நானோபோர் முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்

நானோபோர் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைப்படுத்தல் என்பது முழு நீள cDNA-க்களை வரிசைப்படுத்துவதற்கும், டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஐசோஃபார்ம்களைத் துல்லியமாக அடையாளம் கண்டு அளவிடுவதற்கும் ஒரு சக்திவாய்ந்த முறையாகும். BMKCloud நானோபோர் முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பைப்லைன், நானோபோர் தளத்தில் உருவாக்கப்பட்ட RNA-Seq தரவை, உயர்தரமான மற்றும் நன்கு விளக்கமளிக்கப்பட்ட ஒரு குறிப்பு மரபணுத்தொகுதியுடன் ஒப்பிட்டுப் பகுப்பாய்வு செய்ய வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. இது மரபணு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஆகிய இரு நிலைகளிலும் பண்புசார் மற்றும் அளவுசார் பகுப்பாய்வை வழங்குகிறது. தரக் கட்டுப்பாட்டிற்குப் பிறகு, முழு நீள கலப்பினமற்ற (FLNC) வரிசைகள் பெறப்பட்டு, தேவையற்ற டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களை நீக்குவதற்காக ஒருமித்த வரிசைகள் குறிப்பு மரபணுத்தொகுதியுடன் பொருத்தப்படுகின்றன. இந்த டிரான்ஸ்கிரிப்ட் தொகுப்பிலிருந்து, வெளிப்பாடு அளவிடப்பட்டு, வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள் மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட்கள் அடையாளம் காணப்பட்டு, அவற்றின் செயல்பாடுகள் விளக்கமளிக்கப்படுகின்றன. இந்த பைப்லைனில் மாற்று பாலிஅடினைலேஷன் (APA) பகுப்பாய்வு, மாற்று ஸ்ப்ளைசிங் பகுப்பாய்வு, எளிய வரிசைத் திரும்பல் (SSR) பகுப்பாய்வு, lncRNA மற்றும் அதனுடன் தொடர்புடைய இலக்குகளின் கணிப்பு, குறியீட்டு வரிசைகளின் (CDS) கணிப்பு, மரபணு குடும்பப் பகுப்பாய்வு, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிப் பகுப்பாய்வு, புதிய மரபணுக்களின் கணிப்பு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களின் செயல்பாட்டு விளக்கமளித்தல் ஆகியவையும் அடங்கும்.