Nakala kamili ya Pacbio

Mfuatano wa Transcriptome wa Urefu Kamili wa PacBio, Isoseq, huwezesha utambuzi sahihi wa isoforms za nakala, kutoa mwanga juu ya uunganishaji na uunganishaji mbadala wa poliadeni na uunganishaji, na kusababisha uchanganuzi sahihi zaidi wa usemi wa jeni. Bomba la Transcriptome la BMKCloud PacBio la Urefu Kamili la PacBio limeundwa kuchanganua maktaba za cDNA zilizopangwa katika hali ya Mfuatano wa Makubaliano ya Mviringo (CCS) na kutambua mfuatano wa Urefu Kamili Usio wa Chimeriki (FLNC), ambao kisha hukusanywa katika nakala zisizo na urejelezaji. Uchanganuzi unaofuata wa BUSCO hutathmini ukamilifu wa mkusanyiko wa transcriptome. Kutoka kwa transcriptome iliyokusanywa, uchanganuzi mwingi hufanywa: uunganishaji mbadala, kurudia mfuatano rahisi (SSR), utabiri wa lncRNA na jeni lengwa zinazolingana, utabiri wa jeni mpya, uchanganuzi wa familia ya jeni, uchanganuzi wa vipengele vya unukuzi, na ufafanuzi wa utendaji kazi wa nakala.