குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவ பைசல்பைட் வரிசைமுறை (RRBS)
குறைக்கப்பட்ட பிரதிநிதித்துவ பைசல்பைட் வரிசைமுறைப்படுத்தல் (RRBS) முறையானது, MspI பிளவு மூலம் CpG தீவுகள் நிறைந்த பகுதிகளைச் செறிவூட்டுவதையும், அதைத் தொடர்ந்து 200-500/600 bps துண்டுகளின் அளவுத் தேர்வையும் சார்ந்துள்ளது. இதன் விளைவாக, CpG தீவுகளுக்கு அருகிலுள்ள பகுதிகள் மட்டுமே வரிசைப்படுத்தப்படுகின்றன, அதே சமயம் தொலைவில் உள்ள CpG தீவுகளைக் கொண்ட பகுதிகள் பகுப்பாய்விலிருந்து விலக்கப்படுகின்றன. இந்த செயல்முறை, பைசல்பைட் வரிசைமுறைப்படுத்தலுடன் இணைந்து, டிஎன்ஏ மெத்திலேஷனை உயர்-தெளிவுத்திறனுடன் கண்டறிய அனுமதிக்கிறது. மேலும், PE150 என்ற வரிசைமுறைப்படுத்தல் அணுகுமுறையானது, செருகல்களின் நடுப்பகுதியை விட அவற்றின் முனைகளில் குறிப்பாக கவனம் செலுத்துவதால், மெத்திலேஷன் விவரக்குறிப்பின் செயல்திறனை அதிகரிக்கிறது.
டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன் ஆராய்ச்சியில், முழு மரபணு பைசல்பைட் வரிசைமுறைக்கு (WGBS) ஒரு செலவு குறைந்த மற்றும் திறமையான மாற்றாக இந்த நுட்பம் உருவெடுத்துள்ளது. WGBS முழு மரபணுவையும் ஒற்றை அடிப்படைத் துல்லியத்தில் ஆராய்வதன் மூலம் விரிவான நுண்ணறிவுகளை வழங்கினாலும், அதன் அதிக செலவு ஒரு வரம்புக்குட்பட்ட காரணியாக இருக்கலாம். ஆனால், RRBS மரபணுவின் ஒரு பிரதிநிதித்துவப் பகுதியைத் தேர்ந்தெடுத்துப் பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம் இந்தச் சவாலைத் திறமையாகத் தணிக்கிறது. இந்த வழிமுறை, செலவு குறைந்த டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன் ஆராய்ச்சியைச் சாத்தியமாக்கி, எபிஜெனெடிக் வழிமுறைகள் குறித்த அறிவை மேம்படுத்தும் ஒரு விலைமதிப்பற்ற கருவியாகும்.
சேவை அம்சங்கள்
● இல்லுமினா நோவாசீக்-இல் வரிசைப்படுத்துதல்.
● ஒரு குறிப்பு மரபணுத்தொகுதி தேவைப்படுகிறது.
● பைசல்பைட் மாற்றத் திறனைக் கண்காணிக்க லாம்ப்டா டிஎன்ஏ பயன்படுத்தப்படுகிறது.
● MspI செரிமானத் திறனும் கண்காணிக்கப்படுகிறது.
● தாவர மாதிரிகளுக்கான இரட்டை நொதி செரிமானம்.
சேவை நன்மைகள்
●WGBS-க்கு செலவு குறைந்த மற்றும் திறமையான மாற்றுஇது குறைந்த செலவிலும் குறைந்த மாதிரித் தேவைகளுடனும் பகுப்பாய்வை மேற்கொள்ள உதவுகிறது.
●முழுமையான தளம்:மாதிரி செயலாக்கம், லைப்ரரி உருவாக்கம், வரிசைப்படுத்துதல் முதல் பயோஇன்ஃபர்மேட்டிக்ஸ் பகுப்பாய்வு வரை அனைத்து வகையான சிறந்த சேவைகளையும் நாங்கள் ஒரே இடத்தில் வழங்குகிறோம்.
●விரிவான நிபுணத்துவம்நாங்கள் பலதரப்பட்ட உயிரினங்களில் வெற்றி காண்கிறோம். BMKGENE, ஒரு தசாப்தத்திற்கும் மேலான அனுபவம், உயர் திறன்கொண்ட பகுப்பாய்வுக் குழு, விரிவான உள்ளடக்கம் மற்றும் சிறந்த விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவு ஆகியவற்றை வழங்குகிறது.
சேவை விவரக்குறிப்புகள்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு வெளியீடு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| MspI செரிமானம் செய்யப்பட்டு பைசல்பைட் சிகிச்சை அளிக்கப்பட்ட நூலகம் | இல்லுமினா PE150 | 8 ஜிபி | Q30 ≥ 85% பைசல்பைட் மாற்றம் > 99% MspI வெட்டும் திறன் > 95% |
மாதிரி தேவைகள்
| செறிவு (ng/µL) | மொத்த அளவு (µg) |
| |
| மரபணு டிஎன்ஏ | ≥ 30 | ≥ 1 | வரையறுக்கப்பட்ட சிதைவு அல்லது மாசுபாடு |
சேவை பணிப்பாய்வு
மாதிரி விநியோகம்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
BI பகுப்பாய்வில் பின்வருவன அடங்கும்:
● மூல வரிசைப்படுத்தல் தரக் கட்டுப்பாடு;
● மூல மரபணுத்தொகுதியுடன் பொருத்துதல்;
● 5mC மெத்திலேட்டட் பேஸ்களைக் கண்டறிதல் மற்றும் மோட்டிஃப் அடையாளப்படுத்துதல்;
● மெத்திலேஷன் பரவலின் பகுப்பாய்வு மற்றும் மாதிரி ஒப்பீடு;
● வேறுபட்ட மெத்திலேற்றம் செய்யப்பட்ட பகுதிகளின் (DMRs) பகுப்பாய்வு;
● DMR-களுடன் தொடர்புடைய மரபணுக்களின் செயல்பாட்டு விளக்கவுரை.
தரக் கட்டுப்பாடு: செரிமானத் திறன் (மரபணு வரைபடத்தில்)
தரக் கட்டுப்பாடு: பைசல்பைட் மாற்றம் (மெத்திலேஷன் தகவல் பிரித்தெடுத்தலில்)
மெத்திலேஷன் வரைபடம்: 5mC மெத்திலேஷனின் மரபணுத்தொகுதி முழுவதுமான பரவல்
மாதிரி ஒப்பீடு: முதன்மை கூறு பகுப்பாய்வு
வேறுபட்ட மெத்திலேற்றப்பட்ட பகுதிகள் (DMRs) பகுப்பாய்வு: வெப்ப வரைபடம்
BMKGene-இன் முழு மரபணு பைசல்பைட் வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட ஆராய்ச்சி முன்னேற்றங்களை, கவனமாகத் தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் அறிந்துகொள்ளுங்கள்.
லி, இசட். மற்றும் பலர் (2022) 'CRISPR செயல்படுத்தல் மற்றும் பாராக்ரைன் காரணிகள் மூலம் லேடிக் போன்ற செல்களாக உயர்-துல்லியமான மறு நிரலாக்கம்',PNAS நெக்ஸஸ், 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
தியான், எச். மற்றும் பலர் (2023) 'சீன ஒற்றைக்கரு இரட்டையர்களின் உடல் அமைப்பின் மரபணு முழுமையான டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன் பகுப்பாய்வு',ஐரோப்பிய மருத்துவ ஆய்வு இதழ், 53(11), பக். e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
வு, ஒய். மற்றும் பலர். (2022) 'டிஎன்ஏ மெத்திலேஷன் மற்றும் இடுப்பு-இடுப்பு விகிதம்: சீன ஒற்றைக்கரு இரட்டையர்களில் ஒரு எபிஜீனோம்-பரந்த தொடர்பு ஆய்வு',எண்டோகிரைனாலஜிக்கல் இன்வெஸ்டிகேஷன் இதழ், 45(12), பக். 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
