● Speciella prober används för att tömma ribosomalt cDNA.
● Strandspecifik bibliotekskonstruktion.
● Ett arbetsflöde för att hämta mRNA-, lncRNA- och circRNA-data samtidigt.
● Rigorös kvalitetskontroll: Vi implementerar centrala kontrollpunkter i alla steg, från prov- och biblioteksberedning till sekvensering och bioinformatik. Denna noggranna övervakning säkerställer leverans av resultat av genomgående hög kvalitet.
● Support efter köpet: Vårt engagemang sträcker sig bortom projektets slutförande med en 3-månaders eftermarknadsservice. Under denna tid erbjuder vi projektuppföljning, felsökningshjälp och frågestunder för att besvara eventuella frågor relaterade till resultaten.
| Bibliotek | Plattform | Rekommenderade uppgifter | Datakvalitetskontroll |
| rRNA-utarmat riktningsbibliotek | Illumina PE150 | 10–16 GB | Q30≥85% |
Nukleotider:
| Mängd (ng) | Volym (μL) |
| 40 | 20 |
Vävnad:
Exosom: 100 μL; 40 μg; >10^9 partiklar/ml
Serum/plasma: 5 ml
Cellkultursupernatant: 100 ml
Urin: 100 ml
Saliv: 15 ml
Nästörning: 15 ml
Cerebrospinalvätska: 15 ml
Fostervatten: 50 ml
Sperma: 5 ml
Galla: 5 ml
Ascites: 50 ml
Mjölk: 15 ml
Follikulär vätska: 15 ml
Fekal supernatant: 50 ml
Mikrobiell kultursupernatant: 100 ml
Djurvävnad: 3 g
Växtvävnad: 1 g
Behållare: 2 ml centrifugrör (Folie rekommenderas inte)
Exempelmärkning: Grupp+replikera t.ex. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Transport:
1. Torris: Proverna måste packas i påsar och begravas i torris.
2. RNAstable-rör: RNA-prover kan torkas i RNA-stabiliseringsrör (t.ex. RNAstable®) och transporteras i rumstemperatur.
Bioinformatik
circRNA-prediktion: kromosomfördelning
Differentiellt uttryckta circRNA – Vulkandiagram
Differentiellt uttryckta circRNA – hierarkisk klustring
Funktionell anrikning av circRNA:s värdgener
Differentiell genuttrycksanalys (DEG)
Kvantifiering av lncRNA-uttryck – klusterbildning
Anrikning av lncRNA-målgener
Analys av gemensam mRNA- och lncRNA-position – Circos-diagram (mittcirkeln är mRNA och inre cirkeln är lncRNA)