ஹை-சி அடிப்படையிலான மரபணுத் தொகுப்பு
ஹை-சி (Hi-C) என்பது அருகாமை அடிப்படையிலான இடைவினைகளை ஆராய்வதையும் அதிவேக வரிசைப்படுத்தலையும் இணைப்பதன் மூலம் குரோமோசோம் அமைப்பைப் பதிவுசெய்ய வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு முறையாகும். இந்த இடைவினைகளின் தீவிரம், குரோமோசோம்களில் உள்ள பௌதீக தூரத்துடன் எதிர்மறையாகத் தொடர்புடையது என்று நம்பப்படுகிறது. எனவே, ஒரு வரைவு மரபணுத்தொகுப்பில் உள்ள தொகுக்கப்பட்ட வரிசைகளைக் குழுவாக்குவதற்கும், வரிசைப்படுத்துவதற்கும், திசைப்படுத்துவதற்கும், மேலும் அவற்றை ஒரு குறிப்பிட்ட எண்ணிக்கையிலான குரோமோசோம்களில் நிலைநிறுத்துவதற்கும் ஹை-சி தரவுகள் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. மக்கள் தொகை அடிப்படையிலான மரபணு வரைபடம் இல்லாத நிலையில், குரோமோசோம் மட்டத்தில் ஒரு மரபணுத்தொகுப்புத் தொகுப்பை இந்தத் தொழில்நுட்பம் சாத்தியமாக்குகிறது. ஒவ்வொரு மரபணுத்தொகுப்பிற்கும் ஒரு ஹை-சி தேவைப்படுகிறது.
சேவை அம்சங்கள்
● PE150 ஐப் பயன்படுத்தி இல்லுமினா நோவாசீக் இல் வரிசைப்படுத்துதல்.
● இந்தச் சேவைக்கு, பிரித்தெடுக்கப்பட்ட நியூக்ளிக் அமிலங்களுக்குப் பதிலாக, ஃபார்மால்டிஹைடுடன் குறுக்கிணைப்பு செய்வதற்கும் டிஎன்ஏ-புரத இடைவினைகளைப் பாதுகாப்பதற்கும் திசு மாதிரிகள் தேவைப்படுகின்றன.
● ஹை-சி பரிசோதனையானது, பயோட்டின் கொண்டு ஒட்டும் முனைகளைக் கட்டுப்படுத்திச் சரிசெய்வதையும், அதனைத் தொடர்ந்து உருவாகும் மழுங்கிய முனைகளை அவற்றின் இடைவினைகளைப் பாதுகாத்து வட்டமாக்குவதையும் உள்ளடக்கியது. பின்னர், டி.என்.ஏ ஸ்ட்ரெப்டாவிடின் மணிகளைக் கொண்டு பிரித்தெடுக்கப்பட்டு, அடுத்தகட்ட லைப்ரரி தயாரிப்பிற்காகத் தூய்மைப்படுத்தப்படுகிறது.
சேவை நன்மைகள்
ஹை-சி கண்ணோட்டம்
(லைபர்மேன்-ஐடன் இ மற்றும் பலர்,)அறிவியல், 2009)
●மரபணு மக்கள்தொகைத் தரவுகளின் தேவையை நீக்குதல்:கான்டிக் ஆங்கரிங்கிற்குத் தேவைப்படும் அத்தியாவசியத் தகவலுக்குப் பதிலாக ஹை-சி பயன்படுத்தப்படுகிறது.
●அதிக குறிப்பான் அடர்த்தி:இது 90%-க்கும் அதிகமான உயர் கான்டிக் நங்கூர விகிதத்திற்கு வழிவகுக்கிறது.
●விரிவான நிபுணத்துவம் மற்றும் வெளியீட்டுப் பதிவுகள்:BMKGene, 1000 வெவ்வேறு உயிரினங்களிலிருந்து பெறப்பட்ட 2000-க்கும் மேற்பட்ட Hi-C மரபணுத் தொகுப்பு நிகழ்வுகளிலும், பல்வேறு காப்புரிமைகளிலும் பரந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுள்ளது. வெளியிடப்பட்ட 200-க்கும் மேற்பட்ட நிகழ்வுகளின் ஒட்டுமொத்த தாக்கக் காரணி 2000-க்கும் அதிகமாக உள்ளது.
●உயர் திறன் வாய்ந்த உயிரித் தகவல் தொழில்நுட்பக் குழு:Hi-C சோதனைகள் மற்றும் தரவுப் பகுப்பாய்விற்கான உள்ளகக் காப்புரிமைகள் மற்றும் மென்பொருள் பதிப்புரிமைகளுடன், சுயமாக உருவாக்கப்பட்ட இந்தக் காட்சிப்படுத்தல் தரவு மென்பொருளானது, தொகுதிகளைக் கைமுறையாக நகர்த்துதல், தலைகீழாக்குதல், ரத்து செய்தல் மற்றும் மீண்டும் செய்தல் ஆகியவற்றைச் சாத்தியமாக்குகிறது.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு:திட்டம் நிறைவடைந்த பிறகும், 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் எங்கள் அர்ப்பணிப்பு தொடர்கிறது. இந்தக் காலகட்டத்தில், திட்டத்தின் தொடர் கண்காணிப்பு, பழுது நீக்கும் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான எந்தவொரு கேள்விகளுக்கும் பதிலளிக்கும் கேள்வி-பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
●விரிவான குறிப்புரைஅடையாளம் காணப்பட்ட மாறுபாடுகளைக் கொண்ட மரபணுக்களைச் செயல்பாட்டு ரீதியாகக் குறிப்பதற்கும், அதற்கேற்ற செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வை மேற்கொள்வதற்கும் நாங்கள் பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம்; இது பல்வேறு ஆராய்ச்சித் திட்டங்கள் குறித்த நுண்ணறிவுகளை வழங்குகிறது.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நூலகத் தயாரிப்பு | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு வெளியீடு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| ஹை-சி நூலகம் | இலுமினா நோவாசீக் PE150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
மாதிரி தேவைகள்
| திசு | தேவையான அளவு |
| விலங்கு உள்ளுறுப்புகள் | ≥ 1 கிராம் |
| விலங்கு தசை | |
| பாலூட்டி இரத்தம் | ≥ 2 மிலி |
| கோழி/மீன் இரத்தம் | |
| செடி - புதிய இலை | ≥ 2 கிராம் |
| வளர்க்கப்பட்ட செல்கள் | ≥ 1x107 |
| பூச்சி | ≥ 1 கிராம் |
| நீர்வாழ் உயிரினம் - தசைத் திசு | ≥ 1 கிராம் |
| நீர்வாழ் உயிரினம் - பாசி | ≥ 2 கிராம் |
சேவை பணிப்பாய்வு
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
1) மூலத் தரவு தரக் கட்டுப்பாடு
2) Hi-C நூலகத் தரக் கட்டுப்பாடு: செல்லுபடியாகும் Hi-C இடைவினைகளின் மதிப்பீடு
3) Hi-C தொகுப்பு: கான்டிக்டுகளைக் குழுக்களாகக் கொத்தாக்குதல், அதனைத் தொடர்ந்து ஒவ்வொரு குழுவிலும் கான்டிக்டுகளை வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் கான்டிக்டுகளின் திசையமைப்பை ஒதுக்குதல்.
4) ஹை-சி மதிப்பீடு
Hi-C நூலக QC – Hi-C செல்லுபடியாகும் இடைவினை இணைகளின் மதிப்பீடு
ஹை-சி அசெம்பிளி – புள்ளிவிவரங்கள்
அசெம்பிளிக்குப் பிந்தைய மதிப்பீடு – பிரிவுகளுக்கு இடையேயான சமிக்ஞை செறிவின் வெப்ப வரைபடம்
BMKGene-இன் Hi-C அசெம்பிளி சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை, கவனமாகத் தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் அறிந்துகொள்ளுங்கள்.
டியான், டி. மற்றும் பலர். (2023) 'ஒரு முக்கிய வறட்சி-எதிர்ப்பு மக்காச்சோள மரபணு வளத்தின் மரபணுத்தொகுப்பு ஒருங்கிணைப்பு மற்றும் மரபணுப் பகுப்பாய்வு', நேச்சர் ஜெனடிக்ஸ் 2023 55:3, 55(3), பக். 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
வாங், ZL மற்றும் பலர். (2020) 'ஆசிய தேனீ ஏபிஸ் செரானா மரபணுத்தொகுப்பின் குரோமோசோம் அளவிலான தொகுப்பு', ஃபிரான்டியர்ஸ் இன் ஜெனடிக்ஸ், 11, ப. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
ஜாங், எஃப். மற்றும் பலர். (2023) 'சோலனேசியே குடும்பத்தில் உள்ள இரண்டு மரபணுக்களைப் பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம் ட்ரோபேன் ஆல்கலாய்டு உயிர் தொகுப்பின் பரிணாமத்தை வெளிப்படுத்துதல்', நேச்சர் கம்யூனிகேஷன்ஸ் 2023 14:1, 14(1), பக். 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
ஜாங், எக்ஸ். மற்றும் பலர். (2020) 'ஆலமரம் மற்றும் மகரந்தச் சேர்க்கை குளவியின் மரபணுக்கள் அத்தி-குளவி இணை பரிணாம வளர்ச்சி குறித்த நுண்ணறிவுகளை வழங்குகின்றன', செல், 183(4), பக். 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
