Bidhaa

Mpangilio wa Genome wa Mimea/Wanyama

Mpangilio wa Genome Mzima/Wanyama Picha Iliyoangaziwa

Upangaji upya wa jenomu nzima, pia unajulikana kama WGS, huwezesha kufichuliwa kwa mabadiliko ya kawaida na adimu kwenye jenomu nzima ikijumuisha Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Ufutaji wa Uingizaji (InDel), Utofauti wa Muundo (SV), na Nakili Tofauti ya Namba (CNV). )SVs hufanya sehemu kubwa ya msingi wa tofauti kuliko SNP na kuwa na athari kubwa kwenye jenomu, ambayo ina athari kubwa kwa viumbe hai.Ufuataji uliosomwa kwa muda mrefu huruhusu utambuzi sahihi zaidi wa vipande vikubwa na tofauti changamano kwa sababu usomaji wa muda mrefu hurahisisha zaidi kuvuka kwa kromosomu kwenye maeneo changamano kama vile marudio ya sanjari, maeneo yenye GC/AT-tajiri, na maeneo yanayobadilika sana.

Jukwaa: Illumina, PacBio, Nanopore

Wasiliana nasi

Maelezo ya Huduma

Matokeo ya Onyesho

Uchapishaji ulioangaziwa

1.Faida za Huduma

Uzoefu mkubwa katika mpangilio wa jenomu kwa zaidi ya spishi 1000.

Zaidi ya kesi 800 zilizochapishwa zilizo na sababu ya limbikizo la zaidi ya 4000.

Uchanganuzi wa kina wa bioinformatics juu ya upigaji simu tofauti na uchanganuzi wa utendakazi.

2. Vipimo vya Huduma

Jukwaa		Maktaba	Inapendekezwa seq kina
Illumina		PE 150	Kwa SNP, InDel inapiga simu ≥ 10x Kwa SV, CNY inapiga simu ≥ 30x
Nanopore		8 kb	Kwa SV, CNY inapiga simu ≥ 20x
Pacbio	CCS	15 kb	Kwa SNP, InDel, SV, CNY kupiga simu ≥ 10x

3. Mahitaji ya Sampuli

Jukwaa		Conc.(ng/μL)	Kiasi (ng)	Usafi		Gel ya Agarose
				OD260/280	OD260/230	1. Futa bendi kuu na hakuna au mdogouharibifu unaoonekana kwenye gel. 2. Hakuna au kupunguzwa kwa RNA au uchafuzi wa protini
Illumina		≥1	≥30	-	-
Nanopore		≥30	Inategemea mavuno ya data 10μg / seli	1.7-2.2	≥1.5
Pacbio	CCS	≥50		1.7-2.2	1.8-2.5

4. Uchambuzi wa Taarifa za Kibiolojia

5. Mtiririko wa Kazi ya Huduma

Utoaji wa sampuli

Uchimbaji wa DNA

Ujenzi wa maktaba

Kufuatana

Uchambuzi wa data

Uwasilishaji wa data

Iliyotangulia: Nakala ya Spatial ya BMKMANU S1000

Inayofuata: Mpangilio wa kiini kimoja cha RNA

1) Takwimu za Ramani ya Genome

Jedwali 1 Takwimu za matokeo ya uchoraji ramani

Kielelezo 1 Usambazaji wa ukubwa wa kuingiza na chanjo ya kusoma.

2) Tofauti ya kugundua

Kielelezo cha 2 Takwimu na ufafanuzi wa SNP/INDEL/SV kati ya Sampuli

Kielelezo cha 3 Usambazaji kwa upana wa genome

3) Ufafanuzi wa kazi wa tofauti

2019	Mawasiliano ya asili	Ufuataji wa jenomu nzima unaonyesha asili ya napus ya Brassica na loci ya kijeni inayohusika katika uboreshaji wake
2020	PNAS	Asili ya mageuzi na historia ya ufugaji wa samaki wa dhahabu (Carassius auratus)
2021	Jarida la Bioteknolojia ya mmea	Marejeleo ya jenomu za spishi mbili za jute zinazolimwa
2021	Jarida la Bioteknolojia ya mmea	Saini za jeni za mboga na mbegu za allopolyploid Brassicajuncea na loci ya kijeni kudhibiti mkusanyiko wa glucosinolates
2019	Kiwanda cha Masi	Ufuataji wa jenomu zima la mkusanyiko wa ulimwenguni pote wa upatanishi wa mbegu za ubakaji unaonyesha msingi wa kijenetiki wa tofauti zao za aina ya ikolojia.
2022	Utafiti wa Kilimo cha bustani	Uchanganuzi wa muungano wa jenomu pana hutoa maarifa ya molekuli katika tofauti asilia ya ukubwa wa mbegu ya tikiti maji
2021	Jarida la Botania ya Majaribio	Utafiti wa muungano wa genome kote unabainisha anuwai za GhSAD1 inayopeana uvumilivu wa baridi katika pamba.
2021	Jarida la Botania ya Majaribio	Utafiti wa muungano wa genome kote na ulinganisho wa nakala hufichua riwaya ya QTL na jeni tahiniwa ambazo hudhibiti saizi ya petali katika mbegu za kubakwa.