mRNA-seq (NGS) - De novo
mRNA வரிசைப்படுத்தல் என்பது, குறிப்பிட்ட சூழ்நிலைகளில் செல்களில் உள்ள அனைத்து mRNA டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளையும் பகுப்பாய்வு செய்ய உதவுகிறது. மேலும் இது பல்வேறு ஆராய்ச்சித் துறைகளில் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் ஒரு தொழில்நுட்பமாகும். குறிப்பு மரபணுத்தொகுதி எதுவும் கிடைக்காதபோது, பாலி-ஏ செறிவூட்டப்பட்ட வரிசைப்படுத்தல் லைப்ரரிகளைப் பகுப்பாய்வு செய்வதற்காக BMKCloud De novo mRNA-seq பைப்லைன் வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. இந்த பைப்லைன் தரக் கட்டுப்பாட்டுடன் தொடங்கி, அதைத் தொடர்ந்து...டி நோவோடிரான்ஸ்கிரிப்ட் அசெம்பிளி மற்றும் யூனிஜீன் செட் தேர்வு. யூனிஜீன் கட்டமைப்புப் பகுப்பாய்வானது, குறியீட்டு வரிசை (CDS) மற்றும் எளிய வரிசைத் திரும்பல்களை (SSR) முன்கணிக்கிறது. அதனைத் தொடர்ந்து, வேறுபட்ட வெளிப்பாட்டுப் பகுப்பாய்வானது, சோதிக்கப்பட்ட நிலைமைகளுக்கு இடையில் வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களை (DEGs) கண்டறிகிறது. அதனைத் தொடர்ந்து, உயிரியல் நுண்ணறிவுகளைப் பிரித்தெடுப்பதற்காக, DEGs-க்கு செயல்பாட்டு விளக்கக்குறிப்பிடுதல் மற்றும் செறிவூட்டல் செய்யப்படுகிறது.
உயிரித் தகவல் அறிவியல்
