Mfuatano Ndogo wa RNA-Illumina
Vipengele
● Maandalizi ya maktaba ya uteuzi wa ukubwa.
● Uchambuzi wa kibiolojia ulijikita katika utabiri na malengo ya miRNA.
Faida za Huduma
●Utaalamu wa Kina: Tumechakata zaidi ya sampuli 300, zikijumuisha aina mbalimbali za sampuli. Tunaleta utajiri wa utaalamu katika kila mradi.
●Udhibiti Mkali wa Ubora: Tunatekeleza vipengele vya udhibiti mkuu katika hatua zote, kuanzia utayarishaji wa sampuli hadi utayarishaji wa maktaba, mpangilio na bioinformatiki. Ufuatiliaji wetu wa kina unahakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa hali ya juu kila mara.
●Uchambuzi kamili wa bioinformatiki:Inawezesha utambuzi wa miRNA zinazojulikana na mpya, utambuzi wa malengo ya miRNA, na ufafanuzi wa utendaji kazi unaolingana na uboreshaji kwa kutumia hifadhidata nyingi (KEGG, GO).
●Usaidizi wa Baada ya Mauzo: Tunaelewa umuhimu wa kuwepo, ndiyo maana ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha huduma cha miezi 3 baada ya mauzo. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi wa matatizo, na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
Mahitaji ya Sampuli na Uwasilishaji
| Maktaba | Jukwaa | Data iliyopendekezwa | QC ya Data |
| Ukubwa umechaguliwa | Illumina SE50 | Usomaji wa 10M-20M | Q30≥85% |
Mahitaji ya Mfano:
Nyukleotidi:
| Kikomo (ng/μl) | Kiasi (μg) | Usafi | Uadilifu |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Uchafuzi mdogo au hakuna protini au DNA unaoonyeshwa kwenye jeli. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; mwinuko mdogo au hakuna msingi |
● Mimea:
Mzizi, Shina au Petali: 450 mg
Jani au Mbegu: 300 mg
Matunda: 1.2 g
● Mnyama:
Moyo au Utumbo: 450 mg
Viscera au Ubongo: 240 mg
Misuli: 600 mg
Mifupa, Nywele au Ngozi: 1.5g
● Arthropodi:
Wadudu: 9g
Krustasia: 450 mg
● Damu nzima: Mirija 2
● Seli: 106 seli
● Seramu na Plasma:6 mL
Uwasilishaji wa Sampuli Uliopendekezwa
Chombo: Mrija wa sentrifuge wa 2 ml (Foili ya bati haipendekezwi)
Uwekaji lebo wa sampuli: Kundi+nakili k.m. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Usafirishaji:
1. Barafu kavu: Sampuli zinahitaji kupakiwa kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.
2. Mirija ya RNAstable: Sampuli za RNA zinaweza kukaushwa kwenye mrija wa uthabiti wa RNA (km RNAstable®) na kusafirishwa kwenye halijoto ya kawaida.
Mtiririko wa Kazi ya Huduma
Ubunifu wa majaribio
Uwasilishaji wa sampuli
Uchimbaji wa RNA
Ujenzi wa maktaba
Mfuatano
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya mauzo
Bioinformatiki
● Udhibiti wa ubora wa data ghafi
● Uainishaji wa RNA Ndogo
● uchanganuzi wa usemi wa miRNA na tofauti
● jeni lengwa la miRNA na maelezo ya jeni lengwa la miRNA yaliyoonyeshwa tofauti
● Maelezo ya jeni lengwa na uboreshaji wa utendaji kazi wa jeni wa miRNA ulioonyeshwa tofauti
Utambuzi wa miRNA: muundo na kina
Usemi tofauti wa miRNA - mkusanyiko wa kihierarkia
Maelezo ya utendaji kazi wa shabaha ya miRNA zilizoonyeshwa tofauti
Chunguza maendeleo ya utafiti yaliyowezeshwa na huduma za mpangilio wa sRNA za BMKGene kupitia mkusanyiko wa machapisho yaliyochaguliwa.
Chen, H. et al. (2023) 'Maambukizi ya virusi huzuia usanisi wa saponini na usanisinuru katika Panax notoginseng',Fiziolojia ya Mimea na Biolojia, 203, uk. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Protini FREE1 yenye kikoa cha FYVE cha mmea huhusishwa na vipengele vya kichakataji mikro ili kuzuia biogenesis ya miRNA',Ripoti za EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p Hudhibiti Ukuaji wa Mabuu ya Mwanaume kwa Kulenga Vikoa Vingi vya Ukuaji wa Epidermal kama Vigezo vya Ukuaji wa Epidermal 8 (megf8) katika Nyuki wa Asali, Apis mellifera',Jarida la Kimataifa la Sayansi ya Masi, 24(6), uk. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Uchambuzi Jumuishi wa MiRNA na Jeni Zinazohusiana na Ubora wa Nyama Unaonyesha kwamba Gga-MiR-140-5p Huathiri Uwekaji wa Mafuta Ndani ya Misuli kwa Kuku',Fiziolojia ya Seli na Biolojia, 46(6), ukurasa wa 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
