-
Mpangilio wa Kinga ya Chromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq hutoa maelezo mafupi ya kinasaba ya malengo ya DNA kwa urekebishaji wa histone, vipengele vya unukuzi na protini nyingine zinazohusiana na DNA.Inachanganya uteuzi wa chromatin immuno-precipitation (ChIP) ili kurejesha chanjo mahususi za protini-DNA, kwa uwezo wa mfuatano wa kizazi kijacho (NGS) kwa upangaji wa matokeo ya juu wa DNA iliyorejeshwa.Zaidi ya hayo, kwa sababu muundo wa protini-DNA hupatikana kutoka kwa chembe hai, tovuti zinazofunga zinaweza kulinganishwa katika aina tofauti za seli na tishu, au chini ya hali tofauti.Maombi huanzia kwa udhibiti wa maandishi hadi njia za ukuzaji hadi mifumo ya ugonjwa na zaidi.
Jukwaa: Illumina NovaSeq 6000
-
Mpangilio mzima wa bisulfite wa jenomu
DNA methylation katika nafasi ya tano katika cytosine (5-mC) ina ushawishi msingi juu ya kujieleza jeni na shughuli za seli.Mifumo isiyo ya kawaida ya methylation imehusishwa na hali na magonjwa kadhaa, kama saratani.WGBS imekuwa kiwango cha dhahabu cha kusoma methylation ya genome-wide katika azimio moja la msingi.
Jukwaa: Illumina NovaSeq6000
-
Uchambuzi wa Chromatin Inayopatikana kwa Transposase yenye Mipangilio ya Juu ya Kupitisha (ATAC-seq)
ATAC-seq ni mbinu ya upangaji wa matokeo ya juu ya uchanganuzi wa ufikivu wa kromatini katika upana wa genome, ambayo ni muhimu kwa udhibiti wa epijenetiki wa kimataifa wa usemi wa jeni.Adapta za mpangilio huingizwa kwenye maeneo ya kromatini iliyo wazi na transposase ya Tn5 inayofanya kazi kupita kiasi.Baada ya ukuzaji wa PCR, maktaba ya mpangilio hujengwa.Maeneo yote ya kromatini yaliyo wazi yanaweza kupatikana chini ya hali mahususi ya muda wa nafasi, sio tu kwa tovuti zinazofungamana na kipengele cha unukuzi, au eneo fulani la historia iliyobadilishwa.
-
Mfuatano uliopunguzwa wa Uwakilishi wa Bisulfite (RRBS)
Utafiti wa methylation ya DNA daima imekuwa mada moto katika utafiti wa magonjwa, na inahusiana kwa karibu na usemi wa jeni na sifa za pheno-typic.RRBS ni njia sahihi, bora na ya kiuchumi kwa utafiti wa methylation ya DNA.Uboreshaji wa maeneo ya visiwa vya mkuzaji na CpG kwa kupasua kwa enzymatic (Msp I), pamoja na mpangilio wa Bisulfite, hutoa utambuzi wa juu wa methylation ya DNA.
Jukwaa: Illumina NovaSeq 6000
