Mfuatano uliopunguzwa wa Uwakilishi wa Bisulfite (RRBS)
Vipimo vya huduma
Jukwaa: jukwaa la NovaSeq, PE150
Aina ya maktaba: 200-400bp ingiza maktaba ya DNA iliyotibiwa na bisulfite
Mkakati wa mpangilio: Imeoanishwa-Mwisho 150 bp
Pendekeza pato la data: 10 Gb data/sampuli ghafi
Mahitaji ya Sampuli
Kiasi cha DNA: ≥ 2ug
Mkusanyiko wa DNA:≥ 20ng/μl.
Usafi: OD260/280 = 1.8 hadi 2.0 bila uharibifu au uchafuzi wa RNA
Uchambuzi wa bioinformatics
Mtiririko wa Kazi ya Huduma
Utoaji wa sampuli
Ujenzi wa maktaba
Kufuatana
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya kuuza
a.Rejelea takwimu za upatanishi wa jenomu
Takwimu za usomaji wa ramani
Stakwimu za mpangilio wa kina na chanjo ya tovuti ya C
Akusanyiko chanjo
Dufanisi wa kumeza wa kila sampuli
b.Utambuzi wa tovuti ya methylation
Orodha ya viwango vya methylation kwenye tovuti ya C
BS ubadilishaji
Mcytosine ya ethylated
Usambazaji wa kiwango cha methylation
c.Ramani ya methylation
Gpana
Gkipengele hiki
d.Ulinganisho wa viwango vya methylation kati ya sampuli
Pkwa njia ya hewa Uwiano wa methylation ya CG
PCA-CG methylation
Ckuangaza kwa methylation ya CG
d.Uchambuzi wa methylation tofauti
Stakwimu za DMR
Usambazaji wa urefu wa DMR
Hkula ramani
DUsambazaji wa MR katika eneo linalolengwa
