டி நோவோ ஃபங்கல் ஜீனோம் அசெம்பிளி
BMKGENE பூஞ்சை மரபணுக்களுக்கு பல்துறை தீர்வுகளை வழங்குகிறது, இது பல்வேறு ஆராய்ச்சி தேவைகள் மற்றும் விரும்பிய மரபணு முழுமையைப் பூர்த்தி செய்கிறது. குறுகிய-வாசிப்பு இல்லுமினா வரிசைமுறையை மட்டும் பயன்படுத்துவது ஒரு வரைவு மரபணுவை உருவாக்க அனுமதிக்கிறது. நானோபோர் அல்லது பேக்பியோவைப் பயன்படுத்தி குறுகிய-வாசிப்பு மற்றும் நீண்ட-வாசிப்பு வரிசைமுறை ஆகியவை நீண்ட கான்டிஜ்களுடன் மிகவும் சுத்திகரிக்கப்பட்ட பூஞ்சை மரபணுவிற்கு இணைக்கப்படுகின்றன. மேலும், Hi-C வரிசைமுறையை ஒருங்கிணைப்பது திறன்களை மேலும் மேம்படுத்துகிறது, முழுமையான குரோமோசோம்-நிலை மரபணுவை அடைய உதவுகிறது.
சேவை அம்சங்கள்
மரபணு முழுமையின் விரும்பிய அளவைப் பொறுத்து தேர்வு செய்ய மூன்று சாத்தியமான விருப்பங்களுடன்:
● வரைவு ஜீனோம் விருப்பம்: இல்லுமினா நோவாசெக் PE150 உடன் சுருக்கமாகப் படிக்க வரிசைப்படுத்துதல்.
● பூஞ்சை நுண்ணிய ஜீனோம் விருப்பம்:
மரபணு ஆய்வு: இல்லுமினா நோவாசெக் PE150.
ஜீனோம் அசெம்பிளி: PacBio Revio (HiFi வாசிப்புகள்) அல்லது Nanopore PromethION 48.
● குரோமோசோம்-நிலை பூஞ்சை மரபணு:
மரபணு ஆய்வு: இல்லுமினா நோவாசெக் PE150.
ஜீனோம் அசெம்பிளி: PacBio Revio (HiFi வாசிப்புகள்) அல்லது Nanopore PromethION 48.
ஹை-சி அசெம்பிளியுடன் கான்டிக் ஆங்கரிங்.
சேவை நன்மைகள்
●பல வரிசைமுறை உத்திகள் கிடைக்கின்றன: பல்வேறு ஆராய்ச்சி இலக்குகள் மற்றும் மரபணு முழுமைக்கான தேவைகளுக்கு
●முழுமையான உயிர் தகவலியல் பணிப்பாய்வு:இதில் மரபணு அசெம்பிளி மற்றும் பல மரபணு கூறுகளின் முன்கணிப்பு, செயல்பாட்டு மரபணு குறிப்பு மற்றும் கான்டிக் நங்கூரமிடுதல் ஆகியவை அடங்கும்.
●விரிவான நிபுணத்துவம்: 12,000 க்கும் மேற்பட்ட நுண்ணுயிர் மரபணுக்கள் ஒன்றுகூடி, ஒரு தசாப்தத்திற்கும் மேலான அனுபவம், மிகவும் திறமையான பகுப்பாய்வுக் குழு, விரிவான உள்ளடக்கம் மற்றும் சிறந்த விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவை நாங்கள் கொண்டு வருகிறோம்.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு:எங்கள் உறுதிப்பாடு, 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன், திட்டத்தை முடிப்பதற்கும் அப்பால் நீண்டுள்ளது. இந்த நேரத்தில், முடிவுகள் தொடர்பான ஏதேனும் கேள்விகளுக்கு தீர்வு காண, திட்ட பின்தொடர்தல், சரிசெய்தல் உதவி மற்றும் கேள்வி பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| சேவை | வரிசைமுறை உத்தி | தரக் கட்டுப்பாடு |
| வரைவு ஜீனோம் | இல்லுமினா PE150 100x | கே30≥85% |
| நுண்ணிய ஜீனோம் | மரபணு ஆய்வு: இல்லுமினா PE150 50 x அசெம்பிளி: PacBio HiFi 30x அல்லது Nanopore 100x | கான்டிக் N50 ≥1Mb (பேக்பியோ யூனிசெல்லுலர்) கான்டிக் N50 ≥2Mb (ONT யூனிசெல்லுலர்) contig N50 ≥500kb (மற்றவை) |
| குரோமோசோம்-நிலை மரபணுத்தொகுதி | மரபணு ஆய்வு: இல்லுமினா PE150 50 x அசெம்பிளி: PacBio HiFi 30x அல்லது Nanopore 100x ஹை-சி அசெம்பிளி 100x | கான்டிக் ஆங்கரிங் விகிதம்>90%
|
சேவை தேவைகள்
| செறிவு (ng/μL) | மொத்த அளவு (μg) | அளவு (μL) | OD260/280 இன் விளக்கம் | OD260/230 இன் விளக்கம் | |
| பேக்பயோ | ≥20 (20) | ≥2 (எண் 2) | ≥20 (20) | 1.7-2.2 | ≥1.6 (ஆங்கிலம்) |
| நானோபோர் | ≥40 (40) | ≥2 (எண் 2) | ≥20 (20) | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| இல்லுமினா | ≥1 (எண் 1) | ≥0.06 (ஆங்கிலம்) | ≥20 (20) | - | - |
ஒருசெல்லுலர் பூஞ்சை: ≥3.5x1010 செல்கள்
மேக்ரோ பூஞ்சை: ≥10 கிராம்
சேவை பணி ஓட்டம்
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
பின்வரும் பகுப்பாய்வுகளை உள்ளடக்கியது:
மரபணு ஆய்வு:
- தரவு தரக் கட்டுப்பாட்டை வரிசைப்படுத்துதல்
- மரபணு மதிப்பீடு: அளவு, ஹீட்டோரோசைகோசிட்டி, மீண்டும் மீண்டும் வரும் கூறுகள்
நுண்ணிய ஜீனோம் அசெம்பிளி:
- தரவு தரக் கட்டுப்பாட்டை வரிசைப்படுத்துதல்
- புதியதுசட்டசபை
- மரபணு கூறு பகுப்பாய்வு: CDS மற்றும் பல மரபணு கூறுகளின் கணிப்பு
- பல பொது தரவுத்தளங்கள் (GO, KEGG, முதலியன) மற்றும் மேம்பட்ட தரவுத்தளங்கள் (CARD, VFDB, முதலியன) கொண்ட செயல்பாட்டு குறிப்பு.
ஹை-சி அசெம்பிளி:
- ஹை-சி நூலக மதிப்பீடு.
- கான்டிக்ஸ் ஆங்கரிங் கிளஸ்டரிங், ஆர்டர் செய்தல் மற்றும் நோக்குநிலைப்படுத்துதல்
- HI-C அசெம்பிளியின் மதிப்பீடு: குறிப்பு மரபணு மற்றும் வெப்ப வரைபடத்தின் அடிப்படையில்
மரபணு ஆய்வு: கே-மெர் பரவல்
மரபணு அசெம்பிளி: மரபணு ஹோமோலோகஸ் குறிப்பு (NR தரவுத்தளம்)
மரபணு அசெம்பிளி: செயல்பாட்டு மரபணு குறிப்பு (GO)
BMKGene இன் பூஞ்சை மரபணு அசெம்பிளி சேவைகளால் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை, தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பு மூலம் ஆராயுங்கள்.
ஹாவோ, ஜே. மற்றும் பலர் (2023) 'நீரில் மூழ்கியிருக்கும் சூழ்நிலையில் மருத்துவ காளான் இனோனோடஸ் ஒப்லிகஸின் ஒருங்கிணைந்த ஓமிக் விவரக்குறிப்பு',பிஎம்சி ஜீனோமிக்ஸ், 24(1), பக். 1–12. doi: 10.1186/S12864-023-09656-Z/FIGURES/3.
லு, எல். மற்றும் பலர் (2023) 'கோதுமை கூர்மையான கண்புரை நோய்க்கிருமியான ரைசோக்டோனியா சீரியலிஸின் பரிணாமம் மற்றும் நோய்க்கிருமி வழிமுறைகளை மரபணு வரிசைமுறை வெளிப்படுத்துகிறது',பயிர் இதழ், 11(2), பக். 405–416. doi: 10.1016/J.CJ.2022.07.024.
ஜாங், எச். மற்றும் பலர் (2023) 'பல்வேறு புல்வெளிகளில் டாலர் புள்ளியை ஏற்படுத்தும் நான்கு கிளாரிரீடியா இனங்களுக்கான மரபணு வளங்கள்',தாவர நோய், 107(3), பக். 929–934. doi: 10.1094/PDIS-08-22-1921-A
ஜாங், எஸ்எஸ் மற்றும் பலர் (2023) 'உண்ணக்கூடிய காளான் கிரிஃபோலா ஃப்ரோண்டோசாவில் டெட்ராபோலார் இனச்சேர்க்கை அமைப்பின் மரபணு மற்றும் மூலக்கூறு சான்றுகள்',பூஞ்சை இதழ், 9(10), ப. 959. டோய்: 10.3390/JOF9100959/S1.
