●தளங்கள்:இலுமினா நோவாசீக் 6000 மற்றும் நோவாசீக் எக்ஸ் பிளஸ்
●வரிசைப்படுத்தும் முறைகள்:PE150 மற்றும் PE250
●வரிசைப்படுத்துதலுக்கு முன் நூலகங்களின் தரக் கட்டுப்பாடு
●வரிசைப்படுத்தல் தரவு தரக்கட்டுப்பாடு மற்றும் விநியோகம்:Q30 ரீடுகளை டீமல்டிபிளெக்சிங் மற்றும் வடிகட்டிய பிறகு, QC அறிக்கை மற்றும் மூலத் தரவை ஃபாஸ்ட்க்யூ (fastq) வடிவத்தில் வழங்குதல்.
●வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளின் பன்முகத்தன்மை:வாடிக்கையாளர் லேன், ஃப்ளோ செல் அல்லது தேவைப்படும் தரவின் அளவு (பகுதி லேன் வரிசைப்படுத்தல்) ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் வரிசைப்படுத்தலைத் தேர்வு செய்யலாம்.
●இலுமினா வரிசைப்படுத்தல் தளத்தில் விரிவான அனுபவம்:பல்வேறு இனங்களைக் கொண்ட ஆயிரக்கணக்கான முடிக்கப்பட்ட திட்டங்களுடன்.
●வரிசைப்படுத்தல் தரக்கட்டுப்பாட்டு அறிக்கையை வழங்குதல்:வரிசைப்படுத்தல் திட்டத்தின் தர அளவீடுகள், தரவுத் துல்லியம் மற்றும் ஒட்டுமொத்த செயல்திறன் ஆகியவற்றுடன்.
●முதிர்ந்த வரிசைப்படுத்தல் செயல்முறை:குறுகிய கால அவகாசத்தில்
●கடுமையான தரக் கட்டுப்பாடுதொடர்ச்சியாக உயர்தரமான முடிவுகள் வழங்கப்படுவதை உறுதி செய்வதற்காக, நாங்கள் கடுமையான தரக்கட்டுப்பாட்டுத் தேவைகளைச் செயல்படுத்துகிறோம்.
| தளம் | பாய்வு செல் | வரிசைப்படுத்தும் முறை | அலகு | மதிப்பிடப்பட்ட வெளியீடு |
| நோவாசீக் எக்ஸ் | 10பி (8 பாதைகள்) | PE150 | ஒற்றைப் பாதை பகுதி பாதை | 375ஜிபி / லேன் |
| 25B (8 பாதைகள்) | PE150 | ஒற்றைப் பாதை பகுதி பாதை | 1000 ஜிபி/வழித்தடம் | |
| நோவாசீக் 6000 | SP ஃப்ளோ செல் (2 பாதைகள்) | PE250 | பாய்வு செல் ஒற்றைப் பாதை பகுதி பாதை | 325-400 மில்லியன் வாசிப்புகள் / பாதை |
| S4 பாய்வு செல் (4 பாதைகள்) | PE150 | பாய்வு செல் ஒற்றைப் பாதை பகுதி பாதை | ~800 ஜிபி / லேன் |
| தரவு அளவு (X) | செறிவு (qPCR/nM) | தொகுதி | |
| பகுதி பாதை வரிசைப்படுத்தல்
| X ≤ 10 ஜிபி | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 ஜிபி < X ≤ 50 ஜிபி | ≥ 2 நானோமீட்டர் | ≥ 25 μl | |
| 50 ஜிபி < X ≤ 100 ஜிபி | ≥ 3 நானோமீட்டர் | ≥ 25 μl | |
| X > 100 ஜிபி | ≥ 4 நானோமீட்டர் | ≥ 25 μl | |
| பாதை வரிசைப்படுத்துதல் | பெர் லேன் | ≥ 1.5 நானோமீட்டர் / நூலகத் தொகுப்பு | ≥ 25 μl / நூலகத் தொகுப்பு |
செறிவு மற்றும் மொத்த அளவு மட்டுமின்றி, பொருத்தமான உச்ச வடிவமும் தேவைப்படுகிறது.
குறிப்பு: குறைந்த பன்முகத்தன்மை கொண்ட லைப்ரரிகளின் லேன் சீக்வென்சிங்கிற்கு, வலுவான பேஸ் காலிங்கை உறுதிசெய்ய PhiX ஸ்பைக்-இன் தேவைப்படுகிறது.
முன்-பூல் செய்யப்பட்ட லைப்ரரிகளை மாதிரிகளாகச் சமர்ப்பிக்கப் பரிந்துரைக்கிறோம். லைப்ரரி பூலிங்கைச் செய்ய BMKGENE உங்களுக்குத் தேவைப்பட்டால், தயவுசெய்து இதைப் பார்க்கவும்.
பகுதி லேன் வரிசைப்படுத்தலுக்கான நூலகத் தேவைகள்.
முக்கிய உச்சம் 300-450 bp க்குள் இருக்க வேண்டும்.
லைப்ரரிகளில் ஒரே ஒரு முதன்மை சிகரம் இருக்க வேண்டும், அடாப்டர் கலப்படம் மற்றும் பிரைமர் டைமர்கள் இருக்கக்கூடாது.
வரிசைப்படுத்துதல், நூலகத்தின் அளவை மதிப்பிடுதல் மற்றும் துண்டாக்கம் ஆகியவற்றுக்கு முன்னர், நூலகத்தின் தரம் குறித்த அறிக்கை வழங்கப்படுகிறது.
அட்டவணை 1. வரிசைப்படுத்தல் தரவு குறித்த புள்ளிவிவரங்கள்.
| மாதிரி ஐடி | BMKID | மூல வாசிப்புகள் | மூலத் தரவு (bp) | தெளிவான வாசிப்புகள் (%) | Q20(%) | கேள்வி 30 (%) | ஜிசி(%) |
| சி_01 | பிஎம்கே_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| சி_02 | பிஎம்கே_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
படம் 1. ஒவ்வொரு மாதிரியிலும் உள்ள வாசிப்புகளின் தரப் பரவல்.
படம் 2. அடிப்படை உள்ளடக்கப் பரவல்
படம் 3. வரிசைப்படுத்தல் தரவுகளில் வாசிப்பு உள்ளடக்கங்களின் பரவல்.