DNBSEQ-förberedda bibliotek
Drag
●Plattform:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekvenseringslägen:PE150
●Överföring av Illumina-bibliotek tillMGI:möjliggör sekvensering av stora datavolymer till låg kostnad.
●Kvalitetskontroll av bibliotek före sekvensering.
●Sekvenseringsdata QC och leverans:leverans av QC-rapport och rådata i fastq-format efter demultiplexering och filtrering av Q30-avläsningar.
Fördelar
●Mångsidigheten hos sekvenseringstjänster:Kunden kan välja att sekvensera efter fil eller datamängd.
●Hög datautgång:1500 Gb/fil
●Leverans av QC-rapport för sekvensering:med kvalitetsmått, datanoggrannhet och sekvenseringsprojektets övergripande prestanda.
●Mogen sekvenseringsprocess:med kort handläggningstid.
●Rigorös kvalitetskontrollVi implementerar strikta kvalitetskontrollkrav för att garantera leverans av resultat av genomgående hög kvalitet.
Exempelkrav
| Datamängd (X) | Koncentration (qPCR/nM) | Volym | |
| Delvis körfält
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Enkelfil | Per körfält | ≥ 1,5 nM / Bibliotekspool | ≥ 25 μl / Bibliotekspool |
Förutom koncentration och total mängd krävs även ett lämpligt toppmönster.
Obs: Filsekvensering av bibliotek med låg diversitet kräver PhiX-spike-in för att säkerställa robusta basanrop.
Vi rekommenderar att du skickar in förpoolade bibliotek som exempel. Om du behöver att BMKGENE utför bibliotekspoolning, vänligen se
bibliotekskrav för partiell filsekvensering.
Biblioteksstorlek (toppkarta)
Huvudtoppen bör ligga inom 300–450 bp.
Bibliotek bör ha en enda huvudtopp, ingen adapterkontaminering och inga primerdimerer.
Servicearbetsflöde
Bibliotekets kvalitetskontrollrapport
En rapport om bibliotekets kvalitet tillhandahålls före sekvensering, bedömning av biblioteksmängd och fragmentering.
Sekvenserings-QC-rapport
Tabell 1. Statistik över sekvenseringsdata.
| Prov-ID | BMKID | Råa läsningar | Rådata (bp) | Rena avläsningar (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37,08 |
Figur 1. Kvalitetsfördelning längs avläsningarna i varje prov
Figur 2. Fördelning av basinnehåll
Figur 3. Fördelning av läst innehåll i sekvenseringsdata
