Metabolomik
Drag
●Icke-riktad metabolomik (Discovery Metabolomics)
Baserat på vätskekromatografi-masspektrometri (LC-MS)-teknik möjliggör icke-riktad metabolomik opartisk detektion av så många småmolekylära metaboliter som möjligt i biologiska prover såsom celler, vävnader, organ eller kroppsvätskor. Den utför jämförande analys mellan experiment- och kontrollgrupper och screenar olika metaboliter genom statistisk analys.
● Icke-riktad metabolomik för lipider
Utnyttja vätskekromatografi-masspektrometri (LC-MS)-teknik,nMålinriktad metabolomik för lipider uppnår opartisk detektion av så många lipidmolekyler som möjligt i biologiska prover, inklusive celler, vävnader, organ eller kroppsvätskor.
● Bred-Riktad metabolomik
Denna tjänst kombinerar på ett perfekt sätt fördelarna med hög upplösning och bred täckning hos oriktad teknik med den höga känsligheten och de noggranna kvantifieringsmöjligheterna hos riktad MRM-teknik (Multiple Reaction Monitoring). Arbetsflödet är följande: Först används högupplöst masspektrometri för att utföra MS²-skanning med ultrahög täckning på prover för att erhålla MS²-spektra av "alla" metaboliter. Därefter utförs noggrann metabolitidentifiering genom att kombinera med ett högupplöst MS²-bibliotek (som täcker över 25 000 metaboliter, med flera standard MS²-spektra med hög upplösning för varje metabolit). Därefter extraheras MRM-jonparinformation från masspektra för att etablera ett specifikt bibliotek för prover. Slutligen tillämpas trippelkvadrupolmasspektrometri med MRM-teknik för noggrann kvantifiering.
● Riktad metabolomik
Riktad metabolomik fokuserar på flera målsubstanser eller alla/partiella metaboliter involverade i en specifik metabolitväg. Med hjälp av standardsubstanser etableras en detektionsmetod med stark specificitet, hög känslighet och god repeterbarhet för kvantifiering och analys av målsubstanser. Den använder extern standard kombinerad med intern standard för absolut kvantifiering, med en linjäritet hos standardkurvan som når över 0,99 och en känslighet upp till ng/ml-nivå.
Fördelar
●Avancerad detektionsplattform
-Utrustade med högupplösta masspektrometrar och trippelkvadrupolmasspektrometrar av högsta kvalitet, vilket möjliggör samtidig detektion och analys av tusentals metaboliter.
●Omfattande databaser
- Offentliga databaser: Omfattar METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas och Lipidmaps, och omfattar över 500 000 metaboliter.
- InterntVäxtspecifik databas: Innehåller över 25 000 metaboliter, inklusive primära och sekundära metaboliter.
- InterntDjur-/medicinspecifik databas: Innehåller över 12 000 metaboliter.
●Strikt kvalitetskontrollsystem
-Strikt kvalitetskontroll som omfattar instrumentstabilitet, substansrester, QC-prov PCA och korrelationsanalys för att säkerställa tillförlitlig datakvalitet.
●Hög metabolitdetekteringskapacitet
- Icke-Riktad metabolomik: Detekterar i genomsnitt över 4 200 metaboliter per körning, idealiskt för att utforska okända metaboliter i prover och identifiera metaboliter i komplexa prover.
- Bred-Riktad metabolomik (växt): Detekterar i genomsnitt över 2 410 metaboliter per körning, inklusive primära och sekundära metaboliter.
- Bred-Riktad metabolomik (djur): Detekterar i genomsnitt över 1 250 metaboliter per körning.
- Riktad metabolomik: Panelerförflera metabolitkategorier.
●Omfattande analys
-Erbjuder mer än 10 analysobjekt och över 20 visualiseringsdiagram.
●Omtänksam kundservice
-Erbjuder rådgivning efter försäljning och stöd vid tolkning av slutrapporter.
Servicespecifikationer
| Lösning | Plattform | Rekommenderade biologiska replikat |
|---|---|---|
| Icke-riktad metabolomik | UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) | Växt- och mikrobiellt prov: ≥ 6 Djurprov: ≥ 10 Kliniskt prov: ≥ 30 Alla biologiska replikatprover analyserades oberoende av varandra. |
| Bredriktad metabolomik | Vatten Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | Växtprov: ≥ 3 |
| Riktad metabolomik | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | Växtprov: ≥ 3 Djurprov: ≥ 6 |
Exempelkrav
Undrar du om dina prover uppfyller våra kriterier? Klicka här för att få vårasenaste provkraven.
Servicearbetsflöde
Provsamling
Metabolitutvinning
Datainsamling
Dataanalys
Dataleverans
1. Bakgrundsbrus och lågkvalitativ databehandling av rådata
2. Bedömning av datakvalitet
2.1 Analys av huvudkomponenter
2.2 Reproducerbarhetsbedömning
3. Metabolitannotering
3.1 KEGG-databasannotering
3.2 HMDB-databasannotering
3.3 Lipidmaps-databasens annotering
4. Analys av provgrupperingsdata (biologiska replikat≥3)
4.1 Analys av koncernens huvudkomponenter
4.2 Ortogonal partiell minstakvadratdiskriminantanalys (OPLS-DA)
4.3 Analys av gruppdifferentiell metabolit
5. Differentiell metabolitselektion (biologiska replikat≥3)
5.1 Analys av differentiell veckförändring
5.2 Vulkandiagram över differentiell metabolit
5.3 Värmekarta för differentiell metabolitklustring
5.4 Korrelationsdiagram för differentiell metabolit
5.5 Z-poängdiagram för differentiell metabolit
5.6 Radardiagram för differentiell metabolitanalys
5.7 Differentiell metabolit fioldiagram
5.8 Boxdiagram över differentiell metabolit
5.9 Funktionell annotering och anrikningsanalys av KEGG:s differentiella metabolit
5.10 ROC-kurvanalys
5.11 Differentiell metabolit k-medelkluster
5.12 Venn-diagram för differentiell metabolit
1. Bedömning av datakvalitet
↑Ckorrelationsanalys(Testprov/QC-prov)
↑Analys av huvudkomponenter ↑Analys av metabolitkluster
2. Metabolitannotering
↑KEGG-databasannotering↑HMDB-databasannotering
↑Lipidmaps databasannotering
3. Analys av provgrupperingsdata (biologiska replikat≥3)
↑Analys av koncernens huvudkomponenter(2D/3D)
↑Ortogonal partiell minstakvadratdiskriminantanalys (OPLS-DA)
4. Differentiell metabolitselektion (biologiska replikat≥3)
↑Differentiell vikningsförändringsanalys↑Differentiell metabolit vulkandiagram
↑Differentiell metabolitklustringsvärmekarta↑Differentiell metabolitkorrelationsdiagram
↑Differentiell metabolit Z-poängdiagram↑Differentiell metabolitradardiagramanalys
↑Differentiell metabolit fiolplot↑Differentiell metabolitboxdiagram
↑ Funktionell annotering och anrikningsanalys av differentiell metabolit KEGG
↑ROC-kurvanalys↑Differentiell metabolit k-medelkluster
↑Differentiell metabolit Venn diagram
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. BEL1-liknande homeodomäntranskriptionsfaktor SAWTOOTH1 (MdSAW1) i Malus domestica ökar toleransen hos transgena äpplen och Arabidopsis mot överskottsstress från zink. Int J Biol Macromol. 2025 maj;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025 mars 10. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. Interaktiv effekt av Moringa oleifera-medierade gröna nanopartiklar och arbuskulära mykorrhizasvampar på tillväxt, rotsystemarkitektur och näringsupptag i majs (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. 2025 sep;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 2025 maj 24. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. Jasmonat aktiverar en SlJAZ2/3-SlMYC3-liknande modul som reglerar K+-upptag i tomaters svar på låg K+-stress. J Integr Plant Biol. 2025 aug;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 2025 maj 28. PMID: 40432500.
