Bidhaa

Maktaba zilizotengenezwa tayari za Illumina

Teknolojia ya mpangilio wa Illumina, inayotegemea Sequencing by Synthesis (SBS), ni uvumbuzi wa NGS unaokubalika duniani kote, unaohusika na kuzalisha zaidi ya 90% ya data ya mpangilio wa dunia. Kanuni ya SBS inahusisha kupiga picha vimalizio vinavyoweza kurekebishwa vyenye lebo ya fluorescent kadri kila dNTP inavyoongezwa, na baadaye kukatwa ili kuruhusu kuingizwa kwa msingi unaofuata. Kwa dNTP zote nne zinazoweza kurekebishwa zilizopo katika kila mzunguko wa mpangilio, ushindani wa asili hupunguza upendeleo wa ujumuishaji. Teknolojia hii inayobadilika inasaidia maktaba za kusoma moja na za mwisho uliooanishwa, ikihudumia matumizi mbalimbali ya jenomu. Uwezo wa juu wa upitishaji na usahihi wa Illumina sequencing unaiweka kama msingi katika utafiti wa jenomu, na kuwawezesha wanasayansi kufichua ugumu wa jenomu kwa undani na ufanisi usio na kifani.

Huduma yetu ya mpangilio wa maktaba iliyotengenezwa tayari inawawezesha wateja kuandaa maktaba za mpangilio kutoka vyanzo mbalimbali (mRNA, jenomu nzima, amplicon, maktaba 10x, miongoni mwa zingine). Baadaye, maktaba hizi zinaweza kusafirishwa hadi vituo vyetu vya mpangilio kwa ajili ya udhibiti wa ubora na mpangilio katika mifumo ya Illumina.

Wasiliana Nasi

Maelezo ya Huduma

Matokeo ya Onyesho

Vipengele

●Majukwaa:Illumina NovaSeq 6000 na NovaSeq X Plus

●Njia za mpangilio:PE150 na PE250

●Udhibiti wa ubora wa maktaba kabla ya kupanga mpangilio

●Kupangilia QC ya data na uwasilishaji:Uwasilishaji wa ripoti ya QC na data ghafi katika umbizo la fastq baada ya kutenganisha na kuchuja usomaji wa Q30

Faida za Huduma

●Utofauti wa huduma za Mfuatano:Mteja anaweza kuchagua kupanga kwa mpangilio wa njia, seli ya mtiririko, au kwa kiasi cha data kinachohitajika (mfuatano wa njia isiyo kamili).

●Uzoefu mkubwa kwenye jukwaa la ufuatiliaji wa Illumina:na maelfu ya miradi iliyofungwa yenye spishi mbalimbali.

●Uwasilishaji wa ripoti ya QC ya mpangilio:pamoja na vipimo vya ubora, usahihi wa data na utendaji wa jumla wa mradi wa mpangilio.

●Mchakato wa mpangilio wa watu wazima:kwa muda mfupi wa kugeuka.

●Udhibiti Mkali wa Ubora: Tunatekeleza mahitaji madhubuti ya QC ili kuhakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa hali ya juu kila wakati.

Mifumo ya Mfano

Jukwaa	Seli ya Mtiririko	Hali ya mpangilio	Kitengo	Makadirio ya matokeo
NovaSeq X	10B (njia 8)	PE150	Njia Moja Njia ya Sehemu	375Gb / Njia
NovaSeq X	25B (njia 8)	PE150	Njia Moja Njia ya Sehemu	1000 Gb/Njia
NovaSeq 6000	Seli ya mtiririko wa SP (njia 2)	PE250	Seli ya Mtiririko Njia Moja Njia ya Sehemu	Usomaji wa mita 325-400 / Njia
NovaSeq 6000	Seli ya mtiririko wa S4 (njia 4)	PE150	Seli ya Mtiririko Njia Moja Njia ya Sehemu	~800 Gb / Njia

Mahitaji ya Sampuli

	Kiasi cha Data (Gb)	Kiunganishi (qPCR) PE150	Kiunganishi (qPCR) PE250	Kiasi
Njia ya Sehemu	G ≤ 10	≥ 1 nM	≥ 2nM	≥ 25 μl
	10 < G ≤ 50	≥ 2 nM	≥ 3nM	≥ 25 μl
	50 < G ≤ 100	≥ 3 nM	≥ 4nM	≥ 25 μl
	G > 100	≥ 4 nM	≥ 4nM	≥ 25 μl
Njia Moja	Kwa Kila Njia	≥ 1.5 nM/bwawa la maktaba	≥ 2 nM/bwawa la maktaba	≥ 25 µL/Dimbwi la Maktaba

Mbali na mkusanyiko na jumla ya kiasi, muundo unaofaa wa kilele pia unahitajika.

Kumbuka: Upangaji wa njia za maktaba zenye utofauti mdogo unahitaji uongezaji wa PhiX ili kuhakikisha upigaji kura imara.

Tunapendekeza kuwasilisha maktaba zilizounganishwa tayari kama sampuli za mpangilio wa njia. Ukihitaji BMKGENE kufanya mpangilio wa njia za maktaba, tafadhali rejelea mahitaji ya maktaba ya mpangilio wa njia zisizo kamili.

Ukubwa wa Maktaba (Ramani ya kilele)

Kwa mpangilio wa PE150, ukubwa wa ingizo unapaswa kuwa bp 300–400 (bila kujumuisha adapta); kwa mpangilio wa PE250, ukubwa wa ingizo unapaswa kuwa bp 150–500 (bila kujumuisha adapta).
Maktaba zinapaswa kuwa na kilele kimoja kikuu, bila uchafuzi wa adapta na bila vipimo vya primer.

Tafadhali wasiliana nasi ikiwa sampuli zako hazikidhi mahitaji ya nyenzo za kuanzia.

Wasiliana nasi

Mtiririko wa Huduma

Udhibiti wa ubora wa maktaba

Mfuatano

Udhibiti wa ubora wa data

Uwasilishaji wa mradi

Iliyotangulia: Mfuatano wa DNA/RNA - Mfuatano wa PacBio

Inayofuata: Mfuatano wa DNA/RNA - Mfuatano wa Nanopore

Ripoti ya QC ya Maktaba

Ripoti kuhusu ubora wa maktaba hutolewa kabla ya kupanga mfuatano, kutathmini kiasi cha maktaba, na kugawanyika.

Ripoti ya QC ya mpangilio

Jedwali 1. Takwimu kuhusu data ya mpangilio.

Kitambulisho cha Mfano	BMKID	Masomo ghafi	Data Mbichi (bp)	Masomo safi (%)	Q20(%)	Q30(%)	GC(%)
C_01	BMK_01	22,870,120	6,861,036,000	96.48	99.14	94.85	36.67
C_02	BMK_02	14,717,867	4,415,360,100	96.00	98.95	93.89	37.08