Produkter

DNA/RNA-sekvensering – Nanopore Sequencer

ONT-sekvensering är en enmolekyl i realtid för elektrisk signalsekvenseringsteknologi baserad på nanoporer, sekvenseringsprincipen för varje plattform är densamma.Dubbelsträngat DNA/RNA kommer att binda till nanoporöst protein inbäddat i biofilmen och avvecklas under ledning av motorprotein, under inverkan av spänningsskillnad från båda sidor av biofilmen, passerar DNA/RNA-strängar genom nanoporkanalproteinet vid en viss Betygsätta.På grund av skillnaderna mellan de kemiska egenskaperna hos de olika baserna på DNA/RNA-strängen, kommer det att orsaka förändring av olika elektriska signaler när en enda bas eller DNA-molekyl passerar genom nanoporkanalen.Genom att detektera och motsvara dessa signaler kan motsvarande bastyper beräknas, och realtidsdetekteringen av sekvensen kan slutföras.

Kontakta oss

Servicedetaljer

Demo resultat

Servicedetaljer Funktioner

Plattform	Bibliotekets storlek	Teoretisk datautbyte (per cell)	Enkelbas noggrannhet	Ansökningar
Nanopore	8 kb, 10 kb, 20 kb, ultralång, cDNA-PCR	70-90 Gb/cell	85-92 %	SV-anrop, De novo, Fullängdssekvensering, Iso-Seq, Genkommentar, Detektion av DNA-metylering

Servicefördelar

● Över 5 års erfarenhet av PacBio sekvenseringsplattform med tusentals stängda projekt med olika arter.
● BMKGENE är en officiell partner till Oxford Nanopore, med dubbelplattform RNA/DNA-certifiering.
● Det finns vanliga modeller av sequencers med komplett utrustning och tillräcklig genomströmning av sekvensering.
● Baserat på Nanopore-plattformen har mer än 10 Denovo-forskningar om djur och växter publicerats i internationellt kända tidskrifter.

Exempel på krav

Provtyp

Belopp

Koncentration (Qubit ®)

Volym

Renhet

Andra

Genomiskt DNA

Beror på datakrav

≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Klar topp vid 260 nm, inga föroreningar

Koncentrationen måste mätas med Qubit och Qubit/Nanopore ≤ 2

Totalt RNA

≥1,2μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5； inga föroreningar

RIN-värde ≥7,5

Service arbetsflöde

Provberedning

Byggande av bibliotek

Sekvensering

Dataanalys

Projekt leverans

Tidigare: DNA/RNA-sekvensering – Illumina Sequencer

Nästa: Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Datakvalitetsbedömning av DNA-prov

Tabell 1. Statistik över rena data.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	renN50Len	renN90Len	renMeanLen	renMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25,90	28 014	15,764	23 090	143,181	9