-
Upangaji wa Amplicon wa PacBio-Urefu Kamili wa 16S/18S/ITS
Jukwaa la Amplicon (16S/18S/ITS) limetengenezwa kwa uzoefu wa miaka mingi katika uchanganuzi wa miradi ya utofauti wa vijidudu, ambao una uchanganuzi sanifu wa msingi na uchanganuzi wa kibinafsi: uchanganuzi wa kimsingi unashughulikia maudhui ya uchambuzi mkuu wa utafiti wa sasa wa vijidudu, maudhui ya uchanganuzi ni mengi na ya kina, na matokeo ya uchanganuzi yanawasilishwa katika mfumo wa ripoti za mradi; Maudhui ya uchanganuzi wa kibinafsi ni tofauti. Sampuli zinaweza kuchaguliwa na vigezo vinaweza kuwekwa kwa urahisi kulingana na ripoti ya msingi ya uchanganuzi na madhumuni ya utafiti, ili kufikia mahitaji ya kibinafsi. Mfumo endeshi wa Windows, rahisi na wa haraka.
-
PacBio-Transcriptome ya Urefu Kamili (Isiyo ya Marejeleo)
Kwa kuchukua data ya mpangilio wa Isoform ya Pasifiki (PacBio) kama ingizo, Programu hii ina uwezo wa kutambua mfuatano wa maandishi ya urefu kamili (bila mkusanyiko). Kwa kuchora mfuatano wa urefu kamili dhidi ya jenomu ya marejeleo, nakala zinaweza kuboreshwa kwa kutumia jeni zinazojulikana, nakala, maeneo ya usimbaji, n.k. Katika hali hii, utambuzi sahihi zaidi wa miundo ya mRNA, kama vile uunganishaji mbadala, n.k., unaweza kupatikana. Uchambuzi wa pamoja na data ya mpangilio wa nakala ya NGS huwezesha ufafanuzi kamili zaidi na upimaji sahihi zaidi katika usemi katika kiwango cha nakala, ambao kwa kiasi kikubwa hufaidi usemi tofauti wa chini na uchambuzi wa utendaji.
-
Vifaa vya zana
BMKCloud ni jukwaa linaloongoza la kibiolojia linalotoa suluhisho la sehemu moja kwa programu za kijiolojia, ambalo linaaminika sana na watafiti katika nyanja mbalimbali ikiwa ni pamoja na matibabu, kilimo, mazingira, n.k. BMKCloud imejitolea kutoa huduma jumuishi, za kuaminika na zenye ufanisi ikiwa ni pamoja na majukwaa na zana za uchambuzi wa kibiolojia, rasilimali za kompyuta, hifadhidata ya umma, kozi za mtandaoni za kibiolojia, n.k. BMKCloud ina zana mbalimbali za kibiolojia zinazotumika mara kwa mara za kujumuisha maelezo ya jeni, zana za kijenetiki za mageuko, ncRNA, udhibiti wa ubora wa data, mkusanyiko, upangiliaji, uchimbaji wa data, mabadiliko, takwimu, jenereta ya takwimu, uchambuzi wa mfuatano, n.k.
-
RNA Ndogo
RNA ndogo ni aina ya RNA fupi zisizo na msimbo zenye urefu wa wastani wa 18-30 nt, ikiwa ni pamoja na miRNA, siRNA na piRNA. RNA hizi ndogo zimeripotiwa kwa kiasi kikubwa kuhusika katika michakato mbalimbali ya kibiolojia kama vile uharibifu wa mRNA, kizuizi cha tafsiri, uundaji wa heterochromatin, n.k. Uchambuzi wa mpangilio wa SmallRNA umetumika sana katika tafiti kuhusu ukuaji wa wanyama/mimea, magonjwa, virusi, n.k. Jukwaa la uchambuzi wa mpangilio wa RNA ndogo linajumuisha uchambuzi wa kawaida na uchimbaji wa data wa hali ya juu. Kwa msingi wa data ya RNA-seq, uchambuzi wa kawaida unaweza kufikia utambuzi na utabiri wa miRNA, utabiri wa jeni lengwa la miRNA, uchanganuzi wa maelezo na usemi. Uchanganuzi wa hali ya juu huwezesha utafutaji na uchimbaji wa miRNA uliobinafsishwa, uzalishaji wa michoro ya Venn, miRNA na ujenzi wa mtandao wa jeni lengwa.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS ni jukwaa zima la uchambuzi wa mpangilio upya wa jenomu, ambalo limetengenezwa kwa msingi wa uzoefu mwingi katika Teknolojia za Biomarker. Jukwaa hili rahisi kutumia huruhusu uwasilishaji wa haraka wa mtiririko wa kazi jumuishi wa uchambuzi kwa kuweka tu vigezo vichache vya msingi, ambavyo vinafaa kwa data ya mpangilio wa DNA inayotokana na jukwaa la Illumina na jukwaa la mpangilio wa BGI. Jukwaa hili linatumika kwenye seva ya kompyuta yenye utendaji wa hali ya juu, ambayo huwezesha uchanganuzi wa data wenye ufanisi mkubwa kwa muda mfupi sana. Uchimbaji wa data uliobinafsishwa unapatikana kwa msingi wa uchanganuzi wa kawaida, ikiwa ni pamoja na hoja ya jeni iliyobadilishwa, muundo wa awali wa PCR, n.k.
-
mRNA (Marejeleo)
Transcriptome ni kiungo kati ya taarifa za kijenetiki za jenomu na protome ya utendaji kazi wa kibiolojia. Udhibiti wa kiwango cha unukuzi ndio hali muhimu zaidi na iliyosomwa sana ya udhibiti wa viumbe. Mfuatano wa transcriptome unaweza kupanga transcriptome wakati wowote au chini ya hali yoyote, kwa azimio sahihi kwa nukleotidi moja. Inaweza kuonyesha kwa nguvu kiwango cha unukuzi wa jeni, kutambua na kupima nakala adimu na za kawaida kwa wakati mmoja, na kutoa taarifa za kimuundo za nakala maalum za sampuli.
Kwa sasa, teknolojia ya mpangilio wa transcriptome imetumika sana katika kilimo, dawa na nyanja zingine za utafiti, ikiwa ni pamoja na udhibiti wa maendeleo ya wanyama na mimea, marekebisho ya mazingira, mwingiliano wa kinga, ujanibishaji wa jeni, mageuko ya kijenetiki ya spishi na ugunduzi wa magonjwa ya uvimbe na kijenetiki.
-
Metagenomics (NGS)
Jukwaa hili la uchambuzi limeundwa kwa ajili ya uchambuzi wa data ya metagenomiki kwa msingi wa uzoefu wa miaka mingi. Linajumuisha mtiririko wa kazi uliojumuishwa ulio na uchanganuzi mbalimbali wa metagenomiki unaohitajika sana ikiwa ni pamoja na usindikaji wa data, tafiti za kiwango cha spishi, tafiti za kiwango cha utendaji wa jeni, uwekaji wa metagenomu, n.k. Kwa kuongezea, zana maalum za uchimbaji data zinapatikana kupitia mtiririko wa kazi wa kawaida wa uchambuzi, ikiwa ni pamoja na swali la jeni na spishi, mpangilio wa vigezo, utengenezaji wa takwimu za kibinafsi, n.k.
-
LncRNA
RNA ndefu zisizo na usimbaji (lncRNA) ni aina ya nakala zenye urefu wa zaidi ya 200 nt, ambazo haziwezi kuandika protini. Ushahidi unaokusanywa unaonyesha kwamba lncRNA nyingi zina uwezekano mkubwa wa kufanya kazi. Teknolojia za mpangilio wa kiwango cha juu na zana za uchanganuzi wa kibiolojia hutuwezesha kufichua mfuatano wa lncRNA na kuweka taarifa kwa ufanisi zaidi na kutuongoza kugundua lncRNA zenye kazi muhimu za udhibiti. BMKCloud inajivunia kuwapa wateja wetu jukwaa la uchanganuzi wa mpangilio wa lncRNA ili kufikia uchanganuzi wa lncRNA wa haraka, wa kuaminika na unaonyumbulika.
-
GWAS
Utafiti wa uhusiano wa jeni kwa ujumla (GWAS) unalenga kutambua tofauti za kijenetiki (jeni) zinazohusishwa na sifa maalum (jeni aina). Uchunguzi wa GWA unachunguza alama za kijenetiki zinazovuka jenomu nzima ya idadi kubwa ya watu na kutabiri uhusiano wa jeni aina-jeni kwa uchanganuzi wa takwimu katika kiwango cha idadi ya watu. Upangaji upya wa jeni nzima unaweza kugundua tofauti zote za kijenetiki. Kwa kuunganisha na data ya jeni, GWAS inaweza kusindika ili kutambua SNP zinazohusiana na fenotipu, QTL na jeni changamani, ambazo zinaunga mkono kwa nguvu ufugaji wa kisasa wa wanyama/mimea. SLAF ni mkakati wa mpangilio wa jeni uliorahisishwa uliotengenezwa na wewe mwenyewe, ambao hugundua alama zilizosambazwa za jeni kwa ujumla, SNP. SNP hizi, kama alama za kijenetiki za molekuli, zinaweza kusindika kwa ajili ya masomo ya uhusiano na sifa lengwa. Ni mkakati wa gharama nafuu katika kutambua tofauti za kijenetiki zinazohusiana na sifa changamano.
-
Nanopore Transcriptomiki za urefu kamili
Isoforms mbadala changamano na zinazobadilika katika viumbe hai ni mifumo muhimu ya kijenetiki kwa ajili ya kudhibiti usemi wa jeni na utofauti wa protini. Utambuzi sahihi wa miundo ya nakala ni msingi wa utafiti wa kina wa mifumo ya udhibiti wa usemi wa jeni. Jukwaa la mpangilio wa nanopore limefanikiwa kuleta utafiti wa transcriptomic katika kiwango cha isoform. Jukwaa hili la uchambuzi limeundwa kuchanganua data ya RNA-Seq inayozalishwa kwenye jukwaa la Nanopore kwa msingi wa jenomu ya marejeleo, ambayo inafanikisha uchanganuzi wa ubora na kiasi katika kiwango cha jeni na kiwango cha nakala.
-
RNA ya duara
RNA ya mviringo (circRNA) ni aina ya RNA isiyo na msimbo, ambayo hivi karibuni imeonekana kuchukua jukumu muhimu katika mitandao ya udhibiti inayohusika katika ukuaji, upinzani wa mazingira, n.k. Tofauti na molekuli za RNA za mstari, k.m. mRNA, lncRNA, ncha za 3′ na 5′ za circRNA huunganishwa pamoja ili kuunda muundo wa mviringo, ambao huiokoa kutokana na usagaji wa exonukleasi na ni thabiti zaidi kuliko RNA nyingi za mstari. CircRNA imeonekana kuwa na kazi mbalimbali katika kudhibiti usemi wa jeni. CircRNA inaweza kufanya kazi kama ceRNA, ambayo hufunga miRNA kwa ushindani, inayojulikana kama sifongo ya miRNA. Jukwaa la uchambuzi wa mpangilio wa CircRNA huwezesha muundo wa circRNA na uchambuzi wa usemi, utabiri wa lengo na uchambuzi wa pamoja na aina zingine za molekuli za RNA.
-
BSA
Jukwaa la Uchambuzi wa Utengano wa Bulked linajumuisha uchanganuzi wa kiwango cha hatua moja na uchanganuzi wa hali ya juu wenye mpangilio maalum wa vigezo. BSA ni mbinu inayotumika kutambua haraka alama za kijenetiki zinazohusiana na fenotipu. Mtiririko mkuu wa kazi wa BSA una: 1. kuchagua makundi mawili ya watu wenye fenotipu zinazopingana sana; 2. kuunganisha DNA, RNA au SLAF-seq (Iliyotengenezwa na Biomarker) ya watu wote ili kuunda wingi mbili wa DNA; 3. kutambua mfuatano tofauti dhidi ya jenomu ya marejeleo au kati, 4. kutabiri maeneo yaliyounganishwa na ED na algoriti ya index ya SNP; 5. Uchanganuzi wa utendaji kazi na uboreshaji wa jeni katika maeneo yanayopendekezwa, n.k. Uchimbaji wa hali ya juu zaidi katika data ikiwa ni pamoja na uchunguzi wa alama za kijenetiki na muundo wa awali pia unapatikana.
-
Amplikoni (16S/18S/ITS)
Jukwaa la Amplicon (16S/18S/ITS) limetengenezwa kwa uzoefu wa miaka mingi katika uchanganuzi wa miradi ya utofauti wa vijidudu, ambao una uchanganuzi sanifu wa msingi na uchanganuzi wa kibinafsi: uchanganuzi wa kimsingi unashughulikia maudhui ya uchambuzi mkuu wa utafiti wa sasa wa vijidudu, maudhui ya uchanganuzi ni mengi na ya kina, na matokeo ya uchanganuzi yanawasilishwa katika mfumo wa ripoti za mradi; Maudhui ya uchanganuzi wa kibinafsi ni tofauti. Sampuli zinaweza kuchaguliwa na vigezo vinaweza kuwekwa kwa urahisi kulingana na ripoti ya msingi ya uchanganuzi na madhumuni ya utafiti, ili kufikia mahitaji ya kibinafsi. Mfumo endeshi wa Windows, rahisi na wa haraka.
