முழு நீள mRNA வரிசைப்படுத்தல் - பேக்பயோ
அம்சங்கள்
● பாலி-ஏ mRNA-விலிருந்து cDNA தொகுப்பு மற்றும் அதனைத் தொடர்ந்து லைப்ரரி தயாரிப்பு
● CCS பயன்முறையில் வரிசைப்படுத்துதல், HiFi ரீடுகளை உருவாக்குதல்
● முழு நீளப் படியெடுத்தல்களின் வரிசைப்படுத்தல்
● இந்தப் பகுப்பாய்விற்கு ஒரு குறிப்பு மரபணுத்தொகுதி அவசியமில்லை; இருப்பினும், அது பயன்படுத்தப்படலாம்.
● உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வானது, டிரான்ஸ்கிரிப்டுகள், ஐசோஃபார்ம், lncRNA, மரபணு இணைவுகள், பாலி-அடினைலேஷன் மற்றும் மரபணு அமைப்பு ஆகியவற்றை பகுப்பாய்வு செய்ய உதவுகிறது.
சேவை நன்மைகள்
●உயர் துல்லியம்: HiFi 99.9%-க்கும் அதிகமான (Q30) துல்லியத்துடன் அளவீடுகளை வழங்குகிறது, இது NGS-க்கு இணையானது.
● மாற்றுப் பிணைப்புப் பகுப்பாய்வுமுழு டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளையும் வரிசைப்படுத்துவது ஐசோஃபார்ம்களை அடையாளம் காணவும் வகைப்படுத்தவும் உதவுகிறது.
●விரிவான நிபுணத்துவம்1100-க்கும் மேற்பட்ட PacBio முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் திட்டங்களை நிறைவுசெய்து, 2300-க்கும் மேற்பட்ட மாதிரிகளைச் செயலாக்கிய அனுபவத்துடன், எங்கள் குழு ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் தனது பரந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுவருகிறது.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவுதிட்டம் நிறைவடைந்த பிறகும், 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் எங்கள் அர்ப்பணிப்பு தொடர்கிறது. இந்தக் காலகட்டத்தில், திட்டத்தின் தொடர் கண்காணிப்பு, பழுது நீக்கும் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான எந்தவொரு கேள்விகளுக்கும் பதிலளிக்கும் கேள்வி-பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
மாதிரி தேவை மற்றும் விநியோகம்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| பாலிஏ செறிவூட்டப்பட்ட mRNA CCS நூலகம் | பேக்பயோ இரண்டாம் பாகம் பேக்பயோ ரெவியோ | 20/40 ஜிபி 5/10 எம் சிசிஎஸ் | Q30≥85% |
மாதிரித் தேவைகள்:
நியூக்ளியோடைடுகள்:
● தாவரங்கள்:
வேர், தண்டு அல்லது இதழ்: 450 மி.கி.
இலை அல்லது விதை: 300 மி.கி.
பழம்: 1.2 கிராம்
● விலங்கு:
இதயம் அல்லது குடல்: 300 மி.கி.
உள்ளுறுப்புகள் அல்லது மூளை: 240 மி.கி.
தசை: 450 மி.கி.
எலும்புகள், முடி அல்லது தோல்: 1 கிராம்
● கணுக்காலிகள்:
பூச்சிகள்: 6 கிராம்
க்ரஸ்டேசியா: 300 மி.கி.
● முழு இரத்தம்: 1 குழாய்
● செல்கள்: 106 செல்கள்
| செறிவு (ng/μl) | அளவு (மைக்ரோகிராம்) | தூய்மை | நேர்மை |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ஜெல் மீது புரதம் அல்லது டிஎன்ஏ கலப்படம் குறைவாகவோ அல்லது இல்லாமலோ இருப்பது தெரிகிறது. | தாவரங்களுக்கு: RIN≥7.5; விலங்குகளுக்கு: RIN≥8.0; 5.0≥ 28S/18S≥1.0; குறைந்த அல்லது அடிப்படை உயர்வு இல்லை |
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
கொள்கலன்: 2 மில்லி சென்ட்ரிஃபியூஜ் குழாய் (தகரத் தகடு பரிந்துரைக்கப்படவில்லை)
மாதிரி குறியிடல்: குழு+பிரதி, எ.கா. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
சரக்கு அனுப்புதல்:
1. உலர் பனிக்கட்டி: மாதிரிகளைப் பைகளில் அடைத்து, உலர் பனிக்கட்டியில் புதைக்க வேண்டும்.
2. ஆர்.என்.ஏ ஸ்டேபிள் குழாய்கள்: ஆர்.என்.ஏ மாதிரிகளை, ஆர்.என்.ஏ நிலைப்படுத்தும் குழாயில் (எ.கா. ஆர்.என்.ஏ ஸ்டேபிள்®) உலர்த்தி, அறை வெப்பநிலையில் அனுப்பலாம்.
சேவை பணிப்பாய்வு
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
ஆர்.என்.ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
பின்வரும் பகுப்பாய்வை உள்ளடக்கியது:
● மூலத் தரக் கட்டுப்பாடு
● மாற்று பாலிஅடினைலேஷன் பகுப்பாய்வு (APA)
● இணைவுப் படி பகுப்பாய்வு
● மாற்றுப் பிணைப்புப் பகுப்பாய்வு
● உலகளாவிய ஒற்றை நகல் ஆர்த்தோலாக்ஸ் (BUSCO) பகுப்பாய்வை அளவுகோலிடுதல்
● நாவல் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் பகுப்பாய்வு: குறியீட்டு வரிசைகளின் (CDS) கணிப்பு மற்றும் செயல்பாட்டு விளக்கம்
● lncRNA பகுப்பாய்வு: lncRNA மற்றும் அதன் இலக்குகளைக் கணித்தல்
● நுண் செயற்கைக்கோள் அடையாளம் (SSR)
BUSCO பகுப்பாய்வு
மாற்றுப் பிணைப்புப் பகுப்பாய்வு
மாற்று பாலிஅடினைலேஷன் பகுப்பாய்வு (APA)
புதிய டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளின் செயல்பாட்டு குறிப்புரை
இந்தச் சிறப்பு வெளியீட்டில், BMKGene-இன் நானோபோர் முழு நீள mRNA வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை ஆராய்ந்து பாருங்கள்.
மா, ஒய். மற்றும் பலர். (2023) 'நெமோபைலேமா நோமுராய் விஷத்தை அடையாளம் காண்பதற்கான பேக்பயோ மற்றும் ஓஎன்டி ஆர்என்ஏ வரிசைப்படுத்தல் முறைகளின் ஒப்பீட்டு பகுப்பாய்வு', ஜீனோமிக்ஸ், 115(6), ப. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
சாவோ, கியூ. மற்றும் பலர். (2019) 'பாப்புலஸ் தண்டு டிரான்ஸ்கிரிப்டோமின் வளர்ச்சி இயக்கவியல்', தாவர உயிரி தொழில்நுட்ப இதழ், 17(1), பக். 206–219. doi: 10.1111/PBI.12958.
டெங், எச். மற்றும் பலர். (2022) 'ஆக்டினிடா லேட்டிஃபோலியாவின் (அஸ்கார்பேட் நிறைந்த பழப் பயிர்) பழ வளர்ச்சி மற்றும் பழுக்கும் போது அஸ்கார்பிக் அமில உள்ளடக்கத்தில் ஏற்படும் மாறும் மாற்றங்கள் மற்றும் அதனுடன் தொடர்புடைய மூலக்கூறு வழிமுறைகள்', சர்வதேச மூலக்கூறு அறிவியல் இதழ், 23(10), ப. 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
ஹுவா, எக்ஸ். மற்றும் பலர். (2022) 'பாரிஸ் பாலிஃபில்லாவில் உள்ள உயிரியல் ரீதியாக செயல்படும் பாலிஃபிலின்களில் ஈடுபட்டுள்ள உயிர் தொகுப்பு பாதை மரபணுக்களின் பயனுள்ள கணிப்பு', கம்யூனிகேஷன்ஸ் பயாலஜி 2022 5:1, 5(1), பக். 1–10. doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
லியு, எம். மற்றும் பலர். (2023) 'டூட்டா அப்சொலூட்டா (மெய்ரிக்) டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் மற்றும் சைட்டோக்ரோம் பி450 மரபணுக்களின் ஒருங்கிணைந்த பேக்பயோ ஐசோ-சீக் மற்றும் இல்லுமினா ஆர்என்ஏ-சீக் பகுப்பாய்வு', பூச்சிகள், 14(4), ப. 363. doi: 10.3390/INSECTS14040363/S1.
வாங், லிஜுன் மற்றும் பலர். (2019) 'ரிசினஸ் கம்யூனிஸில் ரிசினோலிக் அமில உயிர் தொகுப்பை நன்கு புரிந்துகொள்வதற்காக, பேக்பையோ ஒற்றை-மூலக்கூறு நிகழ்நேர பகுப்பாய்வை இல்லுமினா ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையுடன் இணைத்து டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சிக்கலான தன்மை பற்றிய ஒரு ஆய்வு', பிஎம்சி ஜெனோமிக்ஸ், 20(1), பக். 1–17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9.
