Pacbio முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்

பேக்பையோ முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைப்படுத்தல் (PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing), ஐசோசீக் (Isoseq), டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஐசோஃபார்ம்களைத் துல்லியமாக அடையாளம் காண உதவுகிறது, மாற்று பாலிஅடினைலேஷன் மற்றும் ஸ்ப்ளைசிங் பற்றிய தெளிவை அளிக்கிறது, மேலும் மிகவும் துல்லியமான மரபணு வெளிப்பாட்டுப் பகுப்பாய்விற்கு வழிவகுக்கிறது. BMKCloud பேக்பையோ முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பைப்லைன், வட்ட ஒருமித்த வரிசைப்படுத்தல் (Circular Consensus Sequencing - CCS) முறையில் வரிசைப்படுத்தப்பட்ட cDNA லைப்ரரிகளைப் பகுப்பாய்வு செய்ய வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. இது முழு நீள நான்-கைமெரிக் (Full-Length Non-Chimeric - FLNC) வரிசைகளை அடையாளம் காண்கிறது, பின்னர் அவை தேவையற்ற டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளாகக் குழுப்படுத்தப்படுகின்றன. அதைத் தொடர்ந்த BUSCO பகுப்பாய்வு, டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அசெம்பிளியின் முழுமையை மதிப்பிடுகிறது. அசெம்பிளி செய்யப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிலிருந்து, பல பகுப்பாய்வுகள் செய்யப்படுகின்றன: மாற்று ஸ்ப்ளைசிங், எளிய வரிசைத் திரும்பல் (SSR), lncRNA மற்றும் அதனுடன் தொடர்புடைய இலக்கு மரபணுக்களின் கணிப்பு, புதிய மரபணுக்களின் கணிப்பு, மரபணு குடும்பப் பகுப்பாய்வு, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிப் பகுப்பாய்வு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளின் செயல்பாட்டு விளக்கம்.