Proteomik
Drag
● Kvalitativ proteomik: Använder LC-MS/MS för att identifiera proteinsammansättning i komplexa prover (SDS-PAGE-gelremsor, IP, Co-IP, Pull-down). Fördelar: Ingen gräns för antal prover, snabb detektion, enkel provbearbetning, hög genomströmning och förmåga att detektera proteiner i låg förekomst.
● Märkningsfri kvantitativ proteomik: Omärkt teknik med individuell provdetektering. Kvantifierar proteiner genom att jämföra peptidsignalintensiteter i masspektrometridata. Fördelar: Enkel drift, hög genomströmning (ingen gräns för antal prover) och bred tillämpbarhet (lämplig för differentiell proteinjämförelse mellan arter med "närvaro/frånvaro").
● DIA-kvantitativ proteomik: Använder dataoberoende förvärvningsläge (DIA) och skannar alla joner i segmenterade fönster för att samla in fullständig joninformation. Fördelar: Bättre repeterbarhet, högre proteintäckning och mer exakt kvantifiering än DDA-läge (TMT/Label Free), idealiskt för studier med stora prover.
● 4D-märkningsfri kvantitativ proteomik/4D-DIA kvantitativ proteomik: Baserad på Bruker timsTOF-masspektrometer, vilket ger jonmobilitet (kollisionstvärsnitt) till traditionell 3D-separation. Fördelar: Förbättrad jonutnyttjande och noggrannhet, omfattande förbättring av täckningsdjup, känslighet och genomströmning; högre identifieringsdjup än traditionell 3D-metod.
● Astral Label Free Quantitative Proteomics/Astral DIA Quantitative Proteomics: Baserad på OrbitrapTM AstralTM högupplösande masspektrometer. Fördelar: Högre genomströmning (100+ prover/dag med 8-minuters gradient), djupare täckning (8 000+ proteiner detekterade i Hela-celler på 8 min) och högre känslighet (färre prover krävs).
● TMT Kvantitativ Proteomik: Använder 18 isotoptaggar för att märka peptider för samtidig detektion av 18 prover. Fördelar: Hög stabilitet (minimal instrumentstabilitetsstörning, litet systemfel) och hög känslighet (fraktionering minskar provkomplexiteten, vilket förbättrar detektion av protein i låg förekomst).
● PRM-riktad proteomik: Riktad teknik med hög upplösning för selektiv detektion av målproteiner/peptider. Fördelar: Möjliggör relativ/absolut kvantifiering och verifiering av kvantitativa proteomikresultat; ingen antikroppsbegränsning, bredare tillämpbarhet än Western Blot och ELISA.
Fördelar
● Avancerad utrustning: Utrusta med både konventionella proteomikplattformar och avancerade högdjupsmasspektrometrar (t.ex. 4D, Astral).
● Stabil detektion: Rigorösa kvalitetskontrollsystem säkerställer konsekventa och stabila testprocesser.
● Tillförlitliga resultat: Samtidig kvalitativ och kvantitativ analys ger relativt uttryck, molekylvikt, förekomst och andra viktiga data för varje grupp.
● Hög automatisering: Automatiserade LC-MS-system möjliggör snabb analys och utmärkt separationsprestanda.
Servicespecifikationer
| Jämförelse av icke-riktade proteomiktekniker | ||||
| Etikettfri | DIA | TMT | ||
| Märkning | NO | NO | JA | |
| Dataskanningsläge | DDA | DDA | DIA | DDA |
| Reproducerbarhet | Lägre | Hög | Hög | |
| Känslighet | Lägre | Hög | Hög | |
| Multiplexering | NO | JA | NO | JA |
| Ansökan | Jämförelse av proteinnärvaro/frånvaro | Storskaliga prover | Analys av olika provpartier | Jämförelse av differentiellt proteinuttryck i samma art och vävnad |
| Noggrannhet | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| Antal detekteringar | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
Exempelkrav
Undrar du om dina prover uppfyller våra kriterier? Klicka här för att få vårasenaste provkraven.
Servicearbetsflöde
Provsamling
Proteinutvinning
Enzymatisk matsmältning
Separation
Datainsamling
Dataanalys
Dataleverans
Kvalitativ proteomik
1. Proteinlösning/gel: tabell över kvalitativa resultat
2. Sökresultat i databasen
2.1 Lista över peptidsegment som matchades i databassökningen
2.2 Lista över proteiner som matchades i databassökningen
2.3 Lista över modifieringar som matchade databassökningen (fosforylering, ubiquitinering, etc.)
3. Rådata
Kvantitativ proteomik(Märkningsfri/DIA/TMT)
1. Dataförbehandling
1.1 Sökning i proteindatabasen
2. Proteinuttrycksanalys
2.1 Principalkomponentanalys (PCA)
2.2 Relativ standardavvikelse (RSD)
2,3 K-medelvärden Trendfördelning
2.4 Utvärdering av reproducerbarhet
2.5 Värmekarta för proteinuttryck
3. Funktionell annotering
3.1 Funktionell annotering i GO
3.2 KEGG-funktionell annotering
3.3 Funktionell annotering av COG
3.4 GOslim funktionell annotering
3.5 Annotering av Pfam-proteinstrukturdomän
4. Proteindifferentialanalys (biologiska replikat ≥ 3)
4.1 Resultat av proteindifferentialanalys
4.2 Fördelning av differentiella proteinveckningsförändringar (FC)
4.3 Statistisk analys av differentiell proteinmängd
4.4 Differentialproteinvulkandiagram
4.5 Värmekarta för differentiell proteinklustring
4.6 Differentiell protein GO funktionell annotation och anrikningsanalys
4.7 Differentiell protein KEGG funktionell annotation och anrikningsanalys
4.8 Funktionell annotation av differentiellt protein COG
4.9 Differentiell protein GOslim-annotering och anrikningsanalys
4.10 Annotering och anrikningsanalys av differentiell proteinstrukturdomän
5. Analys av proteinnätverksinteraktion
6. Annotering av proteinreaktomvägen
7. Signalpeptidprediktion
8. Subcellulär lokalisering av proteiner
Kvantitativ proteomik(PRM)
1. Resultat av PRM-proteinkvantifiering
1.1 Översikt över kvantifieringsresultat
1.2 Fördelning av fragmentjontoppområden för peptidsegment
Kvantitativ proteomik
1.Proteinuttrycksanalys
↑Principalkomponentanalys (PCA)↑Relativ standardavvikelse (RSD)
↑K-betyder Trendfördelning ↑KorrelationAanalys avPproteinEuttryckLnivåer
↑ Värmekarta för proteinuttryck
2. Funktionell annotering
↑GO Funktionell annotering↑KEGG Funktionell annotering
↑ COG funktionell annotering ↑ GOslim funktionell annotering
↑ Annotation av Pfam-proteinstrukturdomän
3.Analys av proteinnätverksinteraktioner
↑ Analys av proteinnätverksinteraktion
4.Signalpeptidförutsägelse
↑ Signalpeptidprediktion
5. Subcellulär lokalisering av proteiner
↑Subcellulär lokalisering av proteiner
| 2025 | Apoptotiska vesiklar härledda från mesenkymala stamceller lindrar överkänslighetsreaktioner via inducering av CD8+ T-cellsapoptos med kalciumöverbelastning och mitokondriell dysfunktion | Avancerad vetenskap |
| 2024 | Integrerade multiomika visar förbättrad antitumöreffekt av | Translationell onkologi |
| 2024 | Multi-Omiks-analys avslöjar de distinkta egenskaperna hos metabolismvägar som stöder Fruktstorlek och färgvariation hos jättepumpa | Int. J. Mol. Sci. |
| 2024 | Transkriptom- och metabolomprofilering ger nya insikter i muskelatrofi vid inaktivitet hos kyckling: Den potentiella rollen av snabba muskelfibrer | Int. J. Mol. Sci. |
| 2023 | Multiomics-analys avslöjar tetracyklins inverkan på tillväxten av rajgräsrötter. | Tidskrift för farliga ämnen |
