GWAS

Genomomfattande associationsstudier (GWAS) syftar till att identifiera loci associerade med specifika egenskaper eller fenotyper, ofta av ekonomisk eller hälsomässig betydelse. BMKClouds GWAS-pipeliner kräver en lista över identifierade genomiska varianter och en lista över fenotypiska variationer. Efter kvalitetskontroll av fenotyper och genotyper tillämpas olika statistiska modeller för att utföra associationsanalys. Pipelinen inkluderar även populationsstrukturanalys, kopplingsobalans och släktskapsuppskattning.