BMKCloud Ingia

Bidhaa

Illumina maktaba zilizotengenezwa mapema

Maktaba zilizoundwa awali za Illumina Picha Iliyoangaziwa

Teknolojia ya mpangilio wa Illumina, kulingana na Kufuatana na Usanisi (SBS), ni uvumbuzi unaokumbatiwa kimataifa wa NGS, unaowajibika kuzalisha zaidi ya 90% ya data ya mfuatano duniani. Kanuni ya SBS inahusisha upigaji picha wa viambata vinavyoweza kutenduliwa vilivyo na lebo ya umeme kila dNTP inapoongezwa, na kung'olewa baadaye ili kuruhusu ujumuishaji wa besi inayofuata. Pamoja na dNTP zote nne zinazoweza kutenduliwa katika kila mzunguko wa ufuataji, ushindani wa asili hupunguza upendeleo wa ujumuishaji. Teknolojia hii yenye matumizi mengi inasaidia maktaba zinazosoma mara moja na zilizounganishwa kwa jozi, zinazohudumia anuwai ya matumizi ya jeni. Uwezo wa matokeo ya juu na usahihi wa Illumina mpangilio unaiweka kama msingi katika utafiti wa genomics, kuwawezesha wanasayansi kuibua utata wa jenomu kwa maelezo na ufanisi usio na kifani.

Huduma yetu ya kupanga mpangilio wa maktaba iliyotengenezwa awali huwezesha wateja kutayarisha maktaba za mpangilio kutoka vyanzo mbalimbali (mRNA, genome nzima, amplicon, maktaba 10x, miongoni mwa nyinginezo). Baadaye, maktaba hizi zinaweza kusafirishwa kwa vituo vyetu vya mpangilio kwa udhibiti wa ubora na mpangilio katika mifumo ya Illumina.

Wasiliana Nasi

Maelezo ya Huduma

Matokeo ya Onyesho

Vipengele

●Majukwaa:Illumina NovaSeq 6000 na NovaSeq X Plus

●Njia za mpangilio:PE150 na PE250

●Udhibiti wa ubora wa maktaba kabla ya mpangilio

●Mpangilio wa data ya QC na uwasilishaji:utoaji wa ripoti ya QC na data mbichi katika umbizo la fastq baada ya kutenganisha na kuchuja usomaji wa Q30

Faida za Huduma

●Usawa wa huduma za mpangilio:mteja anaweza kuchagua kufululiza kwa njia, seli ya mtiririko, au kwa kiasi cha data inayohitajika (kufuatana kwa njia ya sehemu).

●Uzoefu wa kina kwenye jukwaa la mpangilio la Illumina:na maelfu ya miradi iliyofungwa yenye aina mbalimbali.

●Uwasilishaji wa ripoti ya mpangilio wa QC:na vipimo vya ubora, usahihi wa data na utendaji wa jumla wa mradi wa mpangilio.

●Mchakato wa mpangilio wa watu wazima:na muda mfupi wa kuzunguka.

●Udhibiti Madhubuti wa Ubora: tunatekeleza mahitaji madhubuti ya QC ili kuhakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa juu mfululizo.

Sampuli za Majukwaa

Jukwaa	Kiini cha mtiririko	Hali ya mpangilio	Kitengo	Kadirio la matokeo
NovaSeq X	10B (njia 8)	PE150	Njia Moja Njia ya Sehemu	375Gb / Njia
NovaSeq X	25B (njia 8)	PE150	Njia Moja Njia ya Sehemu	1000 Gb/Njia
NovaSeq 6000	Seli ya mtiririko wa SP (njia 2)	PE250	Kiini cha mtiririko Njia Moja Njia ya Sehemu	325-400 M inasoma / Lane
NovaSeq 6000	Kiini cha mtiririko wa S4 (vichochoro 4)	PE150	Kiini cha mtiririko Njia Moja Njia ya Sehemu	~800 Gb / Lane

Mahitaji ya Sampuli

	Kiasi cha data (X)	Kuzingatia (qPCR/nM)	Kiasi
Mpangilio wa Njia Sehemu	X ≤ 10 Gb	≥ 1 nM	≥ 25 μl
	Gb 10 < X ≤ 50 Gb	≥ 2 nM	≥ 25 μl
	Gb 50 < X ≤ 100 Gb	≥ 3 nM	≥ 25 μl
	X > 100 Gb	≥ 4 nM	≥ 25 μl
Mpangilio wa Njia	Kwa Lane	≥ 1.5 nM / bwawa la maktaba	≥ 25 μl / bwawa la maktaba

Mbali na mkusanyiko na kiasi cha jumla, muundo unaofaa wa kilele pia unahitajika.

Kumbuka: Mpangilio wa njia wa maktaba za anuwai ya chini unahitaji kuongeza kasi ya PhiX ili kuhakikisha upigaji simu wa msingi thabiti.

Tunapendekeza uwasilishe maktaba zilizokusanywa mapema kama sampuli. Ikiwa unahitaji BMKGENE kutekeleza mkusanyiko wa maktaba, tafadhali rejelea

mahitaji ya maktaba kwa mpangilio wa sehemu ya njia.

Ukubwa wa Maktaba (Ramani ya kilele)

Kilele kikuu kinapaswa kuwa ndani ya 300-450 bp.
Maktaba zinapaswa kuwa na kilele kikuu kimoja, hakuna uchafuzi wa adapta na hakuna vipima vya kwanza.

Tafadhali wasiliana nasi ikiwa sampuli zako hazikidhi mahitaji ya nyenzo ya kuanzia.

Wasiliana nasi

Mtiririko wa kazi wa huduma

Udhibiti wa ubora wa maktaba

Kufuatana

Udhibiti wa ubora wa data

Utoaji wa mradi

Iliyotangulia: Mpangilio wa DNA/RNA -PacBio Sequencer

Inayofuata: Mpangilio wa DNA/RNA - Nanopore Sequencer

Ripoti ya QC ya Maktaba

Ripoti juu ya ubora wa maktaba hutolewa kabla ya kupanga, kutathmini kiasi cha maktaba, na kugawanyika.

Inafuatana na ripoti ya QC

Jedwali 1. Takwimu za mpangilio wa data.

Kitambulisho cha mfano	BMKID	Inasoma ghafi	Data Ghafi (bp)	Usomaji safi (%)	Q20(%)	Q30(%)	GC(%)
C_01	BMK_01	22,870,120	6,861,036,000	96.48	99.14	94.85	36.67
C_02	BMK_02	14,717,867	4,415,360,100	96.00	98.95	93.89	37.08