Ingia kwenye BMKCloud

Bidhaa

Mpangilio Mrefu Usiotumia Msimbo-Illumina

Picha Iliyoangaziwa ya Illumina, Mpangilio Mrefu Usiotumia Msimbo

RNA ndefu zisizo na usimbaji (lncRNAs) zina urefu wa zaidi ya nyukleotidi 200 ambazo zina uwezo mdogo wa usimbaji na ni vipengele muhimu ndani ya RNA isiyo na usimbaji. Zikipatikana katika kiini na saitoplazimu, RNA hizi zina jukumu muhimu katika udhibiti wa epijenetiki, unukuzi, na baada ya unukuzi, zikisisitiza umuhimu wao katika kuunda michakato ya seli na molekuli. Mfuatano wa LncRNA ni zana yenye nguvu katika utofautishaji wa seli, Ontogenesis, na magonjwa ya binadamu.

Jukwaa: Illumina NovaSeq X

Wasiliana Nasi

Maelezo ya Huduma

Bioinformatiki

Matokeo ya Onyesho

Machapisho Yaliyoangaziwa

Faida za Huduma

●Uchambuzi wa pamoja wa mRNA na lncRNA: kwa kuchanganya upimaji wa nakala za mRNA na utafiti wa lncRNA na malengo yake, inawezekana kupata muhtasari wa kina wa utaratibu wa udhibiti unaozingatia mwitikio wa seli.

●Utaalamu wa Kina: Tumechakata zaidi ya sampuli 230,000, zikijumuisha sampuli mbalimbali na malengo ya miradi. Tunaleta utajiri wa utaalamu kwa kila mradi.

●Uchambuzi wa pamoja wa mRNA na lncRNA: Tunachanganya upimaji wa nakala za mRNA na utafiti wa lncRNA na malengo yake, na hivyo kuwezesha kupata muhtasari wa kina wa utaratibu wa udhibiti unaozingatia mwitikio wa seli.

●Udhibiti Mkali wa Ubora: Tunatekeleza vipengele vya udhibiti mkuu katika hatua zote, kuanzia utayarishaji wa sampuli hadi utayarishaji wa maktaba, mpangilio na bioinformatiki. Ufuatiliaji wetu wa kina unahakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa hali ya juu kila mara.

●Maelezo Kamili: Tunatumia hifadhidata nyingi ili kufafanua Jeni Zilizoonyeshwa Tofauti (DEGs) kwa utendaji kazi na kufanya uchanganuzi unaolingana wa uboreshaji. Mbinu hii pana hutoa maarifa kuhusu michakato ya seli na molekuli inayoongoza mwitikio wa transcriptome, kuhakikisha unapata taarifa zote zinazowezekana kuhusu data ya jaribio lako.

●Usaidizi wa Baada ya Mauzo: Tunaelewa umuhimu wa kuwepo, ndiyo maana ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha huduma cha miezi 3 baada ya mauzo. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi wa matatizo, na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.

Mahitaji ya Sampuli na Uwasilishaji

Maktaba	Jukwaa	Data iliyopendekezwa	QC ya Data
maktaba ya mwelekeo iliyopunguzwa na rRNA	Illumina PE150	10-16 Gb	Q30≥85%

Nyukleotidi:

Kikomo (ng/μl)

Kiasi (μg)

Usafi

Uadilifu

≥ 80

≥ 0.8

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Uchafuzi mdogo au hakuna protini au DNA unaoonyeshwa kwenye jeli.

RIN≥6.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

mwinuko mdogo au hakuna msingi

● Mimea:

Mzizi, Shina au Petali: 450 mg

Jani au Mbegu: 300 mg

Matunda: 1.2 g

● Mnyama:

Moyo au Utumbo: 450 mg

Viscera au Ubongo: 240 mg

Misuli: 600 mg

Mifupa, Nywele au Ngozi: 1.5g

● Arthropodi:

Wadudu: 9g

Krustasia: 450 mg

● Damu nzima:Mirija 2

● Seli: 10⁶seli

● Seramu na Plasma: 6 mL

Uwasilishaji wa Sampuli Uliopendekezwa

Chombo: Mrija wa sentrifuge wa mililita 2 (Foili ya bati haipendekezwi)

Uwekaji lebo wa sampuli: Kundi+nakili k.m. A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Usafirishaji:

1. Barafu kavu: Sampuli zinahitaji kupakiwa kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.

2. Mirija ya RNAstable: Sampuli za RNA zinaweza kukaushwa kwenye mrija wa uthabiti wa RNA (km RNAstable®) na kusafirishwa kwenye halijoto ya kawaida.

Mtiririko wa Kazi ya Huduma

Ubunifu wa majaribio

Uwasilishaji wa sampuli

Uchimbaji wa RNA

Ujenzi wa maktaba

Mfuatano

Uchambuzi wa data

Huduma za baada ya mauzo

Iliyotangulia: Mfuatano Ndogo wa RNA-Illumina

Inayofuata: Mpangilio wa mRNA usiotegemea marejeleo-NGS

Bioinformatiki

Data ghafi
QC ya Data
Mpangilio wa jenomu
Muundo wa jeni (Uunganishaji mbadala, uboreshaji wa muundo wa jeni na utabiri mpya wa jeni)
Upimaji wa usemi wa jeni
Uchambuzi wa usemi tofauti
Maelezo na uboreshaji wa DEG + Jeni lengwa la lncRNA lenye utofautishaji
Utambulisho wa nakala
Utambuzi wa lncRNA (uhifadhi wa lncRNA na lncRNA inayojulikana)
Utabiri wa jeni lengwa la lncRNA
Upimaji wa usemi wa lncRNA
Uchambuzi wa pamoja na data ya mRNA

Uchambuzi wa Usemi Tofauti wa Jeni (DEGs)

Upimaji wa usemi wa lncRNA - mkusanyiko

Uboreshaji wa jeni lengwa za lncRNA

Uchambuzi wa nafasi ya mRNA na lncRNA ya pamoja - Mchoro wa Circos (mduara wa kati ni mRNA na cicrlce ya ndani ni lncRNA)

Chunguza maendeleo yaliyowezeshwa na huduma za upangaji wa lncRNA za BMKGene kupitia mkusanyiko wa machapisho yaliyochaguliwa.

Ji, H. et al. (2020) 'Utambuzi, utabiri wa utendaji kazi, na uthibitishaji muhimu wa lncRNA wa lncRNA zinazohusiana na msongo wa mawazo baridi katika ini la panya',Ripoti za Kisayansi2020 10:1, 10(1), uk. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.

Jia, Z. et al. (2021) 'Uchambuzi Jumuishi wa Transcriptomic Unafichua Mfumo wa Kinga kwa Mzoga wa Kawaida wa Carp Unaostahimili CyHV-3',Mipaka katika Kinga Mwilini, 12, uk. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.

Wang, XJ et al. (2022) 'Upaumbele Unaotegemea Ujumuishaji wa Multi-Omics wa Mitandao ya Udhibiti wa RNA Endogenous katika Saratani ya Mapafu ya Seli Ndogo: Sifa za Masi na Wagombea wa Dawa',Mipaka katika Oncology, 12, uk. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

Xiao, L. et al. (2020) 'Ugawanyaji wa kijenetiki wa mtandao wa usemi wa jeni unaozingatia usanisinuru katika Populus',Jarida la Bioteknolojia ya Mimea, 18(4), uk. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.

Zheng, H. et al. (2022) 'Mtandao wa Udhibiti wa Kimataifa wa Usemi wa Jeni Ulioharibika na Ishara Isiyo ya Kawaida ya Kimetaboliki katika Seli za Kinga katika Mazingira Madogo ya Ugonjwa wa Graves na Tiroiditi ya Hashimoto',Mipaka katika Kinga Mwilini, 13, uk. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.