Upangaji Upya wa Jenomu Nzima ya Bakteria na Fangasi
Miradi ya upangaji upya wa jenomu nzima ya bakteria na kuvu ni muhimu kwa kuendeleza jenomu za vijidudu kwa kuwezesha kukamilisha na kulinganisha jenomu za vijidudu. Hii inawezesha uhandisi wa uchachushaji, uboreshaji wa michakato ya viwanda, na uchunguzi wa njia za kimetaboliki za sekondari. Zaidi ya hayo, upangaji upya wa vijidudu na bakteria ni muhimu kwa kuelewa marekebisho ya mazingira, kuboresha aina, na kufichua mienendo ya mageuko ya kijenetiki, ikiwa na athari kubwa katika dawa, kilimo, na sayansi ya mazingira.
Faida za Huduma
●Uchambuzi wa Bioinformatiki Unajumuisha Wito Tofauti:Kutoa maarifa ya utendaji kazi katika jenomu zilizopangwa upya.
● Utaalamu wa Kina: Kwa maelfu ya miradi ya upangaji upya wa vijidudu inayofanywa kila mwaka, tunaleta uzoefu wa zaidi ya muongo mmoja, timu ya uchambuzi yenye ujuzi wa hali ya juu, maudhui kamili, na usaidizi bora baada ya mauzo.
●Usaidizi wa Baada ya Mauzo:Ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha miezi 3 baada ya mauzo. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi wa matatizo, na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
Vipimo vya Huduma
| Jukwaa la mpangilio | Mkakati wa Mfuatano | Data iliyopendekezwa | Udhibiti wa ubora |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Kina cha 100x | Q30≥85% |
Mahitaji ya Sampuli
| Mkusanyiko (ng/µL) | Jumla ya kiasi (ng) | Kiasi (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakteria: ≥1x107 seli
Kuvu ya seli moja: ≥5x106-1x107 seli
Kuvu wa Macro: ≥4g
Mtiririko wa Kazi ya Huduma
Uwasilishaji wa sampuli
Ujenzi wa maktaba
Mfuatano
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya mauzo
Inajumuisha Uchambuzi Ufuatao:
- Udhibiti wa Ubora wa Data kwa Mfuatano
- Mpangilio wa Jenomu ya Marejeleo
- Wito Tofauti: SNP na InDel
- Maelezo ya Tofauti
Simu tofauti: Aina za SNP
Wito wa tofauti: Usambazaji wa urefu wa InDel
Chunguza maendeleo yaliyowezeshwa na huduma za upangaji upya wa jenomu za vijidudu za BMKGene kupitia mkusanyiko wa machapisho yaliyochaguliwa.
Jia, Y. et al. (2023) 'Kuchanganya Transcriptome na Jenomu Nzima Kurekebisha Jeni za Upinzani wa Magonjwa ya Uchunguzi kwa ajili ya Kibete cha Ngano',Jarida la kimataifa la sayansi ya molekuli, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Umetaboli wa glukosi unaodhibitiwa na ampicillin hudhibiti mpito kutoka uvumilivu hadi upinzani katika bakteria',Maendeleo ya Sayansi, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., bakteria wa haloalkaliphilic aliyetengwa kutoka ziwa la soda katika Mkoa wa Inner Mongolia Autonomous, China', Int. J. Syst. Evol.Mikrobiolojia, 72, uk. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. na Wang, G.-H. (2024) 'Mfuatano wa jenomu wa Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, uliotengwa kutoka Nasonia vitipennis',Matangazo ya Rasilimali za Mikrobiolojia. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
