före sekvensering
●Sekvenseringsdata QC och leverans:leverans av QC-rapport och rådata i fastq-format efter demultiplexering och filtrering av Q30-läsningar
Servicefördelar
●Mångsidigheten hos sekvenseringstjänster:Kunden kan välja att sekvensera efter fil, flödescell eller efter mängd data som krävs (partiell filsekvensering).
●Omfattande erfarenhet av Illumina-sekvenseringsplattformen:med tusentals avslutade projekt med olika arter.
●Leverans av QC-rapport för sekvensering:med kvalitetsmått, datanoggrannhet och sekvenseringsprojektets övergripande prestanda.
●Mogen sekvenseringsprocess:med kort handläggningstid.
●Rigorös kvalitetskontrollVi implementerar strikta kvalitetskontrollkrav för att garantera leverans av resultat av genomgående hög kvalitet.
Exempelplattformar
| Plattform | Flödescell | Sekvenseringsläge | Enhet | Uppskattad produktion |
| NovaSeq X | 10B (8 körfält) | PE150 | Enkelfil Delvis körfält | 375 GB / Fil |
| 25B (8 körfält) | PE150 | Enkelfil Delvis körfält | 1000 Gb/fil | |
| NovaSeq 6000 | SP-flödescell (2 banor) | PE250 | Flödescell Enkelfil Delvis körfält | 325–400 miljoner läsningar/fil |
| S4 Flödescell (4 banor) | PE150 | Flödescell Enkelfil Delvis körfält | ~800 Gb/fil |
Exempelkrav
| Datamängd (Gb) | Konc. (qPCR) PE150 | Konc. (qPCR) PE250 | Volym | |
| Delvis körfält
| G ≤ 10 | ≥ 1 nM | ≥ 2nM | ≥ 25 μl |
| 10 < G ≤ 50 | ≥ 2 nM | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 < G ≤ 100 | ≥ 3 nM | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| G > 100 | ≥ 4 nM | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Enkelfil | Per körfält | ≥ 1,5 nM/bibliotekspool | ≥ 2 nM/bibliotekspool | ≥ 25 µL/bibliotekspool |
Förutom koncentration och total mängd krävs även ett lämpligt toppmönster.
Obs: Filsekvensering av bibliotek med låg diversitet kräver PhiX-spike-in för att säkerställa robusta basanrop.
Vi rekommenderar att du skickar in förpoolade bibliotek som exempel för filsekvensering. Om du behöver att BMKGENE utför bibliotekspoolning, vänligen se bibliotekskraven för partiell filsekvensering.
Biblioteksstorlek (toppkarta)
För PE150-sekvensering bör insertstorleken vara 300–400 bp (exklusive adaptrar); för PE250-sekvensering bör insertstorleken vara 150–500 bp (exklusive adaptrar).
Bibliotek bör ha en enda huvudtopp, ingen adapterkontaminering och inga primerdimerer.
Kontakta oss om dina prover inte uppfyller kraven för utgångsmaterial.
Servicearbetsflöde
Kvalitetskontroll av biblioteket
Sekvensering
Datakvalitetskontroll
Projektleverans
Bibliotekets kvalitetskontrollrapport
En rapport om bibliotekets kvalitet tillhandahålls före sekvensering, bedömning av biblioteksmängd och fragmentering.
Sekvenserings-QC-rapport
Tabell 1. Statistik över sekvenseringsdata.
| Prov-ID | BMKID | Råa läsningar | Rådata (bp) | Rena avläsningar (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37,08 |
Figur 1. Kvalitetsfördelning längs avläsningarna i varje prov
Figur 2. Fördelning av basinnehåll
Figur 3. Fördelning av läst innehåll i sekvenseringsdata
