Nanopore Nakala kamili ya maandishi

Mfuatano wa transcriptome ya Nanopore ni njia yenye nguvu ya kupanga cDNA za urefu kamili, kutambua na kupima kwa usahihi isoforms za nakala. Bomba la Transcriptome la BMKCloud Nanopore Full-Length limeundwa kuchanganua data ya RNA-Seq inayozalishwa kwenye jukwaa la Nanopore dhidi ya jenomu ya marejeleo yenye maelezo ya hali ya juu, kutoa uchanganuzi wa ubora na kiasi katika kiwango cha jeni na nakala. Baada ya udhibiti wa ubora, mfuatano usio wa chimeric (FLNC) wa urefu kamili hupatikana na mfuatano wa makubaliano huunganishwa kwenye jenomu ya marejeleo ili kuondoa nakala zisizohitajika. Kutoka kwa seti hii ya nakala, usemi hupimwa na jeni zilizoonyeshwa tofauti na nakala hutambuliwa na kufafanuliwa kiutendaji. Bomba pia linajumuisha uchanganuzi mbadala wa poliadenylation (APA), uchanganuzi mbadala wa splicing, uchanganuzi rahisi wa kurudia mfuatano (SSR), utabiri wa lncRNA na malengo yanayolingana, utabiri wa mfuatano wa msimbo (CDS), uchanganuzi wa familia ya jeni, uchanganuzi wa vipengele vya unukuzi, utabiri wa jeni mpya na maelezo ya kiutendaji ya nakala.