Bidhaa

Mpangilio wa RNA ya Prokaryotic

Mfuatano wa RNA ya Prokaryotic Picha Iliyoangaziwa

Upangaji wa RNA wa prokaryotic hutumia mpangilio wa kizazi kijacho (NGS) kufichua uwepo na wingi wa RNA kwa wakati fulani, kwa kuchanganua mabadiliko ya nukuu ya seli.Mpangilio wa RNA wa prokariyoti wa kampuni yetu, unalenga haswa prokariyoti zilizo na jenomu marejeleo, kukupa maelezo mafupi, uchanganuzi wa muundo wa jeni, n.k. Imetumika sana kwa utafiti wa kimsingi wa sayansi, utafiti na ukuzaji wa dawa, na zaidi.

Jukwaa: Jukwaa la Illumina NovaSeq

Wasiliana nasi

Maelezo ya Huduma

Vipimo vya huduma

Jukwaa: Illumina NovaSeq jukwaa, PE150

Aina ya maktaba: 350bp ingiza maktaba ya cDNA (inategemea usambazaji wa kilele)

Mkakati wa mpangilio: Imeoanishwa-Mwisho 150 bp

Pendekeza kiasi cha data: 2 Gb data/sampuli ghafi

Bioinformatics

(1) Kuratibu udhibiti wa ubora wa data: Usambazaji wa Nucleotidi, usambazaji wa ubora wa msingi, tathmini ya uwiano wa rRNA;

(2) Uchanganuzi wa upatanishi wa mfuatano: Takwimu za matokeo ya upatanishi, Kueneza kwa mpangilio, Chanjo ya mpangilio;

(3) Dokezo la jenomu la marejeleo (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Uchambuzi wa kujieleza: Usambazaji wa kujieleza (Pamoja na sampuli mbili au zaidi), Uchambuzi wa kujieleza kati ya sampuli (Uchambuzi wa Venn, Uchambuzi wa Uwiano, uchambuzi wa PCA);

(5) Uchambuzi wa usemi tofauti (Pamoja na sampuli mbili au zaidi);

(6) Uchanganuzi wa seti ya jeni: Uchambuzi wa Venn, Uchanganuzi wa Nguzo, Uchambuzi wa ufafanuzi wa Kazi (COG, GO, KEGG), Uchambuzi wa uboreshaji wa kazi (GO, KEGG), Grafu ya uboreshaji wa kazi, uchambuzi wa Ipath;

(7) uchanganuzi wa sRNA: utabiri wa sRNA, ufafanuzi wa sRNA (Mlipuko, sRNAMAp, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), utabiri wa muundo wa sRNA wa pili, utabiri wa jeni la lengo la sRNA;

(8) Uchanganuzi wa muundo wa nakala: Uchanganuzi wa Operon, utabiri wa tovuti za Unukuzi na mwisho, ufafanuzi na uchanganuzi wa UTR, Utabiri wa mfuatano wa Promota, uchanganuzi wa SNP/InDel (Ufafanuzi wa SNP/InDel, usambazaji wa kikanda wa SNP/InDel, takwimu za SNP).