-
மெட்டஜெனோமிக் சீக்வென்சிங் (NGS)
மெட்டாஜெனோம் என்பது சுற்றுச்சூழல் மெட்டஜெனோம், மனித மெட்டஜெனோம் போன்ற உயிரினங்களின் கலப்பு சமூகத்தின் மொத்த மரபணுப் பொருட்களின் தொகுப்பைக் குறிக்கிறது. இது சாகுபடி செய்யக்கூடிய மற்றும் பயிரிட முடியாத நுண்ணுயிரிகளின் மரபணுக்களைக் கொண்டுள்ளது.மெட்டாஜெனோமிக் சீக்வென்சிங் என்பது சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளிலிருந்து பிரித்தெடுக்கப்பட்ட கலப்பு மரபணுப் பொருட்களை பகுப்பாய்வு செய்யப் பயன்படும் ஒரு மூலக்கூறு கருவியாகும், இது உயிரினங்களின் பன்முகத்தன்மை மற்றும் மிகுதி, மக்கள்தொகை அமைப்பு, பைலோஜெனடிக் உறவு, செயல்பாட்டு மரபணுக்கள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் காரணிகளுடன் தொடர்பு நெட்வொர்க் பற்றிய விரிவான தகவல்களை வழங்குகிறது.
நடைமேடை:Illumina NovaSeq6000
-
மெட்டாஜெனோமிக் சீக்வென்சிங்-நானோபூர்
மெட்டஜெனோமிக்ஸ் என்பது சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகளில் இருந்து பிரித்தெடுக்கப்பட்ட கலப்பு மரபணுப் பொருட்களை பகுப்பாய்வு செய்யப் பயன்படும் ஒரு மூலக்கூறு கருவியாகும், இது இனங்கள் பன்முகத்தன்மை மற்றும் மிகுதி, மக்கள்தொகை அமைப்பு, பைலோஜெனடிக் உறவு, செயல்பாட்டு மரபணுக்கள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் காரணிகளுடன் தொடர்பு நெட்வொர்க் போன்ற விரிவான தகவல்களை வழங்குகிறது. நானோபூர் வரிசைமுறை தளங்கள் சமீபத்தில் அறிமுகப்படுத்தப்பட்டது மெட்டஜெனோமிக் ஆய்வுகளுக்கு.வாசிப்பு நீளத்தில் அதன் சிறந்த செயல்திறன், ஸ்ட்ரீம் மெட்டஜெனோமிக் பகுப்பாய்வு, குறிப்பாக மெட்டாஜெனோம் அசெம்பிளியை மேம்படுத்தியது.வாசிப்பு-நீளத்தின் நன்மைகளைப் பயன்படுத்தி, ஷாட்-கன் மெட்டஜெனோமிக்ஸுடன் ஒப்பிடுகையில், நானோபூர் அடிப்படையிலான மெட்டஜெனோமிக் ஆய்வு அதிக தொடர்ச்சியான அசெம்பிளியை அடைய முடியும்.நானோபோரை அடிப்படையாகக் கொண்ட மெட்டஜெனோமிக்ஸ் நுண்ணுயிரிகளிலிருந்து முழுமையான மற்றும் மூடிய பாக்டீரியா மரபணுக்களை வெற்றிகரமாக உருவாக்கியது என்று வெளியிடப்பட்டுள்ளது (பாசி, EL, மற்றும் பலர்,இயற்கை பயோடெக், 2020)
நடைமேடை:நானோபூர் ப்ரோமேதியான் பி48
-
16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங்-PacBio
16S மற்றும் 18S rRNA இல் உள்ள துணைப்பிரிவு மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட மற்றும் மிகை-மாறும் பகுதிகள் இரண்டையும் கொண்டுள்ளது, இது புரோகாரியோடிக் மற்றும் யூகாரியோடிக் உயிரினங்களை அடையாளம் காண சரியான மூலக்கூறு கைரேகை ஆகும்.வரிசைமுறையின் சாதகமாக, இந்த ஆம்பிளிகான்கள் பாதுகாக்கப்பட்ட பாகங்களின் அடிப்படையில் குறிவைக்கப்படலாம் மற்றும் நுண்ணுயிர் அடையாளம் காணும் வகையில், நுண்ணுயிர் பன்முகத்தன்மை பகுப்பாய்வு, வகைபிரித்தல், பைலோஜெனி போன்றவற்றை உள்ளடக்கிய ஆய்வுகளுக்கு பங்களிக்கும் ஹைப்பர்-மாறும் பகுதிகளை முழுமையாக வகைப்படுத்தலாம். ஒற்றை-மூலக்கூறு நிகழ்நேரம்(SMRT ) PacBio இயங்குதளத்தின் வரிசைமுறை மிகவும் துல்லியமான நீண்ட வாசிப்புகளைப் பெற உதவுகிறது, இது முழு நீள ஆம்பிளிகான்களை (தோராயமாக 1.5 Kb) உள்ளடக்கும்.மரபணு புலத்தின் பரந்த பார்வை பாக்டீரியா அல்லது பூஞ்சை சமூகத்தில் இனங்கள் சிறுகுறிப்பில் தீர்மானத்தை பெரிதும் மேம்படுத்தியது.
நடைமேடை:PacBio தொடர்ச்சி II
-
16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் சீக்வென்சிங்-NGS
16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் வரிசைமுறையானது நுண்ணுயிர் சமூகத்தில் பைலோஜெனி, வகைபிரித்தல் மற்றும் இனங்கள் ஏராளமாக இருப்பதை வெளிப்படுத்துவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது, இது மிகவும் உரையாடப்பட்ட மற்றும் மிகை மாறக்கூடிய பகுதிகளைக் கொண்ட வீட்டு பராமரிப்பு மரபணு குறிப்பான்களின் PCR தயாரிப்புகளை ஆராய்கிறது.Woeses et al,(1977) மூலம் இந்த சரியான மூலக்கூறு கைரேகையின் அறிமுகம் தனிமைப்படுத்தப்படாத நுண்ணுயிர் விவரக்குறிப்பை மேம்படுத்துகிறது.16S (பாக்டீரியா), 18S (பூஞ்சை) மற்றும் உள்ளக டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஸ்பேசர் (ITS, பூஞ்சை) ஆகியவற்றின் வரிசைமுறையானது ஏராளமான இனங்கள் மற்றும் அரிதான மற்றும் அடையாளம் காணப்படாத உயிரினங்களை அடையாளம் காண அனுமதிக்கிறது.மனித வாய், குடல், மலம் போன்ற பல்வேறு சூழல்களில் வேறுபட்ட நுண்ணுயிர் கலவையை அடையாளம் காண்பதில் இந்த தொழில்நுட்பம் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் மற்றும் முக்கிய கருவியாக மாறியுள்ளது.
நடைமேடை:Illumina NovaSeq6000
-
பாக்டீரியா மற்றும் பூஞ்சை முழு ஜீனோம் மறு வரிசைப்படுத்தல்
பாக்டீரியல் மற்றும் பூஞ்சை முழு மரபணு மறு வரிசைப்படுத்தல் என்பது அறியப்பட்ட பாக்டீரியம் மற்றும் பூஞ்சைகளின் மரபணுக்களை நிறைவு செய்வதற்கும், பல மரபணுக்களை ஒப்பிடுவதற்கும் அல்லது புதிய உயிரினங்களின் மரபணுக்களை வரைபடமாக்குவதற்கும் ஒரு முக்கியமான கருவியாகும்.துல்லியமான குறிப்பு மரபணுக்களை உருவாக்குவதற்கும், நுண்ணுயிர் அடையாளம் மற்றும் பிற ஒப்பீட்டு மரபணு ஆய்வுகள் செய்வதற்கும் பாக்டீரியம் மற்றும் பூஞ்சைகளின் முழு மரபணுக்களையும் வரிசைப்படுத்துவது மிகவும் முக்கியத்துவம் வாய்ந்தது.
இயங்குதளம்:இலுமினா நோவாசெக் 6000
-
பூஞ்சை மரபணு
பயோமார்க்கர் டெக்னாலஜிஸ் குறிப்பிட்ட ஆராய்ச்சி இலக்கைப் பொறுத்து பூஞ்சையின் ஜீனோம் சர்வே, ஃபைன் ஜீனோம் மற்றும் பேனா-முழுமையான மரபணு ஆகியவற்றை வழங்குகிறது.அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை + மூன்றாம் தலைமுறை வரிசைமுறை ஆகியவற்றை இணைப்பதன் மூலம் மரபணு வரிசைமுறை, அசெம்பிளி மற்றும் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு ஆகியவை உயர்-நிலை மரபணு சட்டசபையை அடைய முடியும்.குரோமோசோம் மட்டத்தில் ஜீனோம் அசெம்பிளியை எளிதாக்க ஹை-சி தொழில்நுட்பமும் பயன்படுத்தப்படலாம்.
நடைமேடை:PacBio தொடர்ச்சி II
நானோபூர் ப்ரோமேதியான் பி48
இல்லுமினா நோவாசெக் 6000
-
பாக்டீரியா முழுமையான மரபணு
பயோமார்க்கர் டெக்னாலஜிஸ் பூஜ்ஜிய இடைவெளியுடன் பாக்டீரியாவின் முழுமையான மரபணுவை உருவாக்குவதற்கான வரிசைமுறை சேவையை வழங்குகிறது.பாக்டீரியா முழுமையான மரபணு கட்டுமானத்தின் முக்கிய பணிப்பாய்வு மூன்றாம் தலைமுறை வரிசைமுறை, அசெம்பிளி, செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் குறிப்பிட்ட ஆராய்ச்சி இலக்குகளை நிறைவேற்றும் மேம்பட்ட உயிர் தகவல் பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியது.பாக்டீரியா மரபணுவின் விரிவான விவரக்குறிப்பு அவற்றின் உயிரியல் செயல்முறைகளின் அடிப்படையிலான அடிப்படை வழிமுறைகளை வெளிப்படுத்த உதவுகிறது, இது உயர் யூகாரியோடிக் இனங்களில் மரபணு ஆராய்ச்சிகளுக்கு மதிப்புமிக்க குறிப்பை வழங்கக்கூடும்.
நடைமேடை:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio தொடர்ச்சி II
