BMKCloud Ingia

Bidhaa

Mpangilio wa Metatranscriptome

Teknolojia ya kupanga mpangilio ya Illumina, huduma ya BMKGENE ya kupanga mpangilio wa metaranscriptome inafichua usemi wa jeni unaobadilika wa safu mbalimbali za vijidudu, kuanzia yukariyoti hadi prokariyoti na virusi, ndani ya mazingira asilia kama vile udongo, maji, bahari, kinyesi na utumbo. Huduma yetu ya kina huwapa watafiti uwezo wa kutafakari wasifu kamili wa usemi wa jeni wa jumuiya za viumbe vidogo. Zaidi ya uchanganuzi wa kanuni, huduma yetu ya upangaji wa metaranscriptome hurahisisha uchunguzi katika uboreshaji wa utendaji kazi, kutoa mwanga juu ya jeni zilizoonyeshwa kwa njia tofauti na majukumu yao. Gundua maarifa mengi ya kibaolojia unapopitia mandhari changamano ya usemi wa jeni, uanuwai wa takolojia, na mienendo ya utendaji ndani ya maeneo haya mbalimbali ya mazingira.

Wasiliana Nasi

Maelezo ya Huduma

Bioinformatics

Matokeo ya Onyesho

Machapisho yaliyoangaziwa

Vipengele vya Huduma

● Kupungua kwa rRNA ikifuatiwa na maandalizi ya maktaba ya mRNA ya mwelekeo.

● Kufuatana kwenye Illumina NovaSeq.

Faida za Huduma

●Jifunze Mabadiliko ya Jumuiya za Wadudu wadogo:Hii hutokea katika kiwango cha unukuzi na kuchunguza uwezekano wa jeni mpya.

●Kufafanua Mwingiliano wa Jumuiya ya Microbial na Mwenyeji au Mazingira.

●Uchambuzi wa kina wa Bioinformatiki: Hii hutoa maarifa juu ya utunzi wa jamii na utendaji kazi, pamoja na uchanganuzi tofauti wa usemi wa jeni.

●Ufafanuzi wa Kina wa Jeni:Kwa kutumia hifadhidata za utendakazi wa jeni zilizosasishwa kwa taarifa za taarifa za usemi wa jeni za jumuiya za vijidudu.

●Usaidizi wa Baada ya Mauzo:Ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha huduma cha miezi 3 baada ya kuuza. Katika wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi, na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.

Vipimo vya huduma

Jukwaa la mpangilio	Mkakati wa Kuratibu	Data iliyopendekezwa	Udhibiti wa Ubora wa Data
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Mahitaji ya Sampuli

Kuzingatia (ng/µL)	Jumla ya kiasi (µg)	Kiasi (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Mtiririko wa Kazi ya Huduma

Utoaji wa sampuli

Ujenzi wa maktaba

Kufuatana

Uchambuzi wa data

Huduma za baada ya kuuza

Iliyotangulia: De novo Fungal Genome Assembly

Inayofuata: Mpangilio wa RNA wa Prokaryotic

Inajumuisha uchambuzi ufuatao:

● Kupanga Udhibiti wa Ubora wa Data

● Mkutano wa Nakala

● Ufafanuzi wa Taxonomic na Wingi

● Ufafanuzi wa Utendaji na Wingi

● Ukadiriaji wa Usemi na Uchanganuzi wa Tofauti

Usambazaji wa kijadi wa kila sampuli:

Uchambuzi wa anuwai ya Beta: UPGMA

Ufafanuzi wa kiutendaji - GO wingi

Wingi wa taksonomia tofauti - LEFSE

Gundua maendeleo yanayowezeshwa na huduma za ufuataji wa meta transcriptomics za BMKGene kupitia mkusanyiko ulioratibiwa wa machapisho.

Lu, Z. na wengine. (2023) 'Uvumilivu wa asidi ya bakteria wanaotumia lactate wa mpangilio wa Bacteroidales huchangia kuzuia asidi ya kinyesi kwa mbuzi iliyorekebishwa kwa lishe yenye umakini mkubwa',Lishe ya Wanyama, 14, ukurasa wa 130-140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Wimbo, Z. et al. (2017) 'Kufungua mikrobiota ya msingi inayofanya kazi katika uchachushaji wa hali dhabiti wa kitamaduni kwa amplikoni za upitishaji wa hali ya juu na mpangilio wa mettranscriptomics',Mipaka katika Microbiology, 8(JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

Wang, W. et al. (2022) 'Riwaya ya Mycoviruses Iliyogunduliwa kutoka kwa Utafiti wa Metatranscriptomics wa Kuvu wa Alternaria wa Phytopathogenic',Virusi, 14(11), uk. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. na wengine. (2022) 'Uchambuzi sambamba wa metatranscriptome unaonyesha uharibifu wa metabolites ya pili ya mimea na mende na viungo vyao vya utumbo',Molekuli Ikolojia, 31(15), ukurasa wa 3999-4016. doi: 10.1111/MEC.16557.