Evolutionär genetik

Evolutionära genetiska studier syftar till att förstå populationers evolutionära utvecklingsbana med hjälp av polymorfisminformation i genomiska sekvenser. BMKCloud Evolutionary Genetics pipeline är utformad för att analysera WGS- eller Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF)-data från stora populationer. Efter kvalitetskontroll av rådata anpassas avläsningar till referensgenomet och varianter anropas. Pipelinen inkluderar fylogenetisk trädkonstruktion, principal component analysis (PCA), populationsstrukturanalys, linkage disequilibrium (LD), selective sweep analysis och kandidatgenanalys.