பரிணாம மரபியல்
சேவை நன்மைகள்
தகாகி மற்றும் பலர்,தாவர இதழ், 2013
●விரிவான உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வு:சிற்றினங்களின் பரிணாம ஆற்றலைப் பிரதிபலிக்கும் மரபணுப் பன்முகத்தன்மையை மதிப்பிட உதவுவதோடு, ஒருங்கு பரிணாமம் மற்றும் இணைப் பரிணாமத்தின் தாக்கத்தைக் குறைத்து, சிற்றினங்களுக்கு இடையேயான நம்பகமான இனவகைப்பாட்டு உறவை வெளிப்படுத்துகிறது.
●விருப்பத்திற்கேற்ப தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வுநியூக்ளியோடைடு மற்றும் அமினோ அமில மட்டத்திலான மாறுபாடுகளின் அடிப்படையில் வேறுபாட்டு நேரம் மற்றும் வேகத்தை மதிப்பிடுவது போன்றவை.
●விரிவான நிபுணத்துவம் மற்றும் வெளியீட்டுப் பதிவுகள்BMKGene நிறுவனம், 15 ஆண்டுகளுக்கும் மேலாக மக்கள் தொகை மற்றும் பரிணாம மரபியல் திட்டங்களில் ஆயிரக்கணக்கான உயிரினங்களை உள்ளடக்கிய மகத்தான அனுபவத்தைக் குவித்துள்ளதுடன், நேச்சர் கம்யூனிகேஷன்ஸ், மாலிகுலர் பிளான்ட்ஸ், பிளான்ட் பயோடெக்னாலஜி ஜர்னல் போன்ற இதழ்களில் வெளியிடப்பட்ட 1000-க்கும் மேற்பட்ட உயர்மட்டத் திட்டங்களுக்கும் பங்களித்துள்ளது.
● உயர் திறன்கொண்ட உயிரித் தகவல் குழு மற்றும் குறுகிய பகுப்பாய்வுச் சுழற்சிமேம்பட்ட மரபணுவியல் பகுப்பாய்வில் சிறந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுள்ள BMKGene குழு, விரிவான பகுப்பாய்வுகளை விரைவான காலக்கெடுவில் வழங்குகிறது.
● விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு:திட்டம் நிறைவடைந்த பிறகும், 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் எங்கள் அர்ப்பணிப்பு தொடர்கிறது. இந்தக் காலகட்டத்தில், திட்டத்தின் தொடர் கண்காணிப்பு, பழுது நீக்கும் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான எந்தவொரு கேள்விகளுக்கும் பதிலளிக்கும் கேள்வி-பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
சேவை விவரக்குறிப்புகள் மற்றும் தேவைகள்
| வரிசைப்படுத்தலின் வகை | பரிந்துரைக்கப்பட்ட மக்கள்தொகை அளவு | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | நியூக்ளியோடைடு தேவை |
| முழு மரபணு வரிசைமுறை | 30 அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட நபர்கள், ஒவ்வொரு துணைக்குழுவிலிருந்தும் 10 அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட நபர்களுடன்.
| 10x | செறிவு: ≥ 1 ng/ µL மொத்த அளவு ≥ 30ng சிதைவு அல்லது மாசுபடுதல் குறைவாக அல்லது முற்றிலும் இல்லை. |
| குறிப்பிட்ட-இட பெருக்கப்பட்ட துண்டு (SLAF) | குறிச்சொல் ஆழம்: 10x குறிச்சொற்களின் எண்ணிக்கை: <400 Mb: WGS பரிந்துரைக்கப்படுகிறது <1ஜிபி: 100K குறிச்சொற்கள் 1ஜிபி >2ஜிபி: 300K குறிச்சொற்கள் அதிகபட்சம் 500k குறிச்சொற்கள் | செறிவு ≥ 5 ng/µL மொத்த அளவு ≥ 80 ng நானோட்ராப் OD260/280=1.6-2.5 அகரோஸ் ஜெல்: சிதைவு அல்லது மாசுபடுதல் இல்லை அல்லது குறைவாக உள்ளது.
|
சேவை பணிப்பாய்வு
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
இந்தச் சேவையில் இனக்கூட்டக் கட்டமைப்பு (மரபுவழி மரம், முதன்மை கூறு பகுப்பாய்வு, இனக்கூட்ட அடுக்கு வரைபடம்), இனக்கூட்டப் பன்முகத்தன்மை மற்றும் இனக்கூட்டத் தேர்வு (இணைப்புச் சமநிலையின்மை, சாதகமான தளங்களின் தேர்ந்தெடுத்தல்) ஆகியவற்றின் பகுப்பாய்வு அடங்கும். இந்தச் சேவையில் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வுகளும் (எ.கா. வேறுபாட்டுக் காலம், மரபணுப் பரிமாற்றம்) சேர்க்கப்படலாம்.
*இங்கு காட்டப்பட்டுள்ள செயல்விளக்க முடிவுகள் அனைத்தும் BMKGENE உடன் வெளியிடப்பட்ட மரபணுத்தொகுப்புகளிலிருந்து பெறப்பட்டவை.
1. பரிணாமப் பகுப்பாய்வானது, மரபணு மாறுபாடுகளின் அடிப்படையில் இனவகை மரத்தை உருவாக்குதல், இனக்கூட்டக் கட்டமைப்பு மற்றும் முதன்மை கூறு பகுப்பாய்வு (PCA) ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியுள்ளது.
மரபுவழி மரம் என்பது, பொதுவான மூதாதையரைக் கொண்ட சிற்றினங்களுக்கு இடையேயான வகைப்பாட்டியல் மற்றும் பரிணாம உறவுகளைக் குறிக்கிறது.
துணை மக்கள்தொகைகளுக்கு இடையிலான நெருக்கத்தைக் காட்சிப்படுத்துவதே PCA-வின் நோக்கம்.
மக்கள்தொகைக் கட்டமைப்பு, அல்லீல் அதிர்வெண்களின் அடிப்படையில் மரபணு ரீதியாக வேறுபட்ட துணை மக்கள்தொகைகளின் இருப்பைக் காட்டுகிறது.
சென், மற்றும் பலர்.PNAS, 2020
2. தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட துடைப்பு
தேர்ந்தெடுத்த துடைப்பு என்பது, ஒரு சாதகமான தளம் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டு, அதனுடன் தொடர்புடைய நடுநிலைத் தளங்களின் அதிர்வெண்கள் அதிகரிக்கப்பட்டு, தொடர்பற்ற தளங்களின் அதிர்வெண்கள் குறைக்கப்படும் ஒரு செயல்முறையைக் குறிக்கிறது, இதன் விளைவாக பிராந்தியக் குறைப்பு ஏற்படுகிறது.
நகரும் சாளரத்திற்குள் (100 Kb) உள்ள அனைத்து SNP-களின் மக்கள் தொகை மரபியல் குறியீட்டை (π, Fst, Tajima's D) ஒரு குறிப்பிட்ட படிநிலையில் (10 Kb) கணக்கிடுவதன் மூலம், தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட துடைப்புப் பகுதிகளில் மரபணுத்தொகுதி முழுவதையும் கண்டறியும் செயல்முறை செயல்படுத்தப்படுகிறது.
நியூக்ளியோடைடு பன்முகத்தன்மை (π)
தாஜிமாவின் டி
நிலைப்படுத்தல் குறியீடு (Fst)
வூ, மற்றும் பலர்.மூலக்கூறு தாவரம், 2018
3. மரபணு ஓட்டம்
வூ, மற்றும் பலர்.மூலக்கூறு தாவரம், 2018
4. மக்கள்தொகை வரலாறு
ஜாங், மற்றும் பலர்.இயற்கை சூழலியல் மற்றும் பரிணாமம், 2021
5. விலகல் நேரம்
ஜாங், மற்றும் பலர்.இயற்கை சூழலியல் மற்றும் பரிணாமம், 2021
BMKGene-இன் பரிணாம மரபியல் சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை, கவனமாகத் தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் அறிந்துகொள்ளுங்கள்:
ஹசன்யார், ஏ.கே. மற்றும் பலர் (2023) 'முழு மரபணு மறுவரிசைப்படுத்தல் மூலம் ஏபிஸ் செரானா செரானா லார்வாக்களில் சாக்குபுரூட் வைரஸ் எதிர்ப்புடன் தொடர்புடைய SNP மூலக்கூறு குறிப்பான்கள் மற்றும் வேட்பாளர் மரபணுக்களைக் கண்டறிதல்',மூலக்கூறு அறிவியல் சர்வதேச இதழ், 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
சாய், ஜே. மற்றும் பலர் (2022) 'மரபணுத் தூய்மையான ஒரு காட்டு சீன ராட்சத சாலமண்டரின் கண்டுபிடிப்பு புதிய பாதுகாப்பு வாய்ப்புகளை உருவாக்குகிறது',விலங்கியல் ஆராய்ச்சி, 2022, தொகுதி 43, இதழ் 3, பக்கங்கள்: 469-480, 43(3), பக். 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
ஹான், எம். மற்றும் பலர். (2022) 'கிங்காய்-திபெத்திய பீடபூமியில் காணப்படும் பூர்வீக எலிமஸ் சைபிரிகஸ் எல். இனத்தின் இனப்புவியியல் அமைப்பு மற்றும் இனத்தொகை பரிணாம வரலாறு',தாவர அறிவியலில் எல்லைகள், 13, ப. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
வாங், ஜே. மற்றும் பலர் (2022) 'குரோமோசோம்-நிலை மரபணுத்தொகுப்பு ஒருங்கிணைப்பு மற்றும் லோங்கன் ரகங்களின் இனத்தொகை மரபணுவியல் ஆகியவற்றிலிருந்து லோங்கன் பரிணாமம் குறித்த மரபணுவியல் நுண்ணறிவுகள்',தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சி, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
