Mkutano wa Genome wa Bakteria mpya
Tunatoa huduma kamili ya kukusanya jenomu ya bakteria, na kuhakikisha mapengo 0. Hili linawezekana kwa kuunganisha teknolojia za mpangilio wa kusoma kwa muda mrefu, kama vile Nanopore na PacBio kwa ajili ya mkusanyiko na mpangilio wa kusoma kwa muda mfupi na Illumina kwa ajili ya uthibitisho wa mkusanyiko na marekebisho ya makosa ya usomaji wa ONT. Huduma yetu hutoa mtiririko kamili wa kazi wa kibiolojia kutoka kwa mkusanyiko, maelezo ya utendaji kazi, na uchambuzi wa hali ya juu wa kibiolojia, na kutimiza malengo maalum ya utafiti. Huduma hii inawezesha ukuzaji wa jenomu sahihi za marejeleo kwa ajili ya tafiti mbalimbali za kijenetiki na kijenomu. Zaidi ya hayo, huunda msingi wa matumizi kama vile uboreshaji wa aina, uhandisi wa kijenetiki, na maendeleo ya teknolojia ya vijidudu, kuhakikisha data ya kijenomu ya kuaminika na isiyo na mapengo muhimu kwa ajili ya kuendeleza maarifa ya kisayansi na uvumbuzi wa kibiolojia.
Vipengele vya Huduma
● Na chaguzi mbili zinazowezekana za kuchagua kulingana na kiwango kinachohitajika cha ukamilifu wa jenomu.
● Chaguo la Rasimu ya Jenomu: Mfuatano wa usomaji mfupi kwa kutumia Illumina NovaSeq PE150.
● Jenomu kamili ya pengo 0.
● Mfuatano wa muda mrefu kwenye Nanopore PromethION 48 au PacBio Revio kwa ajili ya mkusanyiko wa jenomu.
● Mfuatano mfupi wa kusoma kwenye Illumina NovaSeq kwa ajili ya uthibitishaji wa jenomu na urekebishaji wa makosa (Nanopore) au kutoa jenomu ya rasimu.
Faida za Huduma
●Jenomu ya Pengo la Zero ImehakikishwaHii ni kutokana na muunganiko wa mpangilio wa Illumina na mpangilio wa usomaji mrefu (Nanopore au PacBio).
●Mtiririko Kamili wa Kazi wa Bioinformatiki:Hii inajumuisha mkusanyiko wa jenomu na utabiri wa vipengele vingi vya jenomu, maelezo ya jeni linalofanya kazi, na taswira za jenomu kama vile njama ya Circos.
●Utaalamu wa Kina: Kwa zaidi ya jenomu 20,000 za vijidudu zilizokusanywa, BMKGENE ina uzoefu wa zaidi ya muongo mmoja, timu ya uchambuzi yenye ujuzi wa hali ya juu, maudhui kamili, na usaidizi bora wa baada ya mauzo.
●Usaidizi wa Baada ya Mauzo:Ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha miezi 3 baada ya mauzo. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi wa matatizo, na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
●Mikakati Mingi ya Mfuatano Inapatikana:Kwa malengo tofauti ya utafiti na mahitaji ya ukamilifu wa jenomu.
Vipimo vya Huduma
| Huduma | Mkakati wa Mfuatano |
| Jenomu ya Rasimu | Illumina PE150 100x |
| Jenomu 0 ya Pengo | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (si lazima) |
Mahitaji ya Mfano:
| Mkusanyiko (ng/µL) | Jumla ya kiasi (µg) | Kiasi (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakteria: ≥3.5x1010 seli
Mtiririko wa Kazi ya Huduma
Uwasilishaji wa sampuli
Ujenzi wa maktaba
Mfuatano
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya mauzo
Inajumuisha Uchambuzi Ufuatao:
● Udhibiti wa Ubora wa Data kwa Mfuatano
● Mkusanyiko wa Jenomu
● Uchambuzi wa Vipengele vya Jenomu: Utabiri wa CDS na vipengele vingi vya jenomu
● Maelezo ya utendaji kazi yenye hifadhidata nyingi za jumla (GO, KEGG, nk) na hifadhidata za hali ya juu (CARD, CAZy, nk)
● Taswira ya Jenomu
Tunatoa jenomu katika umbizo la haraka linalopatikana kwa urahisi na faili ya maelezo ya jenomu (gff).
Maelezo ya jeni – GO
Maelezo ya jeni - Wanga wa CAZY
Taswira ya jeni - Mchoro wa Circos
Chunguza maendeleo yaliyowezeshwa na huduma za kukusanya jenomu ya bakteria za BMKGene kupitia mkusanyiko wa machapisho yaliyochaguliwa.
Dai, W. et al. (2023) 'Ugunduzi wa Bakteria sare F18-22 kama Bakteria Salama na Mpya ya Probiotic kwa ajili ya Matibabu ya Colitis ya Vidonda kutoka kwa Utumbo Mzima wa Binadamu',Jarida la Kimataifa la Sayansi ya Masi, 24(19), uk. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Vijidudu sugu vya Proteus mirabilis hubeba blaOXA-1 na blaNDM-1 kutoka kwa wanyamapori nchini China: kuongeza hatari ya afya ya umma',Zoolojia Jumuishi, 16(6), ukurasa wa 798-809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Mfuatano kamili wa jenomu ya endophyte Bacillus flexus KLBMP 4941 unaonyesha utaratibu wake wa kukuza ukuaji wa mimea na msingi wa kijenetiki wa uvumilivu wa chumvi',Jarida la Bioteknolojia, 260, ukurasa wa 38-41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Plasmids za Upinzani wa Replikoni Nyingi za Klebsiella Usambazaji Mkubwa wa Jeni za Antimicrobial Kati',Mipaka katika Microbiolojia, 12, uk. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
