-
Nakala ya Urefu Kamili ya PacBio (isiyo ya Marejeleo)
Jukwaa la Amplicon (16S/18S/ITS) limetengenezwa kwa uzoefu wa miaka mingi katika uchanganuzi wa mradi wa anuwai ya vijidudu, ambao una uchanganuzi sanifu wa kimsingi na uchanganuzi wa kibinafsi: uchambuzi wa kimsingi unashughulikia uchanganuzi mkuu wa utafiti wa sasa wa vijidudu, yaliyomo kwenye uchanganuzi ni tajiri na ya kina, na matokeo ya uchambuzi yanawasilishwa kwa namna ya ripoti za mradi;Maudhui ya uchanganuzi wa kibinafsi ni tofauti.Sampuli zinaweza kuchaguliwa na vigezo vinaweza kuwekwa kwa urahisi kulingana na ripoti ya uchambuzi wa kimsingi na madhumuni ya utafiti, ili kufikia mahitaji maalum.Mfumo wa uendeshaji wa Windows, rahisi na wa haraka.
-
Nakala ya Urefu Kamili ya PacBio (isiyo ya Marejeleo)
Kwa kuchukua data ya mpangilio wa Isoform ya Pasifiki (PacBio) kama ingizo, Programu hii inaweza kutambua mfuatano wa manukuu ya urefu kamili (bila kukusanyika).Kwa kuchora mpangilio wa urefu kamili dhidi ya jenomu ya marejeleo, nakala zinaweza kuboreshwa na jeni zinazojulikana, nakala, maeneo ya usimbaji, n.k. Katika hali hii, utambuzi sahihi zaidi wa miundo ya mRNA, kama vile uunganishaji mbadala, n.k, unaweza kupatikana.Uchanganuzi wa pamoja na data ya mfuatano wa nukuu ya NGS huwezesha ufafanuzi wa kina zaidi na ukadiriaji sahihi zaidi katika kujieleza katika kiwango cha manukuu, ambayo kwa kiasi kikubwa hunufaisha usemi tofauti wa mkondo na uchanganuzi wa utendaji.
-
Zana
BMKCloud ni jukwaa linaloongoza la kibayolojia linalotoa suluhisho la wakati mmoja kwa programu za jeni, ambalo linaaminiwa sana na watafiti katika nyanja mbalimbali ikiwa ni pamoja na matibabu, kilimo, mazingira, n.k. BMKCloud imejitolea kutoa huduma jumuishi, za kuaminika na za ufanisi ikiwa ni pamoja na majukwaa na zana za uchambuzi wa bioinformatic. , rasilimali za kompyuta, hifadhidata ya umma, kozi za mtandaoni za bioinformatiki, n.k. BMKCloud ina zana mbalimbali za kibayolojia zinazotumiwa mara kwa mara ikiwa ni pamoja na ufafanuzi wa jeni, zana za mageuzi za kijeni, ncRNA, udhibiti wa ubora wa data, kuunganisha, upatanishi, uchimbaji wa data, mabadiliko, takwimu, jenereta ya takwimu, mlolongo. uchambuzi, nk.
-
RNA ndogo
RNA ndogo ni aina ya RNA fupi isiyo na misimbo yenye urefu wa wastani wa 18-30 nt, ikiwa ni pamoja na miRNA, siRNA na piRNA.RNA hizi ndogo zimeripotiwa kuhusika kwa kiasi kikubwa katika michakato mbalimbali ya kibiolojia kama vile uharibifu wa mRNA, uzuiaji wa tafsiri, uundaji wa heterokromatini, n.k. Uchambuzi wa mpangilio wa SmallRNA umetumika sana katika tafiti kuhusu ukuzaji wa wanyama/mimea, magonjwa, virusi, n.k. Ndogo ya RNA. jukwaa la uchambuzi wa mpangilio lina uchanganuzi wa kawaida na uchimbaji wa data wa hali ya juu.Kwa msingi wa data ya RNA-seq, uchanganuzi wa kawaida unaweza kufikia kitambulisho na ubashiri wa miRNA, utabiri wa jeni lengwa wa miRNA, ufafanuzi na uchanganuzi wa usemi.Uchanganuzi wa hali ya juu huwezesha utaftaji na uchimbaji wa miRNA uliobinafsishwa, utengenezaji wa mchoro wa Venn, miRNA na ujenzi wa mtandao wa jeni unaolengwa.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS ni jukwaa zima la uchanganuzi wa kupanga upya jenomu, ambalo limetengenezwa kwa msingi wa tajiriba katika Biomarker Technologies.Jukwaa hili la urahisi wa kutumia huruhusu uwasilishaji wa haraka wa utendakazi jumuishi wa uchanganuzi kwa kuweka tu vigezo vichache vya msingi, ambavyo vinalingana na data ya mpangilio wa DNA inayozalishwa kutoka kwa jukwaa la Illumina na jukwaa la mpangilio la BGI.Mfumo huu umewekwa kwenye seva ya utendakazi wa hali ya juu, ambayo huwezesha uchanganuzi wa data wenye ufanisi zaidi katika muda mfupi sana.Uchimbaji data uliobinafsishwa unapatikana kwa msingi wa uchanganuzi wa kawaida, ikijumuisha hoja ya jeni iliyobadilishwa, muundo wa msingi wa PCR, n.k.
-
mRNA(Rejea)
Transcriptome ni kiungo kati ya taarifa za kijenetiki za jeni na proteome ya utendakazi wa kibiolojia.Udhibiti wa kiwango cha uandishi ndio njia muhimu zaidi na iliyosomwa sana ya udhibiti wa viumbe.Mfuatano wa nukuu unaweza kupanga nukuu wakati wowote kwa wakati au chini ya hali yoyote, kwa azimio sahihi kwa nukleotidi moja. Inaweza kuakisi kwa kiwango kikubwa kiwango cha unukuzi wa jeni, kutambua wakati huo huo na kuhesabu nakala adimu na za kawaida, na kutoa maelezo ya muundo wa sampuli za nakala maalum.
Kwa sasa, teknolojia ya mpangilio wa nukuu imekuwa ikitumika sana katika agronomia, dawa na nyanja zingine za utafiti, ikijumuisha udhibiti wa ukuzaji wa wanyama na mimea, urekebishaji wa mazingira, mwingiliano wa kinga, ujanibishaji wa jeni, mabadiliko ya jeni na utambuzi wa tumor na ugonjwa wa kijeni.
-
Metagenomics (NGS)
Jukwaa hili la uchanganuzi limeundwa kwa uchanganuzi wa data ya metagenomic kulingana na uzoefu wa miaka.Inajumuisha utendakazi uliounganishwa unaojumuisha uchanganuzi mbalimbali wa metagenomics zinazohitajika kwa kawaida ikiwa ni pamoja na usindikaji wa data, tafiti za kiwango cha spishi, tafiti za kiwango cha utendaji wa jeni, uwekaji wa data kwenye metagenome, n.k. Zaidi ya hayo, zana za uchimbaji data zilizobinafsishwa zinapatikana katika uchanganuzi wa kawaida, ikijumuisha swala la jeni na spishi. , mpangilio wa kigezo, kutengeneza takwimu za kibinafsi, n.k.
-
LncRNA
RNA ndefu zisizo na msimbo (lncRNA) ni aina ya nakala zenye urefu wa zaidi ya nt 200, ambazo haziwezi kuweka msimbo wa protini.Ushahidi limbikizi unapendekeza kuwa nyingi ya lncRNAs zina uwezekano mkubwa wa kufanya kazi.Teknolojia za upangaji matokeo ya hali ya juu na zana za kuchanganua habari za kibayolojia hutuwezesha kufichua mfuatano wa lncRNA na kuweka maelezo kwa ufanisi zaidi na kutuongoza kugundua lncRNA zilizo na kazi muhimu za udhibiti.BMKCloud inajivunia kuwapa wateja wetu jukwaa la uchambuzi wa mpangilio wa lncRNA ili kufikia uchanganuzi wa haraka, wa kutegemewa na unaonyumbulika wa lncRNA.
-
GWAS
Utafiti wa shirika pana la genome (GWAS) unalenga kutambua vibadala vya kijeni (genotype) vinavyohusishwa na sifa mahususi (fenotipu).Tafiti za GWA huchunguza viashirio vya kijenetiki vinavyovuka jenomu nzima ya idadi kubwa ya watu na kutabiri uhusiano wa genotype-phenotype kwa uchanganuzi wa takwimu katika kiwango cha idadi ya watu.Ufuataji wa jenomu nzima unaweza kugundua aina zote za kijeni.Ikiunganishwa na data ya phenotypic, GWAS inaweza kuchakatwa ili kutambua SNP zinazohusiana na phenotipi, QTL na jeni tahini, ambayo inaunga mkono kwa nguvu ufugaji wa kisasa wa wanyama/mimea.SLAF ni mkakati uliorahisishwa wa kupanga mpangilio wa jenomu, ambao hugundua vialamisho vilivyosambazwa kwa upana wa genome, SNP.SNP hizi, kama viashirio vya kijenetiki vya molekuli, vinaweza kuchakatwa kwa ajili ya tafiti zinazohusiana na sifa zinazolengwa.Ni mkakati wa gharama nafuu katika kutambua sifa changamano zinazohusiana na tofauti za kijeni.
-
Nanopore Nakala za urefu kamili
Isoforms mbadala tata na tofauti katika viumbe ni njia muhimu za kijeni za kudhibiti usemi wa jeni na utofauti wa protini.Utambulisho sahihi wa miundo ya nakala ndio msingi wa uchunguzi wa kina wa mifumo ya udhibiti wa usemi wa jeni.Jukwaa la mpangilio la Nanopore limefaulu kuleta utafiti wa maandishi kwenye kiwango cha isoform.Jukwaa hili la uchanganuzi limeundwa kuchanganua data ya RNA-Seq inayotolewa kwenye jukwaa la Nanopore kwa misingi ya jenomu ya marejeleo, ambayo hufanikisha uchanganuzi wa ubora na kiasi katika kiwango cha jeni na kiwango cha nakala.
