-
குரோமாடின் இம்யூனோபிரெசிபிட்டேஷன் சீக்வென்சிங் (ChIP-seq)
ஹிஸ்டோன் மாற்றம், டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் மற்றும் பிற டிஎன்ஏ-தொடர்புடைய புரதங்களுக்கான டிஎன்ஏ இலக்குகளின் மரபணு அளவிலான விவரக்குறிப்பை ChIP-Seq வழங்குகிறது.இது குறிப்பிட்ட புரத-டிஎன்ஏ வளாகங்களை மீட்டெடுக்க குரோமாடின் இம்யூனோ-பிரிசிபிட்டேஷன் (சிஐபி) தேர்வை ஒருங்கிணைக்கிறது, மீட்கப்பட்ட டிஎன்ஏவின் உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறைக்கான அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறையின் (என்ஜிஎஸ்) சக்தியுடன்.கூடுதலாக, புரதம்-டிஎன்ஏ வளாகங்கள் உயிரணுக்களிலிருந்து மீட்டெடுக்கப்படுவதால், பிணைப்பு தளங்களை வெவ்வேறு செல் வகைகள் மற்றும் திசுக்களில் அல்லது வெவ்வேறு நிலைமைகளின் கீழ் ஒப்பிடலாம்.பயன்பாடுகள் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ஒழுங்குமுறை முதல் வளர்ச்சி பாதைகள் வரை நோய் வழிமுறைகள் மற்றும் அதற்கு அப்பால் உள்ளன.
இயங்குதளம்: Illumina NovaSeq 6000
-
முழு மரபணு பைசல்ஃபைட் வரிசைமுறை
சைட்டோசினில் (5-எம்சி) ஐந்தாவது இடத்தில் டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன் மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் செல்லுலார் செயல்பாட்டில் ஒரு அடிப்படை செல்வாக்கைக் கொண்டுள்ளது.அசாதாரண மெத்திலேஷன் முறைகள் புற்றுநோய் போன்ற பல நிலைமைகள் மற்றும் நோய்களுடன் தொடர்புடையவை.ஒற்றை அடிப்படைத் தீர்மானத்தில் மரபணு அளவிலான மெத்திலேஷனைப் படிப்பதற்கான தங்கத் தரமாக WGBS ஆனது.
இயங்குதளம்: Illumina NovaSeq6000
-
ஹை த்ரோபுட் சீக்வென்சிங் (ATAC-seq) உடன் டிரான்ஸ்போசேஸ்-அணுகக்கூடிய குரோமாடினுக்கான மதிப்பீடு
ATAC-seq என்பது மரபணு அளவிலான குரோமாடின் அணுகலை பகுப்பாய்வு செய்வதற்கான உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறை முறையாகும், இது மரபணு வெளிப்பாட்டின் உலகளாவிய எபிஜெனெடிக் கட்டுப்பாட்டிற்கு முக்கியமானது.அதிவேக Tn5 டிரான்ஸ்போசேஸ் மூலம் சீக்வென்சிங் அடாப்டர்கள் திறந்த குரோமாடின் பகுதிகளில் செருகப்படுகின்றன.PCR பெருக்கத்திற்குப் பிறகு, ஒரு வரிசை நூலகம் கட்டப்பட்டது.அனைத்து திறந்த குரோமாடின் பகுதிகளும் ஒரு குறிப்பிட்ட இட-நேர நிபந்தனையின் கீழ் பெறப்படலாம், இது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி அல்லது ஒரு குறிப்பிட்ட ஹிஸ்டோன் மாற்றியமைக்கப்பட்ட பகுதியின் பிணைப்பு தளங்களுக்கு மட்டும் அல்ல.
-
குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவம் பைசல்பைட் வரிசைமுறை (RRBS)
டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன் ஆராய்ச்சி எப்போதுமே நோய் ஆராய்ச்சியில் பரபரப்பான தலைப்பாக இருந்து வருகிறது, மேலும் இது மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் பினோ-டைபிக் பண்புகளுடன் நெருக்கமாக தொடர்புடையது.RRBS என்பது டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன் ஆராய்ச்சிக்கான துல்லியமான, திறமையான மற்றும் சிக்கனமான முறையாகும்.என்சைம் பிளவு (Msp I) மூலம் ஊக்குவிப்பாளர் மற்றும் CpG தீவுப் பகுதிகளை செறிவூட்டுவது, Bisulfite வரிசைமுறையுடன் இணைந்து, உயர் தெளிவுத்திறன் கொண்ட DNA மெத்திலேஷன் கண்டறிதலை வழங்குகிறது.
இயங்குதளம்: Illumina NovaSeq 6000
