-
PacBio-முழு நீள 16S/18S/ITS ஆம்ப்ளிகான் வரிசைமுறை
ஆம்ப்ளிகான் (16S/18S/ITS) தளம், நுண்ணுயிர் பன்முகத்தன்மை திட்ட பகுப்பாய்வில் பல வருட அனுபவத்துடன் உருவாக்கப்பட்டது, இதில் தரப்படுத்தப்பட்ட அடிப்படை பகுப்பாய்வு மற்றும் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வு ஆகியவை அடங்கும்: அடிப்படை பகுப்பாய்வு தற்போதைய நுண்ணுயிர் ஆராய்ச்சியின் முக்கிய பகுப்பாய்வு உள்ளடக்கத்தை உள்ளடக்கியது, பகுப்பாய்வு உள்ளடக்கம் வளமானது மற்றும் விரிவானது, மேலும் பகுப்பாய்வு முடிவுகள் திட்ட அறிக்கைகளின் வடிவத்தில் வழங்கப்படுகின்றன; தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வின் உள்ளடக்கம் வேறுபட்டது. மாதிரிகளைத் தேர்ந்தெடுக்கலாம் மற்றும் அடிப்படை பகுப்பாய்வு அறிக்கை மற்றும் ஆராய்ச்சி நோக்கத்திற்கு ஏற்ப அளவுருக்களை நெகிழ்வாக அமைக்கலாம், தனிப்பயனாக்கப்பட்ட தேவைகளை உணரலாம். விண்டோஸ் இயக்க முறைமை, எளிமையானது மற்றும் வேகமானது.
-
PacBio-முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் (குறிப்பு அல்லாதது)
பசிபிக் பயோசயின்சஸ் (பேக்பயோ) ஐசோஃபார்ம் வரிசைமுறை தரவை உள்ளீடாக எடுத்துக் கொண்டு, இந்த செயலி முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்ட் வரிசைமுறைகளை (அசெம்பிளி இல்லாமல்) அடையாளம் காண முடியும். குறிப்பு மரபணுவுக்கு எதிராக முழு நீள வரிசைமுறைகளை மேப்பிங் செய்வதன் மூலம், அறியப்பட்ட மரபணுக்கள், டிரான்ஸ்கிரிப்டுகள், குறியீட்டு பகுதிகள் போன்றவற்றால் டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களை மேம்படுத்தலாம். இந்த விஷயத்தில், மாற்று ஸ்ப்ளிசிங் போன்ற mRNA கட்டமைப்புகளின் மிகவும் துல்லியமான அடையாளத்தை அடைய முடியும். NGS டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை தரவுகளுடன் கூட்டு பகுப்பாய்வு, டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மட்டத்தில் வெளிப்பாட்டில் மிகவும் விரிவான குறிப்பு மற்றும் மிகவும் துல்லியமான அளவீட்டை செயல்படுத்துகிறது, இது பெரும்பாலும் கீழ்நிலை வேறுபாடு வெளிப்பாடு மற்றும் செயல்பாட்டு பகுப்பாய்விற்கு பயனளிக்கிறது.
-
கருவித்தொகுப்புகள்
BMKCloud என்பது மரபணு திட்டங்களுக்கு ஒரே இடத்தில் தீர்வை வழங்கும் ஒரு முன்னணி உயிரித் தகவல் தளமாகும், இது மருத்துவம், வேளாண்மை, சுற்றுச்சூழல் போன்ற பல்வேறு துறைகளில் ஆராய்ச்சியாளர்களால் பரவலாக நம்பப்படுகிறது. உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வு தளங்கள் மற்றும் கருவிகள், கணினி வளங்கள், பொது தரவுத்தளம், உயிரித் தகவல் ஆன்லைன் படிப்புகள் உள்ளிட்ட ஒருங்கிணைந்த, நம்பகமான மற்றும் திறமையான சேவைகளை வழங்க BMKCloud உறுதிபூண்டுள்ளது. BMKCloud மரபணு குறிப்பு, பரிணாம மரபணு கருவிகள், ncRNA, தரவு தரக் கட்டுப்பாடு, அசெம்பிளி, சீரமைப்பு, தரவு பிரித்தெடுத்தல், பிறழ்வுகள், புள்ளிவிவரங்கள், உருவ ஜெனரேட்டர், வரிசை பகுப்பாய்வு போன்ற பல்வேறு அடிக்கடி பயன்படுத்தப்படும் உயிரித் தகவல் கருவிகளைக் கொண்டுள்ளது.
-
சிறிய ஆர்.என்.ஏ.
சிறிய RNAக்கள், miRNA, siRNA மற்றும் piRNA உட்பட, சராசரியாக 18-30 nt நீளம் கொண்ட குறுகிய குறியீட்டு முறையற்ற RNA வகையைச் சேர்ந்தவை. இந்த சிறிய RNAக்கள் mRNA சிதைவு, மொழிபெயர்ப்புத் தடுப்பு, ஹெட்டோரோக்ரோமாடின் உருவாக்கம் போன்ற பல்வேறு உயிரியல் செயல்முறைகளில் ஈடுபடுவதாக பெருமளவில் தெரிவிக்கப்பட்டுள்ளது. விலங்கு/தாவர வளர்ச்சி, நோய், வைரஸ் போன்றவற்றின் மீதான ஆய்வுகளில் SmallRNA வரிசைமுறை பகுப்பாய்வு பரவலாகப் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளது. சிறிய RNA வரிசைமுறை பகுப்பாய்வு தளம் நிலையான பகுப்பாய்வு மற்றும் மேம்பட்ட தரவுச் செயலாக்கத்தைக் கொண்டுள்ளது. RNA-seq தரவின் அடிப்படையில், நிலையான பகுப்பாய்வு miRNA அடையாளம் மற்றும் கணிப்பு, miRNA இலக்கு மரபணு கணிப்பு, குறிப்பு மற்றும் வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை அடைய முடியும். மேம்பட்ட பகுப்பாய்வு தனிப்பயனாக்கப்பட்ட miRNA தேடல் மற்றும் பிரித்தெடுத்தல், வென் வரைபட உருவாக்கம், miRNA மற்றும் இலக்கு மரபணு வலையமைப்பை உருவாக்குதல் ஆகியவற்றை செயல்படுத்துகிறது.
-
NGS-WGS (இலுமினா/BGI)
NGS-WGS என்பது ஒரு முழு மரபணு மறு வரிசைமுறை பகுப்பாய்வு தளமாகும், இது பயோமார்க்கர் தொழில்நுட்பங்களில் சிறந்த அனுபவத்தின் அடிப்படையில் உருவாக்கப்பட்டது. பயன்படுத்த எளிதான இந்த தளம், இல்லுமினா தளம் மற்றும் BGI வரிசைமுறை தளம் இரண்டிலிருந்தும் உருவாக்கப்படும் DNA வரிசைமுறை தரவுகளுக்கு பொருந்தக்கூடிய சில அடிப்படை அளவுருக்களை அமைப்பதன் மூலம் ஒருங்கிணைந்த பகுப்பாய்வு பணிப்பாய்வை விரைவாக சமர்ப்பிக்க அனுமதிக்கிறது. இந்த தளம் உயர் செயல்திறன் கொண்ட கணினி சேவையகத்தில் பயன்படுத்தப்படுகிறது, இது மிகக் குறைந்த நேரத்தில் மிகவும் திறமையான தரவு பகுப்பாய்வை செயல்படுத்துகிறது. மாற்றப்பட்ட மரபணு வினவல், PCR ப்ரைமர் வடிவமைப்பு போன்ற நிலையான பகுப்பாய்வின் அடிப்படையில் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட தரவுச் செயலாக்கம் கிடைக்கிறது.
-
mRNA(குறிப்பு)
மரபணு மரபணு தகவல்களுக்கும் உயிரியல் செயல்பாட்டின் புரோட்டியோமுக்கும் இடையிலான இணைப்பாக டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் உள்ளது. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் நிலை ஒழுங்குமுறை என்பது உயிரினங்களின் மிக முக்கியமான மற்றும் மிகவும் பரவலாக ஆய்வு செய்யப்பட்ட ஒழுங்குமுறை முறையாகும். டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை என்பது எந்த நேரத்திலும் அல்லது எந்த நிலையிலும், ஒரு ஒற்றை நியூக்ளியோடைடுக்கு துல்லியமான தெளிவுத்திறனுடன் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமை வரிசைப்படுத்த முடியும். இது மரபணு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் அளவை மாறும் வகையில் பிரதிபலிக்க முடியும், ஒரே நேரத்தில் அரிதான மற்றும் சாதாரண டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளை அடையாளம் கண்டு அளவிட முடியும், மேலும் மாதிரி குறிப்பிட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளின் கட்டமைப்பு தகவல்களை வழங்க முடியும்.
தற்போது, டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை தொழில்நுட்பம் வேளாண்மை, மருத்துவம் மற்றும் விலங்கு மற்றும் தாவர வளர்ச்சி ஒழுங்குமுறை, சுற்றுச்சூழல் தழுவல், நோயெதிர்ப்பு தொடர்பு, மரபணு உள்ளூர்மயமாக்கல், இனங்கள் மரபணு பரிணாமம் மற்றும் கட்டி மற்றும் மரபணு நோய் கண்டறிதல் உள்ளிட்ட பிற ஆராய்ச்சித் துறைகளில் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
-
மெட்டஜெனோமிக்ஸ் (NGS)
இந்த பகுப்பாய்வு தளம் பல வருட அனுபவத்தின் அடிப்படையில் ஷாட்கன் மெட்டாஜெனோமிக் தரவு பகுப்பாய்விற்காக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. இது தரவு செயலாக்கம், இனங்கள்-நிலை ஆய்வுகள், மரபணு செயல்பாடு-நிலை ஆய்வுகள், மெட்டாஜெனோம் பின்னிங் போன்ற பொதுவாகத் தேவைப்படும் பல்வேறு மெட்டாஜெனோமிக்ஸ் பகுப்பாய்வுகளைக் கொண்ட ஒருங்கிணைந்த பணிப்பாய்வைக் கொண்டுள்ளது. கூடுதலாக, மரபணு மற்றும் இனங்கள் வினவல், அளவுரு அமைப்பு, தனிப்பயனாக்கப்பட்ட உருவ உருவாக்கம் போன்ற நிலையான பகுப்பாய்வு பணிப்பாய்வில் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட தரவுச் செயலாக்க கருவிகள் கிடைக்கின்றன.
-
எல்என்சிஆர்என்ஏ
நீண்ட குறியீட்டு முறையற்ற RNAக்கள் (lncRNA) என்பது 200 nt க்கும் அதிகமான நீளம் கொண்ட ஒரு வகை டிரான்ஸ்கிரிப்டுகள் ஆகும், இவை புரதங்களை குறியிட இயலாதவை. பெரும்பாலான lncRNAகள் செயல்பாட்டுடன் இருக்க அதிக வாய்ப்புள்ளது என்பதை திரட்டப்பட்ட சான்றுகள் தெரிவிக்கின்றன. உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறை தொழில்நுட்பங்கள் மற்றும் உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வு கருவிகள் lncRNA வரிசைமுறைகள் மற்றும் நிலைப்படுத்தல் தகவல்களை மிகவும் திறமையாக வெளிப்படுத்தவும், முக்கியமான ஒழுங்குமுறை செயல்பாடுகளுடன் lncRNAகளைக் கண்டறியவும் எங்களுக்கு அதிகாரம் அளிக்கின்றன. வேகமான, நம்பகமான மற்றும் நெகிழ்வான lncRNA பகுப்பாய்வை அடைய எங்கள் வாடிக்கையாளர்களுக்கு lncRNA வரிசைமுறை பகுப்பாய்வு தளத்தை வழங்குவதில் BMKCloud பெருமை கொள்கிறது.
-
குவாஸ்
மரபணு-அளவிலான தொடர்பு ஆய்வு (GWAS), குறிப்பிட்ட பண்புகளுடன் (பினோடைப்) தொடர்புடைய மரபணு மாறுபாடுகளை (மரபணு வகை) அடையாளம் காண்பதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது. GWA ஆய்வுகள், அதிக எண்ணிக்கையிலான தனிநபர்களின் முழு மரபணுவையும் கடக்கும் மரபணு குறிப்பான்களை ஆராய்கின்றன மற்றும் மக்கள்தொகை மட்டத்தில் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வு மூலம் மரபணு-பினோடைப் தொடர்புகளை கணிக்கின்றன. முழு-மரபணு ஒத்திசைவு அனைத்து மரபணு மாறுபாடுகளையும் கண்டறிய முடியும். பினோடைபிக் தரவுகளுடன் இணைந்து, நவீன விலங்கு/தாவர இனப்பெருக்கத்தை வலுவாக ஆதரிக்கும் பினோடைப் தொடர்பான SNPகள், QTLகள் மற்றும் வேட்பாளர் மரபணுக்களை அடையாளம் காண GWAS ஐ செயலாக்க முடியும். SLAF என்பது சுயமாக உருவாக்கப்பட்ட எளிமைப்படுத்தப்பட்ட மரபணு வரிசைமுறை உத்தி ஆகும், இது மரபணு-அளவிலான விநியோகிக்கப்பட்ட குறிப்பான்கள், SNP ஐக் கண்டுபிடிக்கிறது. இந்த SNPகள், மூலக்கூறு மரபணு குறிப்பான்களாக, இலக்கு பண்புகளுடன் தொடர்பு ஆய்வுகளுக்கு செயலாக்கப்படலாம். மரபணு மாறுபாடுகளுடன் தொடர்புடைய சிக்கலான பண்புகளை அடையாளம் காண்பதில் இது ஒரு செலவு குறைந்த உத்தியாகும்.
-
நானோபோர் முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸ்
உயிரினங்களில் உள்ள சிக்கலான மற்றும் மாறக்கூடிய மாற்று ஐசோஃபார்ம்கள் மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் புரத பன்முகத்தன்மையை ஒழுங்குபடுத்துவதற்கான முக்கியமான மரபணு வழிமுறைகளாகும். டிரான்ஸ்கிரிப்ட் கட்டமைப்புகளை துல்லியமாக அடையாளம் காண்பது மரபணு வெளிப்பாடு ஒழுங்குமுறை வடிவங்களின் ஆழமான ஆய்வுக்கு அடிப்படையாகும். நானோபோர் வரிசைமுறை தளம் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக் ஆய்வை ஐசோஃபார்ம்-நிலைக்கு வெற்றிகரமாக கொண்டு வந்துள்ளது. இந்த பகுப்பாய்வு தளம் நானோபோர் தளத்தில் உருவாக்கப்பட்ட RNA-Seq தரவை குறிப்பு மரபணுவின் அடிப்படையில் பகுப்பாய்வு செய்ய வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது, இது மரபணு நிலை மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் நிலை இரண்டிலும் தரமான மற்றும் அளவு பகுப்பாய்வுகளை அடைகிறது.
-
சர்க்-ஆர்.என்.ஏ.
வட்ட ஆர்.என்.ஏ (circRNA) என்பது குறியீட்டு முறையற்ற ஆர்.என்.ஏ வகையைச் சேர்ந்தது, இது சமீபத்தில் வளர்ச்சி, சுற்றுச்சூழல் எதிர்ப்பு போன்றவற்றில் ஈடுபட்டுள்ள ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளில் முக்கிய பங்கு வகிப்பதாகக் கண்டறியப்பட்டுள்ளது. நேரியல் ஆர்.என்.ஏ மூலக்கூறுகளிலிருந்து வேறுபட்டது, எ.கா. எம்.ஆர்.என்.ஏ, எல்.என்.சி.ஆர்.என்.ஏ, சி.ஆர்.என்.ஏவின் 3′ மற்றும் 5′ முனைகள் ஒன்றாக இணைக்கப்பட்டு ஒரு வட்ட அமைப்பை உருவாக்குகின்றன, அவை எக்ஸோநியூக்லீஸின் செரிமானத்திலிருந்து அவற்றைக் காப்பாற்றுகின்றன மற்றும் பெரும்பாலான நேரியல் ஆர்.என்.ஏவை விட நிலையானவை. மரபணு வெளிப்பாட்டை ஒழுங்குபடுத்துவதில் சி.ஆர்.என்.ஏ பல்வேறு செயல்பாடுகளைக் கொண்டிருப்பதாகக் கண்டறியப்பட்டுள்ளது. சி.ஆர்.என்.ஏ ceRNA ஆக செயல்பட முடியும், இது மை.ஆர்.என்.ஏவை போட்டித்தன்மையுடன் பிணைக்கிறது, இது மை.ஆர்.என்.ஏ கடற்பாசி என்று அழைக்கப்படுகிறது. சி.ஆர்.என்.ஏ வரிசைமுறை பகுப்பாய்வு தளம் சி.ஆர்.என்.ஏ கட்டமைப்பு மற்றும் வெளிப்பாடு பகுப்பாய்வு, இலக்கு கணிப்பு மற்றும் பிற வகையான ஆர்.என்.ஏ மூலக்கூறுகளுடன் கூட்டு பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை மேம்படுத்துகிறது.
-
பி.எஸ்.ஏ.
பல்க்டு செக்ரிகண்ட் பகுப்பாய்வு தளம் ஒரு-படி நிலையான பகுப்பாய்வு மற்றும் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட அளவுரு அமைப்புடன் மேம்பட்ட பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளது. BSA என்பது பினோடைப் தொடர்புடைய மரபணு குறிப்பான்களை விரைவாக அடையாளம் காணப் பயன்படுத்தப்படும் ஒரு நுட்பமாகும். BSA இன் முக்கிய பணிப்பாய்வு பின்வருவனவற்றைக் கொண்டுள்ளது: 1. மிகவும் எதிர்க்கும் பினோடைப்களைக் கொண்ட இரண்டு குழுக்களின் தனிநபர்களைத் தேர்ந்தெடுப்பது; 2. அனைத்து தனிநபர்களின் DNA, RNA அல்லது SLAF-seq (பயோமார்க்கரால் உருவாக்கப்பட்டது) ஆகியவற்றை இரண்டு மொத்த DNA ஐ உருவாக்க ஒன்றிணைத்தல்; 3. குறிப்பு மரபணுவுக்கு எதிராக அல்லது இடையில் வேறுபட்ட வரிசைகளை அடையாளம் காணுதல், 4. ED மற்றும் SNP-குறியீட்டு வழிமுறை மூலம் வேட்பாளர் இணைக்கப்பட்ட பகுதிகளை கணித்தல்; 5. வேட்பாளர் பகுதிகளில் செயல்பாட்டு பகுப்பாய்வு மற்றும் செறிவூட்டல் போன்றவை. மரபணு மார்க்கர் ஸ்கிரீனிங் மற்றும் ப்ரைமர் வடிவமைப்பு உள்ளிட்ட தரவுகளில் மேம்பட்ட சுரங்கமும் கிடைக்கிறது.
-
ஆம்ப்ளிகான் (16S/18S/ITS)
ஆம்ப்ளிகான் (16S/18S/ITS) தளம், நுண்ணுயிர் பன்முகத்தன்மை திட்ட பகுப்பாய்வில் பல வருட அனுபவத்துடன் உருவாக்கப்பட்டது, இதில் தரப்படுத்தப்பட்ட அடிப்படை பகுப்பாய்வு மற்றும் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வு ஆகியவை அடங்கும்: அடிப்படை பகுப்பாய்வு தற்போதைய நுண்ணுயிர் ஆராய்ச்சியின் முக்கிய பகுப்பாய்வு உள்ளடக்கத்தை உள்ளடக்கியது, பகுப்பாய்வு உள்ளடக்கம் வளமானது மற்றும் விரிவானது, மேலும் பகுப்பாய்வு முடிவுகள் திட்ட அறிக்கைகளின் வடிவத்தில் வழங்கப்படுகின்றன; தனிப்பயனாக்கப்பட்ட பகுப்பாய்வின் உள்ளடக்கம் வேறுபட்டது. மாதிரிகளைத் தேர்ந்தெடுக்கலாம் மற்றும் அடிப்படை பகுப்பாய்வு அறிக்கை மற்றும் ஆராய்ச்சி நோக்கத்திற்கு ஏற்ப அளவுருக்களை நெகிழ்வாக அமைக்கலாம், தனிப்பயனாக்கப்பட்ட தேவைகளை உணரலாம். விண்டோஸ் இயக்க முறைமை, எளிமையானது மற்றும் வேகமானது.
