mRNA-seq (NGS) - De novo
Mpangilio wa mRNA huruhusu uundaji wa wasifu wa nakala zote za mRNA katika seli chini ya hali maalum na ni teknolojia inayotumika sana katika maeneo mbalimbali ya utafiti. Bomba la mRNA-seq la BMKCloud De novo limeundwa kuchanganua maktaba za mpangilio zilizoimarishwa za poly-A wakati hakuna jenomu ya marejeleo inayopatikana. Bomba huanza na udhibiti wa ubora, ikifuatiwa nade novoMkusanyiko wa nakala na uteuzi wa seti ya unigene. Uchambuzi wa muundo wa unigene hutabiri mfuatano wa msimbo (CDS) na marudio rahisi ya mfuatano (SSR). Baadaye, uchanganuzi wa usemi tofauti hupata jeni zilizoonyeshwa tofauti (DEGs) miongoni mwa hali zilizojaribiwa, ikifuatiwa na ufafanuzi wa utendaji kazi na uboreshaji wa DEGs ili kutoa maarifa ya kibiolojia.
Bioinformatiki