Ofa ya Muda Mfupi: Suluhisho la Kusanyiko la Jenomu la T2T la Yote-katika-Moja
Kwa maendeleo ya haraka ya teknolojia ya mpangilio wa kijenomu na algoriti ya mkusanyiko, mkusanyiko wa jeni wa Telomere-hadi-Telomere (T2T) umekuwa kiwango cha dhahabu cha utafiti wa jeni wa hali ya juu, kutatua tatizo la pengo la muda mrefu katika mkusanyiko wa jeni wa jadi (Mikoa yenye marudio mengi na maudhui ya GC ya juu, kama vile telomere na centromere, inahitaji data ya mpangilio wa muda mrefu ili kuzifikia kwa mafanikio). Ili kukuza umaarufu wa teknolojia ya T2T katika utafiti wa kitaaluma, kupata mfuatano kamili zaidi wa jeni, na kuwezesha ugunduzi wa jeni na tofauti za kimuundo ambazo hazikutambuliwa hapo awali, tunazindua ofa hii ya muda mfupi, tukitoa suluhisho la mkusanyiko wa jeni la T2T la kituo kimoja cha gharama nafuu kwa spishi yako, tukiwezesha utafiti wako kwa marejeleo kamili na sahihi.
Maelezo ya Kifurushi cha Huduma
●Mfuatano
● Usomaji mfupi wa Illumina kwa Utafiti: 50X
● PacBio HiFi inasomwa kwa ajili ya mkusanyiko wa rasimu: 50X
● Hi-C kwa ajili ya jukwaa: 100X
● Vipimo vya nanopore ndefu sana kwa ajili ya kujaza pengo: seli 2
● Illumina mRNA-seq kwa maelezo ya jenomu: 12 Gb / 1 pool
●Uchambuzi wa Kihierarkia
● Utafiti wa tathmini ya vipengele vya jenomu
● Mkusanyiko wa jenomu ya kiwango cha msongamano
● Kiunzi cha jenomu ya kiwango cha kromosomu
● Kujaza mapengo na utambuzi wa telomere kwa jenomu ya T2T
● Tathmini ya ubora wa jenomu ya T2T
● Maelezo ya jenomu kwa utabiri wa vipengele vya jeni na jenomu
● Ripoti kamili ya uchambuzi yenye tafsiri ya kitaalamu ya kiufundi
Matokeo ya Onyesho
Kwa kuelewa vyema ubora wa huduma yetu ya kukusanya jenomu ya T2T, tunatoa matokeo ya majaribio ya mradi wa kawaida:
•Jenomu ya mwisho ya T2T inajumuisha kromosomu 19 zenye urefu wa jumla ya 491.39Mb, na N50 iliyounganishwa ya 26.04Mb. Jumla ya telomere 38 na sentimita 19 zilitambuliwa. Kromosomu 19 hazina pengo kutoka telomere hadi telomere.
•Matokeo ya tathmini ya mkusanyiko yanaonyesha ukamilifu na usahihi wa hali ya juu wa jenomu iliyokusanywa: Tathmini ya BUSCO kwa kutumia hifadhidata ya kiinitete ya OrthoDB 10 ilionyesha ukamilifu wa jenomu wa 97.09%; Thamani ya QV ya jenomu ni 52.36. Thamani ya LAI ya jenomu ni 18.93.
Utekelezaji
•Sehemu za utafiti zinazotumika: Utafiti wa msingi wa jenomu, uboreshaji wa kijenetiki ya mazao, ufugaji wa wanyama, mashamba yote ya mimea na wanyama yanayohitaji mkusanyiko wa jenomu wa ubora wa juu.
•Spishi zinazotumika: Ukubwa wa jeni ≤ 1; Mamalia, mazao ya kawaida, matunda na matikiti ya kawaida, miti ya kawaida ya misitu, samaki wa maji safi, n.k. Kwa spishi zingine, tafadhali wasiliana nasi kwa maelezo zaidi.
•Ofa halali: Mikataba Iliyosainiwa ifikapo Juni 30.
•Maagizo ya ziadaKwa sampuli maalum (km zile zenye mfuatano wa juu unaorudiwa au ubora wa chini wa DNA) au mahitaji ya uchambuzi yaliyobinafsishwa, timu yetu ya kiufundi itatoa suluhisho la kibinafsi, huku bei ikirekebishwa kulingana na mahitaji halisi ya mradi.
Anza Sasa
Tumia fursa ya ofa hii ya muda mfupi na ufurahie huduma ya ubora wa juu ya mkusanyiko wa jenomu ya T2T kwa bei ya upendeleo! Wasiliana na timu yetu ya kiufundi ili kushauriana na maelezo, kuwasilisha taarifa za sampuli, na kupata nukuu maalum.
