பாக்பியோ முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்

PacBio முழு-நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை, Isoseq, டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஐசோஃபார்ம்களை துல்லியமாக அடையாளம் காண உதவுகிறது, மாற்று பாலிஅடினிலேஷன் மற்றும் பிளவுபடுத்தலில் வெளிச்சம் போட்டுக் காட்டுகிறது, மேலும் மிகவும் துல்லியமான மரபணு வெளிப்பாடு பகுப்பாய்விற்கு வழிவகுக்கிறது. BMKCloud PacBio முழு-நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பைப்லைன், வட்ட ஒருமித்த வரிசைமுறை (CCS) பயன்முறையில் வரிசைப்படுத்தப்பட்ட cDNA நூலகங்களை பகுப்பாய்வு செய்ய வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது மற்றும் முழு-நீள நான்-கைமெரிக் (FLNC) வரிசைகளை அடையாளம் காட்டுகிறது, பின்னர் அவை தேவையற்ற டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களாக தொகுக்கப்படுகின்றன. அடுத்தடுத்த BUSCO பகுப்பாய்வு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளியின் முழுமையை மதிப்பிடுகிறது. கூடியிருந்த டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிலிருந்து, பல பகுப்பாய்வுகள் செய்யப்படுகின்றன: மாற்று பிளவுபடுத்தல், எளிய வரிசை மீண்டும் (SSR), lncRNA மற்றும் தொடர்புடைய இலக்கு மரபணுக்களின் கணிப்பு, நாவல் மரபணுக்களின் கணிப்பு, மரபணு குடும்ப பகுப்பாய்வு, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி பகுப்பாய்வு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களின் செயல்பாட்டு குறிப்பு.