Bidhaa

Mpangilio wa DNA/RNA - Nanopore Sequencer

Mpangilio wa DNA/RNA - Picha Iliyoangaziwa ya Nanopore Sequencer

Mfuatano wa ONT ni molekuli moja ya teknolojia ya mpangilio wa mawimbi ya wakati halisi ya umeme kulingana na nanopores, kanuni ya mpangilio wa kila jukwaa ni sawa.DNA/RNA yenye nyuzi-mbili itafunga kwa protini ya nanoporous iliyopachikwa kwenye biofilm na kujifungua chini ya uongozi wa protini ya injini, chini ya hatua ya tofauti ya voltage kutoka pande zote mbili za biofilm, nyuzi za DNA/RNA hupitia protini ya chaneli ya nanopore kwa muda fulani. kiwango.Kutokana na tofauti za sifa za kemikali za besi tofauti kwenye strand ya DNA/RNA, wakati msingi mmoja au molekuli ya DNA inapita kupitia njia ya nanopore, itasababisha mabadiliko ya ishara tofauti za umeme.Kwa kugundua na kuendana na ishara hizi, aina za msingi zinazolingana zinaweza kuhesabiwa, na utambuzi wa wakati halisi wa mlolongo unaweza kukamilika.

Wasiliana nasi

Maelezo ya Huduma

Matokeo ya Onyesho

Vipengele vya Maelezo ya Huduma

Jukwaa	Ukubwa wa Maktaba	Mazao ya Data ya Kinadharia (Kwa Kila Seli)	Usahihi wa msingi mmoja	Maombi
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Kisanduku	85-92%	Kupiga simu kwa SV, De novo, Mfuatano wa urefu kamili, Iso-Seq, Maelezo ya jeni, Utambuzi wa methylation ya DNA

Faida za Huduma

● Tajriba ya zaidi ya miaka 5 kwenye jukwaa la mpangilio la PacBio lenye maelfu ya miradi iliyofungwa yenye spishi mbalimbali.
● BMKGENE ni mshirika rasmi wa Oxford Nanopore, aliye na uthibitishaji wa mifumo miwili ya RNA/DNA.
● Kuna miundo ya kawaida ya wafuataji mpangilio wenye vifaa kamili na mtiririko wa kutosha wa mpangilio.
● Kulingana na mfumo wa Nanopore, zaidi ya tafiti 10 za wanyama na mimea za Denovo zimechapishwa katika majarida mashuhuri kimataifa.

Mahitaji ya Sampuli

Aina ya Sampuli

Kiasi

Kuzingatia(Qubit ®)

Kiasi

Usafi

Wengine

DNA ya Genomic

Inategemea Mahitaji ya Data

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Futa kilele cha 260 nm, hakuna uchafuzi

Umakini unahitaji kupimwa kwa Qubit na Qubit/Nanopore ≤ 2

Jumla ya RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; hakuna uchafuzi

Thamani ya RIN ≥7.5

Mtiririko wa kazi wa huduma

Maandalizi ya sampuli

Ujenzi wa maktaba

Kufuatana

Uchambuzi wa data

Utoaji wa mradi

Iliyotangulia: Mpangilio wa DNA/RNA - Mfuatano wa Illumina

Inayofuata: Mpangilio Maalum wa Kipande Kilichokuzwa cha Locus (SLAF-Seq)

Tathmini ya Ubora wa Data ya Sampuli ya DNA

Jedwali 1. Takwimu za data safi.

BMKID	ghafiSeqNum	rawSumBase	safiSeqNum	safiSumBase	safiN50Len	safiN90Len	safiMeanLen	safiMaxLen	safiMaanaQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9