ஒப்பீட்டு மரபணுவியல்
சேவை நன்மைகள்
●விரிவான நிபுணத்துவம் மற்றும் வெளியீட்டுப் பதிவுகள்ஒட்டுமொத்தமாக, BMKGene 90-க்கும் மேற்பட்ட ஒப்பீட்டு மரபணுவியல் திட்டங்களை நிறைவு செய்துள்ளது, அதன் ஒட்டுமொத்த தாக்கக் காரணி 900-ஐ எட்டியுள்ளது.
●விரிவான உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வுஇந்தப் பகுப்பாய்வுத் தொகுப்பில், பொதுவாகத் தேவைப்படும் எட்டுப் பகுப்பாய்வுகள் அடங்கியுள்ளன. இவை, சிறப்பாக வடிவமைக்கப்பட்ட, வெளியிடுவதற்குத் தயாரான வரைபடங்களை வழங்குவதோடு, முடிவுகளை எளிதாகப் புரிந்துகொள்ளவும் வழிவகுக்கின்றன.
●உயர் திறன் வாய்ந்த உயிரித் தகவல் குழு மற்றும் குறுகிய பகுப்பாய்வு சுழற்சிஒப்பீட்டு மரபணுவியல் பகுப்பாய்வில் சிறந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுள்ள BMKGene குழு, பல்வேறு தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வுத் தேவைகளைக் குறுகிய கால அவகாசத்தில் பூர்த்தி செய்கிறது.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு:திட்டம் நிறைவடைந்த பிறகும், 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் எங்கள் அர்ப்பணிப்பு தொடர்கிறது. இந்தக் காலகட்டத்தில், திட்டத்தின் தொடர் கண்காணிப்பு, பழுது நீக்கும் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான எந்தவொரு கேள்விகளுக்கும் பதிலளிக்கும் கேள்வி-பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| மதிப்பிடப்பட்ட பணி நிறைவு நேரம் | இனங்களின் எண்ணிக்கை | பகுப்பாய்வுகள் |
| 30 வேலை நாட்கள் | 6 - 12 | மரபணு குடும்பக் கொத்து மரபணு குடும்ப விரிவாக்கம் மற்றும் சுருக்கம் மரபுவழி மரத்தை உருவாக்குதல் பிரிதல் நேர மதிப்பீடு (புதைபடிவ அளவுத்திருத்தம் தேவை) LTR செருகும் நேரம் (தாவரங்களுக்கு) முழு மரபணு இரட்டிப்பாதல் (தாவரங்களுக்கு) தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட அழுத்தம் சின்டெனி பகுப்பாய்வு |
உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வுகள்
● மரபணு குடும்பம்
● இனவரலாறு
● விலகல் நேரம்
● தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட அழுத்தம்
● மரபணு வரிசை பகுப்பாய்வு
மாதிரி தேவை மற்றும் விநியோகம்
மாதிரித் தேவைகள்:
மரபணு வரிசைப்படுத்தல் மற்றும் தொகுப்பிற்கான திசு அல்லது டிஎன்ஏ
திசுவிற்கு
| இனங்கள் | திசு | கணக்கெடுப்பு | பேக்பயோ சிசிஎஸ் |
| விலங்கு | உள்ளுறுப்பு திசு | 0.5 ~ 1 கிராம் | ≥ 3.5 கிராம் |
| தசை திசு | |||
| ≥ 5.0 கிராம் | |||
| ≥ 5.0 மிலி | |||
| பாலூட்டி இரத்தம் | |||
| ≥ 0.5 மிலி | |||
| கோழி/மீன் இரத்தம் | |||
| தாவரம் | புதிய இலை | 1 ~ 2 கிராம் | ≥ 5.0 கிராம் |
| இதழ்/தண்டு | 1 ~ 2 கிராம் | ≥ 10.0 கிராம் | |
| வேர்/விதை | 1 ~ 2 கிராம் | ≥ 20.0 கிராம் | |
| செல்கள் | வளர்க்கப்பட்ட செல் | - | ≥ 1 x 108 |
தரவு
நெருங்கிய தொடர்புடைய சிற்றினங்களின் மரபணு வரிசைமுறை கோப்புகள் (.fasta) மற்றும் விளக்கக் கோப்புகள் (.gff3)
சேவை பணிப்பாய்வு
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
*இங்கு காட்டப்பட்டுள்ள செயல்விளக்க முடிவுகள் அனைத்தும், பயோமார்க்கர் டெக்னாலஜிஸ் மூலம் வெளியிடப்பட்ட மரபணுத்தொகுப்புகளிலிருந்து பெறப்பட்டவை.
1. LTR செருகல் நேர மதிப்பீடு: மற்ற இனங்களுடன் ஒப்பிடுகையில், வெய்னிங் கம்பு மரபணுத்தொகுதியில் LTR-RT-களின் செருகல் நேரங்களில் ஒரு தனித்துவமான இருமுனைப் பரவலை இந்தப் படம் காட்டுகிறது. மிகச் சமீபத்திய உச்சம் சுமார் 0.5 மில்லியன் ஆண்டுகளுக்கு முன்பு தோன்றியது.
லி குவாங் மற்றும் பலர்,இயற்கை மரபியல், 2021
2. சயோட்டே (Sechium edule) மீதான இனவரலாறு மற்றும் மரபணு குடும்பப் பகுப்பாய்வு: சயோட்டே மற்றும் மரபணு குடும்பத்தில் உள்ள மற்ற 13 தொடர்புடைய சிற்றினங்களைப் பகுப்பாய்வு செய்ததில், சயோட்டே புடலங்காயுடன் (Trichosanthes anguina) மிகவும் நெருங்கிய தொடர்புடையது என்று கண்டறியப்பட்டது. சயோட்டே சுமார் 27-45 மில்லியன் ஆண்டுகளுக்கு முன்பு புடலங்காயிலிருந்து தோன்றியது. மேலும், 25±4 மில்லியன் ஆண்டுகளுக்கு முன்பு சயோட்டேயில் முழு மரபணு இரட்டிப்பு (WGD) காணப்பட்டது, இது குக்குர்பிட்டேசி குடும்பத்தில் (cucuibitaceae) நிகழ்ந்த மூன்றாவது முழு மரபணு இரட்டிப்பு நிகழ்வாகும்.
ஃபு ஏ மற்றும் பலர்,தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 2021
3. மரபணு வரிசைப் பகுப்பாய்வு: சயோட்டி, புடலங்காய் மற்றும் பூசணிக்காய் ஆகியவற்றில் பழ வளர்ச்சியில் பங்கு வகிக்கும் தாவர ஹார்மோன்கள் தொடர்பான சில மரபணுக்கள் கண்டறியப்பட்டன. சயோட்டிக்கும் புடலங்காய்க்கும் இடையிலான தொடர்பை விட, சயோட்டிக்கும் பூசணிக்காய்க்கும் இடையிலான தொடர்பு சற்றே அதிகமாக உள்ளது.
ஃபு ஏ மற்றும் பலர்,தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 2021
4. மரபணு குடும்பப் பகுப்பாய்வு: G.thurberi மற்றும் G.davidsonii மரபணுத்தொகுதிகளில் மரபணு குடும்ப விரிவாக்கம் மற்றும் சுருக்கம் குறித்த KEGG செறிவூட்டல், ஸ்டீராய்டு உயிரியக்கவியல் மற்றும் பிராஸினோஸ்டீராய்டு உயிரியக்கவியல் தொடர்பான மரபணுக்கள் விரிவடைந்திருப்பதைக் காட்டியது.
யாங் இசட் மற்றும் பலர்.,பிஎம்சி உயிரியல், 2021
5. முழு மரபணு இரட்டிப்புப் பகுப்பாய்வு: 4DTV மற்றும் Ks பரவல் பகுப்பாய்வு முழு மரபணு இரட்டிப்பு நிகழ்வைக் காட்டியது. ஒரே இனத்திற்குள் ஏற்பட்ட இரட்டிப்பு நிகழ்வுகளின் உச்சங்கள் காணப்பட்டன. வெவ்வேறு இனங்களுக்கு இடையேயான உச்சங்கள் சிற்றினமாதல் நிகழ்வுகளைக் காட்டின. மற்ற மூன்று நெருங்கிய தொடர்புடைய சிற்றினங்களுடன் ஒப்பிடும்போது, O. europaea மிகச் சமீபத்தில் ஒரு பெரிய அளவிலான மரபணு இரட்டிப்பிற்கு உள்ளாகியுள்ளது என்று இந்தப் பகுப்பாய்வு சுட்டிக்காட்டியது.
ராவ் ஜி மற்றும் பலர்,தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 2021
பிஎம்கே வழக்கு
முட்கள் இல்லாத ரோஜா: ஈரப்பதத்திற்கு ஏற்ப தகவமைத்துக் கொள்வது தொடர்பான மரபணுவியல் சார்ந்த நுண்ணறிவுகள்
வெளியிடப்பட்டது: தேசிய அறிவியல் ஆய்வு, 2021
வரிசைப்படுத்தும் உத்தி:
பேஸ்யின்முட்கள் இல்லாத(ஆர்.)விச்சுரைனன்மரபணுத்தொகுதி:
தோராயமாக 93 X பேக்பையோ + தோராயமாக 90 X நானோபோர் + 267 X இல்லுமினா
முக்கிய முடிவுகள்
1. நீண்ட-வாசிப்பு வரிசைப்படுத்தல் நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தி உயர்தரமான R.wichuraiana மரபணுத்தொகுதி கட்டமைக்கப்பட்டது, இது 530.07 Mb அளவிலான ஒரு தொகுப்பை அளித்தது (ஃப்ளோ சைட்டோமெட்ரி மூலம் மதிப்பிடப்பட்ட மரபணுத்தொகுதியின் அளவு தோராயமாக 525.9 Mb மற்றும் மரபணு ஆய்வு மூலம் 525.5 Mb ஆகும்; பல்லினத்தன்மை சுமார் 1.03% ஆக இருந்தது). BUSCO மதிப்பிடப்பட்ட மதிப்பெண் 93.9% ஆக இருந்தது. "ஓல்ட் பிளஷ்" (haploOB) உடன் ஒப்பிடுகையில், இந்த மரபணுத்தொகுதியின் தரம் மற்றும் முழுமை, அடிப்படை ஒற்றை-அடிப்படைத் துல்லியம் மற்றும் LTR தொகுப்புக் குறியீடு (LAI=20.03) ஆகியவற்றால் உறுதி செய்யப்பட்டது. R.wichuraiana மரபணுத்தொகுதி 32,674 புரதக் குறியீட்டு மரபணுக்களைக் கொண்டுள்ளது.
2. ஒப்பீட்டு மரபணுவியல், டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ், மரபணுத் தொகுதியின் QTL பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை உள்ளடக்கிய மல்டி-ஓமிக்ஸ் கூட்டுப் பகுப்பாய்வானது, R. wichuraiana மற்றும் Rosa chinensis ஆகியவற்றுக்கு இடையேயான முக்கியமான சிற்றினப் பிரிவை வெளிப்படுத்தியது. மேலும், QTL-களில் உள்ள தொடர்புடைய மரபணுக்களின் வெளிப்பாட்டு மாறுபாடு, தண்டு முள் வடிவமைப்புடன் தொடர்புடையதாக இருக்க வாய்ப்புள்ளது.
பேஸ் தார்ன்லெஸ் மற்றும் ரோசா சினென்சிஸ் ஆகியவற்றுக்கு இடையே, மரபணு வரிசைப் பகுப்பாய்வு, மரபணுக் குடும்பக் கொத்து, விரிவாக்கம் மற்றும் சுருக்கப் பகுப்பாய்வு உள்ளிட்ட ஒப்பீட்டு மரபணுவியல் பகுப்பாய்வானது, ரோஜாக்களின் முக்கியப் பண்புகளுடன் தொடர்புடைய ஏராளமான மாறுபாடுகளை வெளிப்படுத்தியது. NAC மற்றும் FAR1/FRS மரபணுக் குடும்பத்தில் ஏற்பட்ட தனித்துவமான விரிவாக்கமானது, கருப்புப் புள்ளி நோய்க்கு எதிரான எதிர்ப்புத்திறனுடன் தொடர்புடையதாக இருப்பதற்கு அதிக வாய்ப்புள்ளது.
BT மற்றும் haploOB மரபணுத்தொகுதிகளுக்கு இடையேயான ஒப்பீட்டு மரபணுவியல் பகுப்பாய்வு.
சோங், எம்., மற்றும் பலர். “முட்கள் இல்லாத ரோஜா: ஈரப்பதத்திற்கு ஏற்ப தகவமைத்துக் கொள்வது தொடர்பான மரபணுவியல் சார்ந்த நுண்ணறிவுகள்”தேசிய அறிவியல் ஆய்வு, 2021;, nwab092.
