条形banner-03

Produkter

Mänsklig hel exomsekvensering

Sekvensering av mänskliga hela exomer (hWES) är allmänt erkänt som en kostnadseffektiv och kraftfull sekvenseringsmetod för att identifiera sjukdomsframkallande mutationer. Trots att de bara utgör cirka 1,7 % av hela genomet spelar exoner en avgörande roll genom att direkt återspegla profilen för totala proteinfunktioner. Det är värt att notera att i det mänskliga genomet manifesterar sig över 85 % av mutationerna relaterade till sjukdomar inom de proteinkodande regionerna. BMKGENE erbjuder en omfattande och flexibel tjänst för sekvensering av mänskliga hela exomer med två olika exonregistreringsstrategier tillgängliga för att uppnå olika forskningsmål.


Servicedetaljer

Demoresultat

Servicefunktioner

● Två exompaneler tillgängliga baserat på målberikning med prober: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) och xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekvensering på Illumina NovaSeq.

● Bioinformatisk pipeline riktad mot sjukdomsanalys eller tumöranalys.

Servicefördelar

Riktar sig mot proteinkodande regionGenom att fånga och sekvensera proteinkodande regioner används hWES för att avslöja varianter relaterade till proteinstruktur.

Kostnadseffektiv:hWES ger cirka 85 % av de sjukdomsassocierade mutationerna från 1 % av det mänskliga genomet.

Hög noggrannhetMed högt sekvenseringsdjup underlättar hWES detektion av både vanliga varianter och sällsynta varianter med frekvenser lägre än 1 %.

Rigorös kvalitetskontrollVi implementerar fem centrala kontrollpunkter i alla steg, från prov- och biblioteksberedning till sekvensering och bioinformatik. Denna noggranna övervakning säkerställer leverans av resultat av genomgående hög kvalitet.

Omfattande bioinformatisk analysVår forskningsportfölj går utöver att identifiera variationer i referensgenomet, eftersom den innehåller avancerad analys utformad för att specifikt ta itu med forskningsfrågor relaterade till genetiska aspekter av sjukdomar eller tumöranalys.

Support efter försäljning:Vårt engagemang sträcker sig bortom projektets slutförande med en 3-månaders eftermarknadsservice. Under denna tid erbjuder vi projektuppföljning, felsökningshjälp och frågestunder för att besvara eventuella frågor relaterade till resultaten.

Exempelspecifikationer

Exon Capture Strategy

Sekvenseringsstrategi

Rekommenderad datautmatning

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

eller xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5–10 GB

För Mendelska sjukdomar/sällsynta sjukdomar: > 50x

För tumörprover: ≥ 100x

Exempelkrav

Provtyp

 

 Belopp(Qubit®)

 

Koncentration 

Volym

 

 

 Renhet (NanoDrop™)

 

Genomiskt DNA

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280=1,8–2,0
 
ingen nedbrytning, ingen kontaminering

 

Bioinformatik

WES_BI arbetsflöde_Sjukdom-01

Bioinformatisk analys av hWES-sjukdomsprover inkluderar:

● Kvalitetskontroll av sekvenseringsdata

● Referensgenomjustering

● Identifiering av SNP:er och InDels

● Funktionell annotering av SNP:er och InDels

WES_BI arbetsflöde_Tumor-01

Bioinformatisk analys av tumörprover inkluderar:

● Kvalitetskontroll av sekvenseringsdata

● Referensgenomjustering

● Identifiering av SNP, InDels och somatiska variationer

● Identifiering av groddlinjevarianter

● Analys av mutationssignaturer

● Identifiering av drivgener baserat på gain-of-function-mutationer

● Mutationsannotering på läkemedelskänslighetsnivå

● Heterogenitetsanalys – beräkning av renhet och ploiditet

Servicearbetsflöde

provleverans

Provleverans

Pilotexperiment

DNA-extraktion

Biblioteksförberedelser

Biblioteksbyggnation

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalys

Dataanalys

数据上传-01

Dataleverans

Eftermarknadstjänster

Eftermarknadstjänster


  • Tidigare:
  • Nästa:

  • Data QC – Statistik över exominfångning

     

    wps_doc_22

     

    Variantidentifiering – InDels

    图片36

    Avancerad analys: identifiering och distribution av skadliga SNP:er/InDels – Circos-diagram

     

    图片37

    Tumöranalys: identifiering och distribution av somatiska mutationer – Circos-diagram

     

    图片38

     

    Tumöranalys: klonala linjer

     

    图片39

     

    få en offert

    Skriv ditt meddelande här och skicka det till oss

    Skicka ditt meddelande till oss: