Metabolomiki
Vipengele
●Sio-Metabolomiki Lengwa (Metaboliki za Ugunduzi)
Kulingana na teknolojia ya kromatografia-spektrometri ya umati wa kioevu (LC-MS), metabolomiki zisizolengwa huwezesha ugunduzi usioegemea upande wowote wa metaboliti nyingi ndogo za molekuli iwezekanavyo katika sampuli za kibiolojia kama vile seli, tishu, viungo, au majimaji ya mwili. Inafanya uchanganuzi wa kulinganisha kati ya vikundi vya majaribio na vya udhibiti, huchunguza metaboliti tofauti kupitia uchanganuzi wa takwimu.
● Metabolomiki Isiyolengwa kwa Lipidi
Kutumia teknolojia ya kromatografia-spektrometri ya umati wa kioevu (LC-MS),nMetabolomiki za Lipidi zinazolengwa hufikia ugunduzi usioegemea upande wowote wa molekuli nyingi za lipidi iwezekanavyo katika sampuli za kibiolojia ikijumuisha seli, tishu, viungo, au majimaji ya mwili.
● Pana-Metabolomiki Zilizolengwa
Huduma hii inachanganya kikamilifu faida za teknolojia isiyolengwa zenye ubora wa hali ya juu na upana wa upimaji pamoja na unyeti wa hali ya juu na uwezo sahihi wa upimaji wa teknolojia ya MRM (Ufuatiliaji wa Miitikio Mingi). Mtiririko wa kazi ni kama ifuatavyo: Kwanza, spektrometri ya umati yenye ubora wa hali ya juu hutumika kufanya uchanganuzi wa MS² wenye ubora wa hali ya juu kwenye sampuli ili kupata spektrometri za MS² za metaboliti "zote". Kisha, utambuzi sahihi wa metaboliti unafanywa kwa kuchanganya na maktaba ya MS² yenye ubora wa hali ya juu (inayofunika zaidi ya metaboliti 25,000, na spektrometri nyingi za kawaida zenye ubora wa hali ya juu za MS² kwa kila metaboliti). Ifuatayo, taarifa za jozi ya ioni za MRM hutolewa kutoka kwa spektrometri ya umati ili kuanzisha maktaba maalum kwa ajili ya sampuli. Hatimaye, spektrometri ya umati wa quadrupole tatu yenye teknolojia ya MRM inatumika kwa upimaji sahihi.
● Metabolomiki Zilizolengwa
Metabolomiki zinazolengwa huzingatia misombo kadhaa lengwa au metaboliti zote/sehemu zinazohusika katika njia maalum. Kwa kutumia vitu vya kawaida, huanzisha mbinu ya kugundua yenye umaalum mkubwa, unyeti wa juu, na kurudiwa vizuri kwa upimaji na uchambuzi wa misombo lengwa. Inatumia kiwango cha nje pamoja na kiwango cha ndani kwa upimaji kamili, huku mstari wa mkunjo wa kawaida ukifikia zaidi ya 0.99 na unyeti ukifikia kiwango cha ng/mL.
Faida
●Jukwaa la Ugunduzi wa Kina
-Zikiwa na spektromita za uzito zenye ubora wa juu na spektromita za uzito wa quadrupole tatu, zinazowezesha ugunduzi na uchambuzi wa maelfu ya metaboliti kwa wakati mmoja.
●Hifadhidata Kamili
- Hifadhidata za Umma: Zinafunika METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas, na Lipidmaps, zikijumuisha zaidi ya metaboliti 500,000.
- Ndani ya nyumbaHifadhidata Maalum ya Mimea: Ina zaidi ya metaboliti 25,000, ikiwa ni pamoja na metaboliti za msingi na sekondari.
- Ndani ya nyumbaHifadhidata Maalum kwa Wanyama/Kimatibabu: Inajumuisha zaidi ya metaboliti 12,000.
●Mfumo Kali wa Udhibiti wa Ubora
-Udhibiti mkali wa ubora unaofunika uthabiti wa kifaa, mabaki ya dutu, PCA ya sampuli ya QC na uchambuzi wa uwiano ili kuhakikisha ubora wa data unaoaminika.
●Uwezo wa Kugundua Metaboliti kwa Kiwango cha Juu
- Sio-Metabolomiki Lengwa: Hugundua wastani wa zaidi ya metaboliti 4,200 kwa kila jaribio, bora kwa kuchunguza metaboliti zisizojulikana katika sampuli na kutambua metaboliti katika sampuli changamano.
- Pana-Metabolomiki Zilizolengwa (Mimea): Hugundua wastani wa zaidi ya metaboliti 2,410 kwa kila kipindi, ikijumuisha metaboliti za msingi na za sekondari.
- Pana-Metabolomiki Zilizolengwa (Mnyama): Hugundua wastani wa zaidi ya metaboliti 1,250 kwa kila kipindi.
- Metabolomiki Zilizolengwa: Panelikwakategoria nyingi za kimetaboliki.
●Uchambuzi Kamili
-Inatoa zaidi ya vipengee 10 vya uchambuzi na chati zaidi ya 20 za taswira.
●Huduma ya Baada ya Mauzo Yenye Mawazo
-Hutoa ushauri wa baada ya mauzo na usaidizi wa tafsiri ya ripoti ya mwisho.
Vipimo vya Huduma
| Suluhisho | Jukwaa | Nakala za kibiolojia zinazopendekezwa |
|---|---|---|
| Metabolomiki Isiyolengwa | UHPLC-TOF-MS (Maji Xevo G2-XS QTof) | Sampuli ya mimea na vijidudu: ≥ 6 Sampuli ya wanyama: ≥ 10 Sampuli ya kliniki: ≥ 30 Sampuli zote za kibiolojia zinazojirudia zilichambuliwa kwa kujitegemea. |
| Metabolomiki Zilizolengwa kwa Upana | Maji Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | Sampuli ya mmea: ≥ 3 |
| Metabolomiki Zilizolengwa | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | Sampuli ya mmea: ≥ 3 Sampuli ya wanyama: ≥ 6 |
Mahitaji ya Sampuli
Je, unajiuliza kama sampuli zako zinakidhi vigezo vyetu? Bofya hapa ili kupatamahitaji ya hivi karibuni ya sampuli.
Mtiririko wa Kazi ya Huduma
Mkusanyiko wa Sampuli
Uchimbaji wa Metaboliti
Upatikanaji wa Data
Uchambuzi wa Data
Uwasilishaji wa Data
1. Kelele ya mandharinyuma na usindikaji wa data ghafi usio na ubora wa hali ya juu
2. Tathmini ya Ubora wa Data
2.1 Uchambuzi wa vipengele vikuu
2.2 Tathmini ya urejelezaji
3. Maelezo ya Metaboliti
3.1 Maelezo ya hifadhidata ya KEGG
3.2 Maelezo ya hifadhidata ya HMDB
3.3 Maelezo ya hifadhidata ya Lipidmaps
4. Sampuli ya Uchambuzi wa Data za Kundi (nakala za kibiolojia≥3)
4.1 Uchambuzi wa vipengele vikuu vya kikundi
4.2 Uchambuzi wa ubaguzi wa miraba midogo isiyo na sehemu ya orthogonal (OPLS-DA)
4.3 Uchambuzi wa metaboliti tofauti za kikundi
5. Uteuzi Tofauti wa Metaboliti (nakala za kibiolojia≥3)
5.1 Uchambuzi wa mabadiliko ya tofauti ya mikunjo
5.2 Mchoro tofauti wa volkano ya metaboliti
5.3 Ramani ya joto ya mkusanyiko wa metaboliti tofauti
5.4 Mchoro tofauti wa uwiano wa kimetaboliki
5.5 Kipimo tofauti cha metaboliti ya alama ya Z
5.6 Uchambuzi wa rada ya metaboli tofauti
5.7 Mchoro tofauti wa fidla ya metaboliti
5.8 Mchoro wa kisanduku cha metaboliti tofauti
5.9 Uchambuzi wa utendaji kazi wa KEGG wa kimetaboliki tofauti na uchanganuzi wa utajiri
5.10 Uchambuzi wa mkunjo wa ROC
5.11 Uainishaji tofauti wa metaboliti k-means
5.12 Mchoro wa Venn wa kimetaboliki tofauti
1. Tathmini ya Ubora wa Data
↑Cuchambuzi wa uhusiano(Mtihani wa sampuli/sampuli ya QC)
↑Uchambuzi wa vipengele vikuu ↑Uchambuzi wa makundi ya metaboliti
2. Maelezo ya Metaboliti
↑ Maelezo ya hifadhidata ya KEGG↑Ufafanuzi wa hifadhidata ya HMDB
↑Ufafanuzi wa hifadhidata ya Lipidmaps
3. Sampuli ya Uchambuzi wa Data za Kundi (nakala za kibiolojia≥3)
↑Uchambuzi wa vipengele vikuu vya kikundi(2D/3D)
↑Uchambuzi wa ubaguzi wa miraba midogo isiyo na sehemu ya orthogonal (OPLS-DA)
4. Uteuzi Tofauti wa Metaboliti (nakala za kibiolojia≥3)
↑Uchambuzi wa mabadiliko ya mkunjo tofauti↑Njama tofauti ya volkano ya metaboliti
↑Ramani ya joto ya mkusanyiko wa metaboliti tofauti↑Mchoro tofauti wa uwiano wa kimetaboliki
↑Kielelezo tofauti cha metaboliti ya alama ya Z↑Uchambuzi tofauti wa mpangilio wa rada wa metaboliti
↑Mchoro tofauti wa violin wa metabolite↑Mchoro tofauti wa kisanduku cha metaboliti
↑Uchambuzi wa utendaji kazi wa KEGG wa kimetaboliki tofauti na uchanganuzi wa utajiri
↑Uchambuzi wa mkunjo wa ROC↑Uunganishaji tofauti wa metaboliti k-means
↑Mchoro wa Venn wa metabolite tofauti
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. Kipengele cha unukuzi cha homeodomain kinachofanana na BEL1 SAWTOOTH1 (MdSAW1) katika Malus domestica huongeza uvumilivu wa tufaha la transgenic na Arabidopsis kwa msongo wa zinki kupita kiasi. Int J Biol Macromol. 2025 Mei;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025 Machi 10. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. Athari shirikishi ya chembe chembe za kijani kibichi zinazosababishwa na Moringa oleifera na kuvu wa arbuscular mycorrhizal kwenye ukuaji, usanifu wa mfumo wa mizizi, na ufyonzaji wa virutubisho katika mahindi (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. 2025 Sep;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 2025 Mei 24. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. Jasmonate huamsha moduli inayofanana na SlJAZ2/3-SlMYC3 inayodhibiti ufyonzaji wa K+ katika mwitikio wa nyanya kwa msongo mdogo wa K+. J Integr Plant Biol. Agosti 2025;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 2025 Mei 28. PMID: 40432500.
