Proteomics
Vipengele
●Proteomics za Ubora: Hutumia LC-MS/MS kutambua utungaji wa protini katika sampuli changamano (vipande vya jeli vya SDS-PAGE, IP, Co-IP, Vuta-chini). Faida: Hakuna kikomo cha idadi ya sampuli, ugunduzi wa haraka, usindikaji rahisi wa sampuli, upitishaji wa juu, na uwezo wa kugundua protini zenye wingi mdogo.
● Proteomics za Kiasi Zisizo na Lebo: Teknolojia isiyo na lebo yenye ugunduzi wa sampuli ya mtu binafsi. Hupima protini kwa kulinganisha nguvu ya ishara ya peptidi katika data ya spektrometri ya wingi. Faida: Uendeshaji rahisi, upitishaji wa juu (hakuna kikomo cha nambari ya sampuli), na utumiaji mpana (unafaa kwa ulinganisho tofauti wa protini "uwepo/kutokuwepo" katika spishi mbalimbali).
● DIA Quantitative Proteomics: Hutumia hali ya upatikanaji usiotegemea data (DIA), kuchanganua ioni zote katika madirisha yaliyogawanywa ili kunasa taarifa kamili za ioni. Faida: Uwezo bora wa kurudia, kiwango cha juu cha protini, na upimaji sahihi zaidi kuliko hali ya DDA (Isiyo na TMT/Lebo), bora kwa tafiti za sampuli kubwa.
● Proteomics za Kiasi Zisizo na Lebo ya 4D/Proteomics za Kiasi za 4D-DIA: Kulingana na spektromita ya molekuli ya Bruker timsTOF, kuongeza uhamaji wa ioni (sehemu mtambuka ya mgongano) kwenye utenganisho wa jadi wa 3D. Faida: Matumizi na usahihi ulioboreshwa wa ioni, uboreshaji kamili wa kina cha kufunika, unyeti na upitishaji; kina cha juu cha utambuzi kuliko njia ya jadi ya 3D.
● Proteomics za Kiasi Zisizo na Lebo ya Astral/Proteomics za Kiasi za Astral DIA: Kulingana na spectromita ya uzito yenye ubora wa juu ya OrbitrapTM AstralTM. Faida: Upitishaji wa juu zaidi (sampuli 100+/siku zenye mteremko wa dakika 8), ufunikaji wa kina zaidi (protini 8,000+ zilizogunduliwa katika seli za Hela katika dakika 8), na unyeti wa juu zaidi (sampuli kidogo inahitajika).
● Proteomics ya Kiasi ya TMT: Hutumia lebo 18 za isotopu kuweka lebo kwenye peptidi kwa ajili ya kugundua sampuli 18 kwa wakati mmoja. Faida: Uthabiti wa juu (uingiliaji mdogo wa uthabiti wa kifaa, hitilafu ndogo ya mfumo) na unyeti wa juu (ugawaji wa vipande hupunguza ugumu wa sampuli, na kuboresha ugunduzi wa protini nyingi kidogo).
● Proteomics Zilizolengwa za PRM: Teknolojia lengwa yenye ubora wa juu kwa ajili ya kugundua protini/peptidi lengwa kwa uangalifu. Faida: Huwezesha upimaji wa jamaa/kamili na uthibitishaji wa matokeo ya proteomics ya kiasi; hakuna kizuizi cha kingamwili, matumizi mapana zaidi kuliko Western Blot na ELISA.
Faida
● Vifaa vya Kina: Jipatie vifaa vya kawaida vya proteomics na spektromita za kina cha juu za uzito (km, 4D, Astral).
● Ugunduzi Imara: Mifumo thabiti ya udhibiti wa ubora huhakikisha michakato thabiti na thabiti ya upimaji.
● Matokeo Yanayotegemeka: Uchambuzi wa ubora na kiasi unaofanywa kwa wakati mmoja hutoa usemi wa jamaa, uzito wa molekuli, wingi na data nyingine muhimu kwa kila kundi.
● Otomatiki ya Juu: Mifumo ya LC-MS otomatiki huwezesha uchanganuzi wa haraka na utendaji bora wa utenganishaji.
Vipimo vya Huduma
| Ulinganisho wa Mbinu za Proteomics Zisizolengwa | ||||
| Bila lebo | DIA | TMT | ||
| Kuweka lebo | NO | NO | NDIYO | |
| Hali ya Kuchanganua Data | DDA | DDA | DIA | DDA |
| Uzazi tena | Chini | Juu | Juu | |
| Usikivu | Chini | Juu | Juu | |
| Kuzidisha | NO | NDIYO | NO | NDIYO |
| Maombi | Kulinganisha uwepo/kutokuwepo kwa protini | Sampuli kubwa | Uchambuzi wa makundi tofauti ya sampuli | Kulinganisha usemi tofauti wa protini katika aina na tishu zile zile |
| Usahihi | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| Idadi ya Ugunduzi | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
Mahitaji ya Sampuli
Je, unajiuliza kama sampuli zako zinakidhi vigezo vyetu? Bofya hapa ili kupatamahitaji ya hivi karibuni ya sampuli.
Mtiririko wa Kazi ya Huduma
Mkusanyiko wa Sampuli
Uchimbaji wa Protini
Usagaji wa kimeng'enya
Kutengana
Upatikanaji wa Data
Uchambuzi wa Data
Uwasilishaji wa Data
Proteomics za Ubora
1. Myeyusho/jeli ya protini: jedwali la matokeo ya ubora
2. Matokeo ya Utafutaji wa Hifadhidata
2.1 Orodha ya sehemu za peptidi zinazolingana katika utafutaji wa hifadhidata
2.2 Orodha ya protini zinazolingana katika utafutaji wa hifadhidata
2.3 Orodha ya marekebisho yaliyolingana katika utafutaji wa hifadhidata (fosforili, ubiquitination, n.k.)
3. Data ghafi
Proteomics ya Kiasi(Bila Lebo/DIA/TMT)
1. Usindikaji wa Data Mapema
1.1 Utafutaji wa Hifadhidata ya Protini
2. Uchambuzi wa Usemi wa Protini
2.1 Uchambuzi Mkuu wa Vipengele (PCA)
2.2 Mkengeuko wa Kiwango Husika (RSD)
2.3 K-means Usambazaji wa Mitindo
2.4 Tathmini ya Uzazi
2.5 Ramani ya Joto ya Usemi wa Protini
3. Maelezo ya Utendaji
3.1 GO Ufafanuzi wa Utendaji
3.2 Maelezo ya Utendaji ya KEGG
3.3 Maelezo ya Utendaji Kazi wa COG
3.4 Maelezo ya Utendaji ya GOslim
3.5 Maelezo ya Kikoa cha Muundo wa Protini ya Pfam
4. Uchambuzi wa Tofauti za Protini (nakala za kibiolojia ≥ 3)
4.1 Matokeo ya Uchambuzi wa Tofauti za Protini
4.2 Usambazaji wa Mabadiliko Tofauti ya Protini Mara (FC)
4.3 Uchambuzi wa Takwimu wa Kiasi Tofauti cha Protini
4.4 Kipande cha Volkano cha Protini Tofauti
4.5 Ramani ya Joto ya Kukusanya Protini Tofauti
4.6 Uchambuzi wa Utendaji Kazi wa Protini Tofauti na Uchambuzi wa Uboreshaji
4.7 Uchambuzi wa Utendaji Kazi wa Protini Tofauti za KEGG na Uboreshaji
4.8 Maelezo ya Utendaji Kazi ya COG ya Protini Tofauti
4.9 Uchambuzi wa Utofautishaji wa Protini ya GOslim na Uboreshaji
4.10 Uchambuzi wa Utofautishaji wa Muundo wa Protini na Uboreshaji wa Kikoa
5. Uchambuzi wa Mwingiliano wa Mtandao wa Protini
6. Maelezo ya Njia ya Reaktome ya Protini
7. Utabiri wa Peptidi ya Ishara
8. Ujanibishaji wa Protini Chini ya Seli
Proteomics ya Kiasi(PRM)
1. Matokeo ya Upimaji wa Protini ya PRM
1.1 Muhtasari wa Matokeo ya Upimaji
1.2 Usambazaji wa Maeneo ya Kilele cha Ioni za Vipande kwa Sehemu za Peptidi
Proteomics ya Kiasi
1.Uchambuzi wa Usemi wa Protini
↑Uchambuzi wa Vipengele Vikuu (PCA)↑Mkengeuko wa Kiwango Uhusiano (RSD)
↑K-maana ya Usambazaji wa Mwelekeo ↑UhusianoAuchambuzi waProteinEmkazoLevels
↑ Ramani ya Joto ya Usemi wa Protini
2. Maelezo ya Utendaji
↑GO Maelezo ya Utendaji↑Maelezo ya Utendaji ya KEGG
↑ Maelezo ya Kazi ya COG ↑ Maelezo ya Kazi ya GOslim
↑ Maelezo ya Kikoa cha Muundo wa Protini ya Pfam
3.Uchambuzi wa Mwingiliano wa Mtandao wa Protini
↑ Uchambuzi wa Mwingiliano wa Mtandao wa Protini
4.Utabiri wa Peptidi ya Ishara
↑ Utabiri wa Peptidi ya Ishara
5. Ujanibishaji wa Protini Chini ya Seli
↑Ujanibishaji wa Protini kwenye Seli Ndogo
| 2025 | Vesikuli za Apoptotiki Zinazotokana na Seli Shina za Mesenchymal Hupunguza Unyeti wa Juu Mwitikio Kupitia Kuchochea Apoptosis ya Seli za CD8+ T zenye Kalsiamu Kuzidi na Utendaji Mbaya wa Mitochondria | Sayansi ya Juu |
| 2024 | Omiki nyingi zilizojumuishwa zinaonyesha ufanisi ulioimarishwa wa kupambana na uvimbe wa | Oncology ya Tafsiri |
| 2024 | Uchambuzi wa Omics Nyingi Hufichua Sifa Tofauti za Njia za Kimetaboliki Zinazounga Mkono Ukubwa wa Matunda na Tofauti ya Rangi ya Maboga Makubwa | Int. J. Mol. Sayansi. |
| 2024 | Uainishaji wa Transcriptome na Metabolome Hutoa Maarifa Mapya kuhusu Kutotumia Misuli katika Kuku: Jukumu Linalowezekana la Nyuzinyuzi za Misuli Zinazobadilika Haraka | Int. J. Mol. Sayansi. |
| 2023 | Uchambuzi wa omiki nyingi unaonyesha ushawishi wa tetrasaiklini kwenye ukuaji wa mzizi wa nyasi ya rye. | Jarida la vifaa hatari |
