டி நோவோ பாக்டீரியா ஜீனோம் அசெம்பிளி
நாங்கள் இடைவெளிகளே இல்லாத ஒரு முழுமையான பாக்டீரிய மரபணுத்தொகுப்பு ஒருங்கிணைப்புச் சேவையை வழங்குகிறோம். ஒருங்கிணைப்பிற்காக நானோபோர் மற்றும் பேக்பையோ போன்ற நீண்ட-வாசிப்பு வரிசைப்படுத்தல் தொழில்நுட்பங்களையும், ஒருங்கிணைப்பு சரிபார்ப்பு மற்றும் ONT வாசிப்புகளின் பிழைத் திருத்தத்திற்காக இல்லுமினாவுடன் கூடிய குறுகிய-வாசிப்பு வரிசைப்படுத்தலையும் ஒருங்கிணைப்பதன் மூலம் இது சாத்தியமாகிறது. எங்கள் சேவையானது, ஒருங்கிணைப்பு, செயல்பாட்டு விளக்கக்குறிப்பு மற்றும் மேம்பட்ட உயிரித்தகவல் பகுப்பாய்வு வரையிலான முழுமையான உயிரித்தகவல் பணிப்பாய்வை வழங்கி, குறிப்பிட்ட ஆராய்ச்சி இலக்குகளை நிறைவேற்றுகிறது. இந்தச் சேவையானது, பல்வேறு மரபியல் மற்றும் மரபணுத்தொகுதி ஆய்வுகளுக்குத் துல்லியமான குறிப்பு மரபணுத்தொகுதிகளை உருவாக்க உதவுகிறது. மேலும், இது திரிபு உகப்பாக்கம், மரபணுப் பொறியியல் மற்றும் நுண்ணுயிர்த் தொழில்நுட்ப மேம்பாடு போன்ற பயன்பாடுகளுக்கு அடிப்படையாக அமைகிறது. இதன்மூலம், அறிவியல் நுண்ணறிவுகளையும் உயிரித்தொழில்நுட்பப் புத்தாக்கங்களையும் மேம்படுத்துவதற்கு அவசியமான, நம்பகமான மற்றும் இடைவெளியற்ற மரபணுத்தொகுதித் தரவுகளை உறுதி செய்கிறது.
சேவை அம்சங்கள்
● மரபணுத்தொகுப்பின் விரும்பிய முழுமை அளவைப் பொறுத்து, தேர்ந்தெடுப்பதற்கு இரண்டு சாத்தியமான விருப்பங்கள் உள்ளன.
● வரைவு மரபணுத்தொகுதி தேர்வு: இல்லுமினா நோவாசீக் PE150 கொண்டு குறுகிய-வாசிப்பு வரிசைப்படுத்தல்.
● முழுமையான 0 இடைவெளி மரபணுத்தொகுதி.
● மரபணுத்தொகுதியை ஒன்றிணைப்பதற்காக, நானோபோர் புரோமெத்தியோன் 48 அல்லது பேக்பயோ ரெவியோவில் நீண்ட-வாசிப்பு வரிசைப்படுத்தல்.
● மரபணு சரிபார்ப்பு மற்றும் பிழை திருத்தத்திற்காக (நானோபோர்) அல்லது ஒரு வரைவு மரபணுவை உருவாக்குவதற்காக, இல்லுமினா நோவாசீக் (Illumina NovaSeq) கருவியில் செய்யப்படும் குறுகிய-வாசிப்பு வரிசைப்படுத்தல்.
சேவை நன்மைகள்
●இடைவெளியற்ற மரபணு உத்தரவாதம்இது, இல்லுமினா வரிசைப்படுத்தலை நீண்ட வாசிப்பு வரிசைப்படுத்தலுடன் (நானோபோர் அல்லது பேக்பையோ) ஒருங்கிணைத்ததன் காரணமாகும்.
●முழுமையான உயிரித் தகவல் பணிப்பாய்வு:இதில் மரபணுத்தொகுதி ஒருங்கிணைப்பு மற்றும் பல மரபணுக்கூறுகளின் முன்கணிப்பு, செயல்பாட்டு மரபணுக் குறிப்பீடு, மற்றும் சிர்கோஸ் வரைபடம் போன்ற மரபணுத்தொகுதி காட்சிப்படுத்தல்கள் ஆகியவை அடங்கும்.
●விரிவான நிபுணத்துவம்20,000-க்கும் மேற்பட்ட நுண்ணுயிரி மரபணுத்தொகுப்புகளைத் தொகுத்துள்ள BMKGENE, ஒரு தசாப்தத்திற்கும் மேலான அனுபவம், உயர் திறன்கொண்ட பகுப்பாய்வுக் குழு, விரிவான உள்ளடக்கம் மற்றும் சிறந்த விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு ஆகியவற்றை வழங்குகிறது.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு:திட்டம் நிறைவடைந்த பிறகும், 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் எங்கள் அர்ப்பணிப்பு தொடர்கிறது. இந்தக் காலகட்டத்தில், திட்டத்தின் தொடர் கண்காணிப்பு, பழுது நீக்கும் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான எந்தவொரு கேள்விகளுக்கும் பதிலளிக்கும் கேள்வி-பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
●பல்வேறு வரிசைப்படுத்தல் உத்திகள் உள்ளன:வெவ்வேறு ஆராய்ச்சி இலக்குகள் மற்றும் மரபணுத்தொகுதியின் முழுமைக்கான தேவைகளுக்காக.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| சேவை | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி |
| வரைவு மரபணு | இலுமினா PE150 100x |
| 0 இடைவெளி மரபணு | நானோபோர் 100x + இல்லுமினா PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (விருப்பத்தேர்வு) |
மாதிரித் தேவைகள்:
| செறிவு (ng/µL) | மொத்த அளவு (µg) | கன அளவு (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| பேக்பயோ | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| நானோ துளை | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| இலுமினா | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· பாக்டீரியா: ≥3.5x1010 செல்கள்
சேவை பணிப்பாய்வு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
பின்வரும் பகுப்பாய்வை உள்ளடக்கியது:
● வரிசைப்படுத்தல் தரவு தரக் கட்டுப்பாடு
● மரபணுத்தொகுப்பு உருவாக்கம்
● மரபணுக்கூறு பகுப்பாய்வு: CDS மற்றும் பல மரபணுக்கூறுகளின் முன்கணிப்பு
● பல பொதுவான தரவுத்தளங்கள் (GO, KEGG, போன்றவை) மற்றும் மேம்பட்ட தரவுத்தளங்கள் (CARD, CAZy, போன்றவை) உடனான செயல்பாட்டு விளக்கக்குறிப்பு.
● மரபணுத்தொகுதி காட்சிப்படுத்தல்
நாங்கள் மரபணுத்தொகுதியை எளிதில் அணுகக்கூடிய ஃபாஸ்டா வடிவத்திலும், மரபணுத்தொகுதி விளக்கக் கோப்பையும் (gff) வழங்குகிறோம்.
மரபணு குறிப்புரை – GO
மரபணு குறிப்புரை – CAZY கார்போஹைட்ரேட்டுகள்
மரபணுத்தொகுதி காட்சிப்படுத்தல் – சிர்கோஸ் வரைபடம்
BMKGene-இன் பாக்டீரியல் மரபணுத்தொகுப்பு ஒருங்கிணைப்பு சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை, கவனமாகத் தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் ஆராய்ந்து பாருங்கள்.
டாய், டபிள்யூ. மற்றும் பலர் (2023) 'ஆரோக்கியமான மனித பெருங்குடலில் இருந்து அல்சரேட்டிவ் கோலைட்டிஸ் சிகிச்சைக்கு பாதுகாப்பான மற்றும் புதுமையான புரோபயாடிக் பாக்டீரியாவாக பாக்டீராய்ட்ஸ் யூனிஃபார்மிஸ் F18-22-ஐக் கண்டறிதல்',சர்வதேச மூலக்கூறு அறிவியல் இதழ், 24(19), ப. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
காங், கியூ. மற்றும் பலர் (2021) 'சீனாவின் வனவிலங்குகளிலிருந்து பெறப்பட்ட, blaOXA-1 மற்றும் blaNDM-1 மரபணுக்களைக் கொண்ட பன்மருந்து எதிர்ப்பு புரோட்டியஸ் மிராபிலிஸ் தனித்த இனங்கள்: அதிகரித்து வரும் பொது சுகாதார அபாயம்',ஒருங்கிணைந்த விலங்கியல், 16(6), பக். 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
வாங், டி.டி. மற்றும் பலர் (2017) 'உள்வாழும் பேசில்லஸ் ஃபிளெக்ஸஸ் KLBMP 4941-இன் முழுமையான மரபணு வரிசைமுறை, அதன் தாவர வளர்ச்சி ஊக்குவிப்பு பொறிமுறையையும் உப்பு சகிப்புத்தன்மைக்கான மரபணு அடிப்படையையும் வெளிப்படுத்துகிறது',உயிரி தொழில்நுட்ப இதழ், 260, பக். 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
வாங், எக்ஸ். மற்றும் பலர். (2021) 'கிளெப்சியெல்லாவின் பல-நகல் எதிர்ப்பு பிளாஸ்மிடுகள் நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பு மரபணுக்களின் பரவலான பரவலுக்கு உதவுகின்றன',நுண்ணுயிரியலில் எல்லைகள், 12, பக். 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
