ஹை-சி அடிப்படையிலான ஜீனோம் அசெம்பிளி
Hi-C என்பது அருகாமை அடிப்படையிலான தொடர்புகள் மற்றும் உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறையை ஆய்வு செய்வதன் மூலம் குரோமோசோம் உள்ளமைவைப் பிடிக்க வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு முறையாகும். இந்த தொடர்புகளின் தீவிரம் குரோமோசோம்களில் உள்ள இயற்பியல் தூரத்துடன் எதிர்மறையாக தொடர்புடையதாக நம்பப்படுகிறது. எனவே, ஒரு வரைவு மரபணுவில் கூடியிருந்த வரிசைகளின் தொகுப்பாக்கம், வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் நோக்குநிலையை வழிநடத்தவும், குறிப்பிட்ட எண்ணிக்கையிலான குரோமோசோம்களில் அவற்றை நங்கூரமிடவும் Hi-C தரவு பயன்படுத்தப்படுகிறது. மக்கள்தொகை அடிப்படையிலான மரபணு வரைபடம் இல்லாத நிலையில், இந்த தொழில்நுட்பம் குரோமோசோம்-நிலை மரபணு அசெம்பிளியை மேம்படுத்துகிறது. ஒவ்வொரு மரபணுவிற்கும் ஒரு Hi-C தேவை.
சேவை அம்சங்கள்
● PE150 உடன் இல்லுமினா நோவாசெக்கில் வரிசைப்படுத்துதல்.
● பிரித்தெடுக்கப்பட்ட நியூக்ளிக் அமிலங்களுக்குப் பதிலாக, ஃபார்மால்டிஹைடுடன் குறுக்கு இணைப்பு ஏற்படுத்தி டிஎன்ஏ-புரத தொடர்புகளைப் பாதுகாக்க, சேவைக்கு திசு மாதிரிகள் தேவை.
● ஹை-சி பரிசோதனையானது பயோட்டின் மூலம் ஒட்டும் முனைகளைக் கட்டுப்படுத்தி, இறுதிப் பழுதுபார்ப்பதை உள்ளடக்கியது, அதைத் தொடர்ந்து இடைவினைகளைப் பாதுகாக்கும் அதே வேளையில் விளைந்த மழுங்கிய முனைகளை வட்டமாக்குகிறது. பின்னர் டிஎன்ஏ ஸ்ட்ரெப்டாவிடின் மணிகளால் கீழே இழுக்கப்பட்டு, அடுத்தடுத்த நூலக தயாரிப்புக்காக சுத்திகரிக்கப்படுகிறது.
சேவை நன்மைகள்
ஹை-சி-யின் கண்ணோட்டம்
(லைபர்மேன்-ஐடன் இ மற்றும் பலர்,அறிவியல், 2009)
●மரபணு மக்கள்தொகை தரவுகளுக்கான தேவையை நீக்குதல்:கான்டிக் ஆங்கரிங்கிற்குத் தேவையான அத்தியாவசிய தகவல்களை ஹை-சி மாற்றுகிறது.
●அதிக மார்க்கர் அடர்த்தி:இது 90% க்கும் அதிகமான காண்டிக் நங்கூர விகிதத்திற்கு வழிவகுக்கிறது.
●விரிவான நிபுணத்துவம் மற்றும் வெளியீட்டு பதிவுகள்:BMKGene நிறுவனம் 1000க்கும் மேற்பட்ட வெவ்வேறு இனங்கள் மற்றும் பல்வேறு காப்புரிமைகளிலிருந்து 2000க்கும் மேற்பட்ட Hi-C ஜீனோம் அசெம்பிளி வழக்குகளில் பரந்த அனுபவத்தைக் கொண்டுள்ளது. வெளியிடப்பட்ட 200க்கும் மேற்பட்ட வழக்குகள் 2000க்கும் மேற்பட்ட தாக்கக் காரணியைக் கொண்டுள்ளன.
●மிகவும் திறமையான உயிர் தகவலியல் குழு:ஹை-சி பரிசோதனைகள் மற்றும் தரவு பகுப்பாய்வுக்கான உள்ளக காப்புரிமைகள் மற்றும் மென்பொருள் பதிப்புரிமைகளுடன், சுயமாக உருவாக்கப்பட்ட காட்சிப்படுத்தல் தரவு மென்பொருள் கையேடு தொகுதி நகர்த்தல், தலைகீழாக மாற்றுதல், திரும்பப் பெறுதல் மற்றும் மீண்டும் செய்தல் ஆகியவற்றை செயல்படுத்துகிறது.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு:எங்கள் உறுதிப்பாடு, 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன், திட்டத்தை முடிப்பதற்கும் அப்பால் நீண்டுள்ளது. இந்த நேரத்தில், முடிவுகள் தொடர்பான ஏதேனும் கேள்விகளுக்கு தீர்வு காண, திட்ட பின்தொடர்தல், சரிசெய்தல் உதவி மற்றும் கேள்வி பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
●விரிவான குறிப்பு: அடையாளம் காணப்பட்ட மாறுபாடுகளுடன் மரபணுக்களை செயல்பாட்டு ரீதியாகக் குறிப்பிடவும், அதனுடன் தொடர்புடைய செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வைச் செய்யவும், பல ஆராய்ச்சித் திட்டங்கள் குறித்த நுண்ணறிவுகளை வழங்கவும் பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம்.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நூலக தயாரிப்பு | வரிசைமுறை உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு வெளியீடு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| ஹை-சி நூலகம் | இல்லுமினா நோவாசெக் PE150 | 100x பிக்சல்கள் | கே30 ≥ 85% |
மாதிரி தேவைகள்
| திசு | தேவையான அளவு |
| விலங்கு உள்ளுறுப்பு | ≥ 2 கிராம் |
| விலங்கு தசை | |
| பாலூட்டி இரத்தம் | ≥ 2 மிலி |
| கோழி/மீன் இரத்தம் | |
| செடி- புதிய இலை | ≥ 3 கிராம் |
| வளர்ப்பு செல்கள் | ≥ 1x107 |
| பூச்சி | ≥ 2 கிராம் |
சேவை பணி ஓட்டம்
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
1) மூல தரவு QC
2) Hi-C நூலக QC: செல்லுபடியாகும் Hi-C தொடர்புகளின் மதிப்பீடு
3) ஹை-சி அசெம்பிளி: குழுக்களாக கான்டிஜ்களை கொத்தாகப் பிரித்தல், அதைத் தொடர்ந்து ஒவ்வொரு குழுவிற்குள்ளும் கான்டிஜ் வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் கான்டிஜ் நோக்குநிலையை ஒதுக்குதல்.
4) ஹை-சி மதிப்பீடு
Hi-C நூலக QC - Hi-C செல்லுபடியாகும் தொடர்பு ஜோடிகளின் மதிப்பீடு
ஹை-சி அசெம்பிளி - புள்ளிவிவரங்கள்
அசெம்பிளிக்குப் பிந்தைய மதிப்பீடு - தொட்டிகளுக்கு இடையிலான சமிக்ஞை தீவிரத்தின் வெப்ப வரைபடம்
BMKGene இன் Hi-C அசெம்பிளி சேவைகளால் எளிதாக்கப்பட்ட முன்னேற்றங்களை, தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் ஆராயுங்கள்.
தியான், டி. மற்றும் பலர் (2023) 'ஒரு முக்கிய வறட்சி-எதிர்ப்பு மக்காச்சோள கிருமி பிளாசத்தின் மரபணு அசெம்பிளி மற்றும் மரபணு பிரித்தல்', நேச்சர் ஜெனிடிக்ஸ் 2023 55:3, 55(3), பக். 496–506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
வாங், இசட்எல் மற்றும் பலர். (2020) 'ஆசிய தேனீ அபிஸ் செரானா ஜீனோமின் குரோமோசோம்-அளவிலான அசெம்பிளி', மரபியலில் எல்லைகள், 11, ப. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
ஜாங், எஃப். மற்றும் பலர் (2023) 'சோலனேசியே குடும்பத்தில் இரண்டு மரபணுக்களை பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம் ட்ரோபேன் ஆல்கலாய்டு உயிரியல் தொகுப்பின் பரிணாமத்தை வெளிப்படுத்துதல்', நேச்சர் கம்யூனிகேஷன்ஸ் 2023 14:1, 14(1), பக். 1–18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
ஜாங், எக்ஸ். மற்றும் பலர். (2020) 'ஆலமரம் மற்றும் மகரந்தச் சேர்க்கை குளவியின் மரபணுக்கள் அத்தி-குளவி இணை பரிணாமம் பற்றிய நுண்ணறிவுகளை வழங்குகின்றன', செல், 183(4), பக். 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
